如何使用R中的多边形图层执行多边形图层的真实GIS剪辑?


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我想使用一系列单边界多边形在土壤多边形的R中创建一个真正的GIS剪辑,但是我找不到能够正确执行此操作的R函数。它应该像clipESRI的ArcMap中的功能一样工作。我已经尝试过该over方法在sp包中,但它似乎不适用于多边形而不是多边形。

一种建议是使用以下代码将gIntersectionin rgeos包用作剪辑:

#------------------------------------
library(rgeos)
library(maptools)

#Read layers as SpatialPolygonsDataFrame (both the same Albers projection)
Soils_poly = readShapePoly("Soils_polygons")  #Note - Has 400 polygons
clipper_poly = readShapePoly("clipper_polygon")  #Note - Has 1 polygon

#Try gintersection as clip 
Clipped_polys = gIntersection(Clipper_Tile_poly, Soils_poly)

#-----------------------------------

这需要5分钟才能运行(速度太慢),并且会出现以下错误:

RGEOSBinTopoFunc中的错误(spgeom1,spgeom2,byid,id,drop_not_poly,“ rgeos_intersection”):TopologyException:在-721459.77681285271 2009506.5980877089中找不到传出的dirEdge

我还尝试了以下代码来检查是否重叠:

gIntersects(Clipper_Tile_poly, Soils_poly)

结果为TRUE。clipESRI ArcMap中的函数对此数据可以正常工作。

有人知道R函数可以使用空间多边形对空间多边形进行适当的剪辑吗?


尝试使用byid = TRUE的gIntersection(我认为对于某些剪辑来说,悬空的拓扑存在问题,有时这样做会有所帮助),以便快速查看gUnarySTRtreeQuery()或gBinarySTRtreeQuery()来识别多边形对的相交边界框,并且仅相交那些对。所有这些afaik都没有简单的高级包装器
mdsumner 2014年

Answers:


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@mdsummer提供的使用提示byid=TRUE可以正确工作。

请参见下面的可复制示例:

library(rgeos)
library(sp)

#Create SpatialPlygons objects
polygon1 <- readWKT("POLYGON((-190 -50, -200 -10, -110 20, -190 -50))") #polygon 1
polygon2 <- readWKT("POLYGON((-180 -20, -140 55, 10 0, -140 -60, -180 -20))") #polygon 2

par(mfrow = c(1,2)) #in separate windows
plot(polygon1, main = "Polygon1") #window 1
plot(polygon2, main = "Polygon2") #window 2

多边形并排

polygon_set <- readWKT(paste("POLYGON((-180 -20, -140 55, 10 0, -140 -60, -180 -20),",
                     "(-190 -50, -200 -10, -110 20, -190 -50))"))

par(mfrow = c(1,1)) #now, simultaneously
plot(polygon_set, main = "Polygon1 & Polygon2")

在此处输入图片说明

clip <- gIntersection(polygon1, polygon2, byid = TRUE, drop_lower_td = TRUE) #clip polygon 2 with polygon 1
plot(clip, col = "lightblue")

在此处输入图片说明

GT <- GridTopology(c(-175, -85), c(10, 10), c(36, 18))
gr <- as(as(SpatialGrid(GT), "SpatialPixels"), "SpatialPolygons")
plot(gr)

在此处输入图片说明

clip2 <- gIntersection(clip, gr, byid = TRUE, drop_lower_td = TRUE)
plot(clip2, col = "pink")

在此处输入图片说明


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实现梦想-令人难以置信的快速。我正在使用它来剪辑折线。我想为英国河流制作shapefile的子集,因为使用较小的数据子集要快得多。
CJB

1
@AndreSilva,以为我有,但猜想我没有!关于:社区,我希望R GIS开发人员社区更大一些。我可能不得不依靠ArcMap进行一些数字化以及GUI中快速的其他过程。
Rich Pauloo

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您也可以使用raster包raster::intersect(spdf1, spdf2)。如果您有SpatialPolygonsDataFrame,它具有维护属性的优点。

library(sp); library(rgeos)

coords1 <- matrix(c(-1.841960, -1.823464, -1.838623, -1.841960, 55.663696,
                55.659178, 55.650841, 55.663696), ncol=2)
coords2 <- matrix(c(-1.822606, -1.816790, -1.832712, -1.822606, 55.657887,
                55.646806, 55.650679, 55.657887), ncol=2)
p1 <- Polygon(coords1)
p2 <- Polygon(coords2)
p1 <- Polygons(list(p1), ID = "p1")
p2 <- Polygons(list(p2), ID = "p2")
myPolys <- SpatialPolygons(list(p1, p2))
spdf1 = SpatialPolygonsDataFrame(myPolys, data.frame(variable1 = c(232,
                                                               242), variable2 = c(235, 464), row.names = c("p1", "p2")))
coords1a <- matrix(c(-1.830219, -1.833753, -1.821154, -1.830219, 55.647353,
                 55.656629, 55.652122, 55.647353), ncol=2)
p1a <- Polygon(coords1a)
p1a <- Polygons(list(p1a), ID = "p1a")
myPolys1 <- SpatialPolygons(list(p1a))
spdf2 = SpatialPolygonsDataFrame(myPolys1, data.frame(variable1 = c(2),
                                                  variable2 = c(3), row.names = c("p1a")))

# works but drop the attributes
#gIntersection(spdf1, spdf2, byid=T)

#better to keep attributes
inter1=raster::intersect(spdf1, spdf2)

plot(spdf1, col="red")
plot(spdf2, col="yellow", add=T)
plot(inter1,col="blue", add=T)

在此处输入图片说明

感谢这个问题指出了这一点并提供了示例代码。

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