R命令，用于将工作目录设置为Rstudio中的源文件位置

我正在用R编写一些教程。每个R代码都包含在一个特定的文件夹中。那里有数据文件和其他文件。我想打开.r文件并为其提供源，这样就不必更改Rstudio中的工作目录，如下所示：

有没有一种方法可以在R中自动指定我的工作目录。

要获取源脚本的位置，可以使用utils::getSrcDirectory或utils::getSrcFilename。因此，可以使用以下命令将工作目录更改为当前文件的目录：

setwd(getSrcDirectory()[1])

如果您运行代码而不是源代码，则这在RStudio中不起作用。为此，您需要使用rstudioapi::getActiveDocumentContext。

setwd(dirname(rstudioapi::getActiveDocumentContext()$path))

当然，第二种解决方案要求您将RStudio用作IDE。

我知道这个问题已经过时了，但是我也在寻找一个解决方案，Google在最上方列出了这个问题：

this.dir <- dirname(parent.frame(2)$ofile)
setwd(this.dir)

将其放在文件中的某个位置（不过最好以开始），以便根据该文件更改wd。

根据评论，这不一定在所有平台上都可以运行（Windows似乎可以运行，Linux / Mac可以运行）。请记住，此解决方案仅用于“采购”文件，而不必用于在该文件中运行块。

另请参阅获取源文件d的文件名和路径

dirname(rstudioapi::getActiveDocumentContext()$path)

适用于我，但是如果您不想使用rstudioapi并且不属于proyect，则可以在路径中使用符号〜。符号〜表示默认的RStudio工作目录（至少在Windows上）。

如果您的RStudio工作目录为“ D：/ Documents”，setwd("~/proyect1")则与setwd（“ D：/ Documents / proyect1”）相同。

设置完之后，您可以导航到一个子目录：read.csv("DATA/mydata.csv")。与相同read.csv("D:/Documents/proyect1/DATA/mydata.csv")。

如果要导航到父文件夹，可以使用"../"。例如：read.csv("../olddata/DATA/mydata.csv")与read.csv("D:/Documents/oldata/DATA/mydata.csv")

无论您使用哪种计算机，这都是我编写脚本的最佳方法。

这个答案可以帮助：

script.dir <- dirname(sys.frame(1)$ofile)

注意：必须提供脚本才能返回正确的路径

我在以下位置找到了它：https : //support.rstudio.com/hc/communities/public/questions/200895567-can-user-obtain-the-path-of-current-Project-s-directory-

BumbleBee的答案（使用parent.frame而不是sys.frame）对我没有用，我总是遇到错误。

对于rstudio，您可以使用rstudioapi将工作目录自动设置为脚本目录，如下所示：

library(rstudioapi)

# Getting the path of your current open file
current_path = rstudioapi::getActiveDocumentContext()$path 
setwd(dirname(current_path ))
print( getwd() )

运行或源文件时，此方法有效。

您需要先安装软件包rstudioapi。请注意，我打印路径时要确保100％确定我在正确的位置，但这是可选的。

解决方案

dirname(parent.frame(2)$ofile)

不为我工作。

我正在使用蛮力算法，但是可以工作：

File <- "filename"
Files <- list.files(path=file.path("~"),recursive=T,include.dirs=T)
Path.file <- names(unlist(sapply(Files,grep,pattern=File))[1])
Dir.wd <- dirname(Path.file)

搜索目录更容易：

Dirname <- "subdir_name"
Dirs <- list.dirs(path=file.path("~"),recursive=T)
dir_wd <- names(unlist(sapply(Dirs,grep,pattern=Dirname))[1])

如果您使用Linux，则可以尝试以下操作：

setwd(system("pwd", intern = T) )

这个对我有用。

我只是在寻找解决此问题的方法，来到了此页面。我知道它已经过时，但是以前的解决方案对我来说并不令人满意或不起作用。如果有兴趣，这是我的工作。

filename = "your_file.R"
filepath = file.choose()  # browse and select your_file.R in the window
dir = substr(filepath, 1, nchar(filepath)-nchar(filename))
setwd(dir)

我意识到这是一个旧线程，但是我有一个类似的问题，需要设置工作目录，并且无法获得任何适合我的解决方案。这是工作的方法，以防以后其他人偶然发现此问题：

# SET WORKING DIRECTORY TO CURRENT DIRECTORY:
system("pwd=`pwd`; $pwd 2> dummyfile.txt")
dir <- fread("dummyfile.txt")
n<- colnames(dir)[2]
n2 <- substr(n, 1, nchar(n)-1)
setwd(n2)

这有点令人费解，但是基本上，这是使用系统命令来获取工作目录并将其保存到dummyfile.txt，然后R使用data.table :: fread读取该文件。剩下的只是清理打印到文件的内容，这样我只剩下目录路径。

我需要在集群上运行R，因此无法知道我最终位于哪个目录（作业被分配了一个数字和一个计算节点）。这对我有用。

我知道这已经过时了，但是我无法使以前的答案令人满意，因此我想贡献自己的方法，以防其他任何人遇到BumbleBee答案中的注释中提到的相同错误。

我的是基于简单的系统命令。您提供的所有功能就是脚本的名称：

extractRootDir <- function(x) {
    abs <- suppressWarnings(system(paste("find ./ -name",x), wait=T, intern=T, ignore.stderr=T))[1];
    path <- paste("~",substr(abs, 3, length(strsplit(abs,"")[[1]])),sep="");
    ret <- gsub(x, "", path);
    return(ret);
}

setwd(extractRootDir("myScript.R"));

该函数的输出如下所示"/Users/you/Path/To/Script"。希望这对其他可能陷入困境的人有所帮助。

该here软件包提供的here()功能，基于一些启发式返回你的项目的根目录。

这不是一个完美的解决方案，因为它找不到脚本的位置，但是出于某些目的已经足够了，所以我想把它放在这里。

大多数GUI假定，如果您在目录中并“打开”，双击或尝试执行.R文件，则除非另外指定，否则文件所在的目录将为工作目录。Mac GUI提供了一种更改默认行为的方法，该方法可以在运行的会话中设置的“首选项”的“启动”面板中更改，并在下一次“启动”时生效。您还应该查看：

?Startup

RStudio文档说：

“通过文件关联启动时，RStudio会自动将工作目录设置为打开文件的目录。” 默认设置是将RStudio注册为.R文件的处理程序，尽管也提到了可以为RStudio和.Rdata和.R扩展名设置默认“关联”的功能。我无法确定Linux上的“处理程序”状态和“关联”状态是否相同。

http://www.rstudio.com/ide/docs/using/workspaces

dirname(parent.frame(2)$ofile)  

也不适合我，但是以下内容（如https://stackoverflow.com/a/35842176/992088中所建议）在ubuntu 14.04中对我适用

dirname(rstudioapi::getActiveDocumentContext()$path)

如果您使用UTF-8编码：

path <- rstudioapi::getActiveDocumentContext()$path
Encoding(path) <- "UTF-8"
setwd(dirname(path))

如果尚未安装软件包rstudioapi，则需要安装它。

这是另一种方法：

set2 <- function(name=NULL) {
  wd <- rstudioapi::getSourceEditorContext()$path
  if (!is.null(name)) {
    if (substr(name, nchar(name) - 1, nchar(name)) != '.R') 
      name <- paste0(name, '.R')
  }
  else {
    name <- stringr::word(wd, -1, sep='/')
  }
  wd <- gsub(wd, pattern=paste0('/', name), replacement = '')
  no_print <- eval(expr=setwd(wd), envir = .GlobalEnv)
}
set2()