空间分析和附近要素的聚类


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我正在研究群体动物的行为,并且对标记行为如何受到邻近群体的某些特征的影响感兴趣。我从使用a-LoCoH创建的95%密度等值线绘制了每个组的区域。将一组中每个人的标记绘制为单独的点层。标记行为似乎不是随机的,它们似乎聚集在与相邻组的边界周围。我想调查一下个人在某些团体附近的标记是否比在其他团体附近的标记多,例如,个人在邻近团体之间的标记较少吗?是否有可能表明点聚集在某些要素附近而不是其他要素附近?

可以提供的任何帮助将不胜感激,

戴夫·汉弗莱斯

#####更新

为了演示,下面是四个区域(A,B,C和D)的图像以及A组中两个人的标记位置。A和B组密切相关。C组和D组与A组无关。

在此处输入图片说明


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您可以提供样本数据吗?
om_henners 2013年

抱歉,我是堆栈交换的新手-对于GIS,提供样本数据的标准格式是什么?ArcMap文件?
戴夫·汉弗莱斯

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样本数据应以许多GIS系统都可以读取的开放GIS格式发布。
markusN

其中涉及的一些文件是shapefile,据我了解,目前尚无法在SE上共享这些类型的文件。我很乐意通过电子邮件提供示例:david.humphries@mq.edu.au
Dave Humphries

我在考虑这个问题时(休假)的另一个问题是-a-LoCoH边界是由相同的标记数据集还是完全由不同的数据集产生的?另外,您正在使用哪种软件(并且可以访问)?
om_henners 2013年

Answers:


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我强烈建议您看一下R,特别是CSRIO的spatstat包。有一本由Adrian Baddeley教授撰写的极好的手册/教程,它将带您通过各种不同的方法进行点模式分析。特别是,我将看一下第七部分:标记的点模式(特别是第202页的标记相关函数)。此处的注释标记是指按属性分类的数据,而不具有数字关系。

在文档的开头还有一章关于读取数据(使用rgdalsp等)。如果您使用的是ArcGIS,那么我将把地理空间建​​模环境作为一种在R和ArcGIS之间进行链接的方式,否则QGIS的manageR也可以做到这一点。

最后,在GIS SE上,@ whuber(还有许多其他功能)在R中具有丰富的经验,因此在发现问题时提出问题,或者尝试与他聊天。


非常感谢您的建议。我将尝试spatstat程序包,看看如何进行。
戴夫·汉弗莱斯
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