我正在尝试解决一个涉及许多子问题的大数值问题,并且我正在使用Python的多处理模块(特别是Pool.map)将不同的独立子问题分解为不同的核心。每个子问题都涉及计算大量子问题,并且我试图通过将结果存储到文件中(如果尚未通过任何过程对其进行计算)来有效地记住这些结果,否则请跳过计算并仅从文件中读取结果。
我的文件存在并发问题:有时,不同的过程会检查以查看是否已经计算了子子问题(通过查找将结果存储在文件中),没有找到子子问题,运行计算,然后尝试同时将结果写入同一文件。如何避免这样写冲突?
我正在尝试解决一个涉及许多子问题的大数值问题,并且我正在使用Python的多处理模块(特别是Pool.map)将不同的独立子问题分解为不同的核心。每个子问题都涉及计算大量子问题,并且我试图通过将结果存储到文件中(如果尚未通过任何过程对其进行计算)来有效地记住这些结果,否则请跳过计算并仅从文件中读取结果。
我的文件存在并发问题:有时,不同的过程会检查以查看是否已经计算了子子问题(通过查找将结果存储在文件中),没有找到子子问题,运行计算,然后尝试同时将结果写入同一文件。如何避免这样写冲突?
Answers:
@ GP89提到了一个很好的解决方案。使用队列将写入任务发送到对文件具有唯一写访问权的专用进程。其他所有工人均具有只读访问权限。这将消除冲突。这是一个使用apply_async的示例,但它也适用于map:
import multiprocessing as mp
import time
fn = 'c:/temp/temp.txt'
def worker(arg, q):
'''stupidly simulates long running process'''
start = time.clock()
s = 'this is a test'
txt = s
for i in range(200000):
txt += s
done = time.clock() - start
with open(fn, 'rb') as f:
size = len(f.read())
res = 'Process' + str(arg), str(size), done
q.put(res)
return res
def listener(q):
'''listens for messages on the q, writes to file. '''
with open(fn, 'w') as f:
while 1:
m = q.get()
if m == 'kill':
f.write('killed')
break
f.write(str(m) + '\n')
f.flush()
def main():
#must use Manager queue here, or will not work
manager = mp.Manager()
q = manager.Queue()
pool = mp.Pool(mp.cpu_count() + 2)
#put listener to work first
watcher = pool.apply_async(listener, (q,))
#fire off workers
jobs = []
for i in range(80):
job = pool.apply_async(worker, (i, q))
jobs.append(job)
# collect results from the workers through the pool result queue
for job in jobs:
job.get()
#now we are done, kill the listener
q.put('kill')
pool.close()
pool.join()
if __name__ == "__main__":
main()
pool.join()
下面添加一个pool.close()
。否则,我的工作人员将在收听者之前完成,过程将停止。
mp.cpu_count() + 2
设置进程数?
在我看来,您需要用来Manager
将结果临时保存到列表中,然后将列表中的结果写到文件中。另外,用于starmap
传递要处理的对象和托管列表。第一步是构建要传递给的参数starmap
,其中包括托管列表。
from multiprocessing import Manager
from multiprocessing import Pool
import pandas as pd
def worker(row, param):
# do something here and then append it to row
x = param**2
row.append(x)
if __name__ == '__main__':
pool_parameter = [] # list of objects to process
with Manager() as mgr:
row = mgr.list([])
# build list of parameters to send to starmap
for param in pool_parameter:
params.append([row,param])
with Pool() as p:
p.starmap(worker, params)
从这一点上,您需要确定如何处理列表。如果您有大量的RAM和庞大的数据集,请使用熊猫进行串联。然后,您可以非常轻松地将文件另存为csv或pickle。
df = pd.concat(row, ignore_index=True)
df.to_pickle('data.pickle')
df.to_csv('data.csv')
multiprocessing.Lock
用于同步多个进程的示例。