使用R读取文件地理数据库？

文件地理数据库（fgdb）包含许多文件地理数据库表。据我所知，它们以dbf文件形式存在，但是在内Database.gdb。

在ArcCatalog中，文件路径类似于C:\Users\...\Database.gdb\Stats_AA。

如何将所有这些dbf文件读入R（统计软件）？正确的供应途径是什么？使用的函数是read.dbf（在外部软件包中）。

的变体

test<-read.dbf(file="C:/Users..Database.gdb/Stats_AA.dbf")

和

test<-read.dbf(file="C:/Users..Database/Stats_AA.dbf")

不工作要使用的文件名的正确“形式”是什么，或者，我是否需要将所有文件地理数据库表导出到其他形式或位置？

r file-geodatabase

— 楠
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地理数据库将几何存储在blob字段中，而不是dbf中（但shapefile确实）。

— Mapperz

我本来建议对文件地理数据库使用Esri的oledb提供程序，但是似乎R无法读取oledb。可能想支持这个问题，还有这个问题。

— Kirk Kuykendall

Answers:

一个简单的解决方案是使用Table to dBase（多个）导出表（右键单击FGDB> Export> To dBase（多个）。也可以使用此工具导出FGDB要素类中包含的属性表。和/或要素类进入工具并指定一个输出文件夹，当然，您可以使用R循环浏览包含新dBase文件的文件夹。

在此处输入图片说明

— 亚伦
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此方法有效-我的下拉菜单看起来不一样（对不起，我对ArcMap文件系统不完全了解），但是我发现可以通过右键单击目录中的表项本身来导出表，并且生成一个可读的.dbf文件。谢谢！

— 南

文件地理数据库不像dbf那样存储其数据，shapefile则存储。FGDB使用自己的内部存储方法。

ESRI发布了一个API，如果使用它来编译具有文件地理数据库支持的GDAL，则您可以使用R的gdal插件以这种方式访问您的数据。但是，最简单的解决方案可能是将数据转换为shapefile，然后可以使用R的dbf工具。

— 嘿那边
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或者只是将属性表导出为dbf，而不是转换整个要素类。

— 巴尔托克

哦，是真的！您也可以使用Xtools工具栏将属性表直接导出到Excel。工具栏的免费版本包括Excel导出功能。 xtoolspro.com

— HeyOverThere

@HeyOverThere-感谢您指出，您是正确的-这些表是“文件地理数据库表”，它解释了为什么我找不到它们为.dbf文件的原因。我将使用Aaron的导出方法，但是，将我的所有数据转换为shapefile会更加耗时。

— 南

API链接似乎已失效。你能更新一下吗？

— 亚伦

看起来ESRI做了一些大扫除。链接已更新为指向新位置

— HeyOverThere 2015年

我遇到了同样的问题。我认为使用ArcMap不方便。相反，我使用以下代码从R调用了python。不幸的是，它要求您拥有Arcpy。

Python脚本：

import os,sys
import arcpy
from arcpy import env
from sys import argv ### This is needed to import variables

script, featureClass, inFeatures, outLocation, outFeatureClass = argv
env.workspace = featureClass ### set working directory
arcpy.FeatureClassToFeatureClass_conversion(inFeatures, outLocation,outFeatureClass)

R代码：

script = "./Path To Python Script/Example.py"
featureClass = './Path To Geodatabase/Example.gdb'
inFeatures = "featureClass"
outLocation = "./Path To Outfile Location"
outFeatureClass = "test.shp"
system2('python', args = c(shQuote(script),shQuote(featureClass),shQuote(inFeatures),shQuote(outLocation),shQuote(outFeatureClass)))

上面的代码将从地理数据库输出一个shapefile，然后您必须将其导入R。

— 用户名
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