科学期刊使用哪种软件生成图？

我从《自然》等高级杂志知道，他们重新设计了从作者那里得到的数字。这些图看起来非常专业，但是太复杂了，无法通过Adobe Illustrator等人完成。

发布者使用哪些工具来生成高质量的数字？

不能代表自然，但是我知道一些工作流程：

• 使用Illustrator的图表工具重新创建图表。艰苦的工作和令人沮丧的原因是，自从青铜时代以来，Adobe尚未更新图表工具，但是如果需要基于相似样式的许多非常相似的图表，这在时间上也不是一笔不小的投资。它的功能超出了外观。
• 使用Illustrator可以设置从Excel粘贴的图表的样式，也可以使用研究人员使用的任何样式 -大多数统计数据包都可以导出为.eps或.svg-然后设置矢量的样式并更改文本以适合房屋风格。（请注意，删除Excel图表随附的剪贴蒙版有时会使线和数据点稍微移动）。
• 跟踪图表 -将其绘制为图像，然后在线条上重绘，然后在Illustrator中进行样式设置。我从来不需要这样做，但是我听说这是学术出版中常见的必要弊端。
• 将基于代码的图表/布局工具（例如LaTeX或R）与ggplot2插件一起使用。我对这种方法不太了解，但是它在分析性和非视觉化的人群中都很流行，如果您有耐心的话，能够专业地查看结果，并且由于它设置了基于代码的模板，因此结果非常一致。这是一篇文章，其中包含使用此方法的一些示例-设置R图表的样式，例如“经济学人”，Tableau ...或XKCD
• 用D3之类的代码编写基于Web的图表，然后从Web浏览器中提取SVG输出，然后在Illustrator中打开它并在其中完成打印。纽约时报有时会这样做，我讨论了这个问题以及如何在另一个问题中获得确切的CMYK颜色。
• 使用自定义的图表/可视化工具。Tableau是一个流行的选项，它可以生成外观非常专业的图表以及一些非常复杂的数据。但是，这很昂贵，除非您可以免费公开获取所有数据，在这种情况下，您可以使用免费的Tableau Public。相当多的科学出版物都使用Tableau（无法想到我头上的名字）。WEAVE是一种开放源代码的替代方案，但效果却不尽人意（不知道它输出的是什么，但是如果是SVG，则Illustrator可以对其进行编辑），在这里可以进行更多的介绍。

Matlab和Mathematica是常用的分析工具，可输出2D和3D图。

这里有一些讨论，表明这些工具确实是双头垄断。

不太复杂，无法在Adobe Illustrator中完成（尽管可以尝试---我发现使用FreeHand更快，更高效---优雅）。

可以使用诸如渐近线，Tikz，METAPOST等的工具，也可以使用MatLab或其他计算机代数/图形工具来创建它们。

我是一个大学团队的一员，以改善其他研究人员的情节。我们的团队主要使用Matlab和Illustrator。在某种程度上，Matlab在显示图中的基本元素方面做得更好或更有效，包括添加轴标签，轴刻度线，数据线和数据点。在对图形进行某些改进之后，Illustrator在更改图形元素的特征时会更好地工作。

我相信自然界中的团队（如果有的话）将执行类似的过程。

使用韩服

我刚刚发现了Hanpuku，这是用于数据可视化的一流解决方案。我认为没有什么比这款令人惊叹的软件更好的了！

韩服概况

旧答案

我想使用user568458提到的此选项来描述工作流程：

• 用D3之类的代码编写基于Web的图表，然后从Web浏览器中提取SVG输出，然后在Illustrator中打开它并在其中完成打印。纽约时报有时会这样做，我讨论了这个问题以及如何在另一个问题中获得确切的CMYK颜色。

我已经放弃了Illustrator的青铜时代工具来制作民意测验答案的图表（主要是条形图/柱形图，饼图和折线图）。Illustrator无法处理更正，小的调整或更新的数据-任何修改都会破坏布局。我也无法指定在整个图表集中必须保持恒定的关键尺寸（条形高度，字体大小，最大高度）。

查看JSGraphs.com，在那里比较了大量的JavaScript图形框架，您可以为项目选择最合适的框架。

我还使用python livereload来实现实时代码（实际上是在保存时自动刷新）。它使事情进展得更快！导航到命令提示符/终端中的项目文件夹，然后键入livereload。现在，所有项目文件均已提供，并且可以通过URL进行访问http://localhost:35729/chart-01.html。

学习图表结构，其怪异和局限性需要花费大量的时间，但是一旦构建了最初的几张图表，您就可以将它们用作模板，有时只需插入新数据，就无需进行任何更改。

我的框架将接受CSV文件作为输入，这是通过从.xlsx文件导出获得的。通过更改一行代码即可插入新数据url: 'resources/graph-02.csv'

颜色主题也可以使用JSON文件进行类似的管理。

从这里直到交付CMYK EPSes，大部分工作流程都可以自动化。

根据框架的不同，导出到SVG可能很容易CtrlS。如果将其作为SVG元素嵌入HTML标记中，则可以使用Playfair批量导出它。

justinmanley / playfair：使用d3和PhantomJS从命令行生成图表。。

最初，我只是使用UI自动化工具为文件夹中的每个文件-AutoHotkey或WASP for PowerShell复制了enter-URL-as-enter-next-URL-save-as Monkey-work 。

要将SVG批量转换为CMYK EPS文件，我在Illustrator中进行了操作。