在熊猫数据框中使用NaN查找行的整数索引


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我有一个这样的熊猫DataFrame:

                    a         b
2011-01-01 00:00:00 1.883381  -0.416629
2011-01-01 01:00:00 0.149948  -1.782170
2011-01-01 02:00:00 -0.407604 0.314168
2011-01-01 03:00:00 1.452354  NaN
2011-01-01 04:00:00 -1.224869 -0.947457
2011-01-01 05:00:00 0.498326  0.070416
2011-01-01 06:00:00 0.401665  NaN
2011-01-01 07:00:00 -0.019766 0.533641
2011-01-01 08:00:00 -1.101303 -1.408561
2011-01-01 09:00:00 1.671795  -0.764629

有没有一种有效的方法来查找具有NaN的行的“整数”索引?在这种情况下,所需的输出应为[3, 6]


12
如果您只想选择带有nan的行,则可以df[np.isnan(df['b'])]
lazy1

4
从@ lazy1跟进-除了使用numpyisnan您还可以使用df['b'].isnull()
jmetz

Answers:


46

对于DataFrame df

import numpy as np
index = df['b'].index[df['b'].apply(np.isnan)]

将带给您MultiIndex可以用来索引回的索引df,例如:

df['a'].ix[index[0]]
>>> 1.452354

对于整数索引:

df_index = df.index.values.tolist()
[df_index.index(i) for i in index]
>>> [3, 6]

1
ix听起来很直观,出于某些原因,听起来好像它已被弃用iloc
cardamom

144

这是一个更简单的解决方案:

inds = pd.isnull(df).any(1).nonzero()[0]

In [9]: df
Out[9]: 
          0         1
0  0.450319  0.062595
1 -0.673058  0.156073
2 -0.871179 -0.118575
3  0.594188       NaN
4 -1.017903 -0.484744
5  0.860375  0.239265
6 -0.640070       NaN
7 -0.535802  1.632932
8  0.876523 -0.153634
9 -0.686914  0.131185

In [10]: pd.isnull(df).any(1).nonzero()[0]
Out[10]: array([3, 6])

29
我最终使用了:np.where(df['b'].notnull())[0]

谢谢,.nonzero()[0]胜过[i for i, k in enumerate(mask) if k]。)
Winand

2
您可能可以进一步简化:r, _ = np.where(df.isna())
cs95

2
首先添加.to_numpy()要在numpy数组中进行转换pd.isnull(df).any(1).to_numpy().nonzero()
7bStan


9

并且以防万一,如果您想查找所有列的“ nan”坐标(假设它们都是数字),则可以执行以下操作:

df = pd.DataFrame([[0,1,3,4,np.nan,2],[3,5,6,np.nan,3,3]])

df
   0  1  2    3    4  5
0  0  1  3  4.0  NaN  2
1  3  5  6  NaN  3.0  3

np.where(np.asanyarray(np.isnan(df)))
(array([0, 1]), array([4, 3]))

9

不知道这是否为时已晚,但是您可以使用np.where来查找非值的索引,如下所示:

indices = list(np.where(df['b'].isna()[0]))

4

这是一些方法的测试:

%timeit np.where(np.isnan(df['b']))[0]
%timeit pd.isnull(df['b']).nonzero()[0]
%timeit np.where(df['b'].isna())[0]
%timeit df.loc[pd.isna(df['b']), :].index

及其对应的时间:

333 µs ± 9.95 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
280 µs ± 220 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
313 µs ± 128 ns per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
6.84 ms ± 1.59 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)

看起来pd.isnull(df['DRGWeight']).nonzero()[0]在时间安排上胜出,但是前三种方法中的任何一种都有可比的性能。


3

如果您有日期时间索引,并且想要具有以下值:

df.loc[pd.isnull(df).any(1), :].index.values


1

这是另一个更简单的方法:

df = pd.DataFrame([[0,1,3,4,np.nan,2],[3,5,6,np.nan,3,3]])

inds = np.asarray(df.isnull()).nonzero()

(array([0, 1], dtype=int64), array([4, 3], dtype=int64))

1

我正在寻找具有NaN值的行的所有索引。
我的工作解决方案:

def get_nan_indexes(data_frame):
    indexes = []
    print(data_frame)
    for column in data_frame:
        index = data_frame[column].index[data_frame[column].apply(np.isnan)]
        if len(index):
            indexes.append(index[0])
    df_index = data_frame.index.values.tolist()
    return [df_index.index(i) for i in set(indexes)]

0

假设数据框命名为df,并且感兴趣的列(即我们试图在其中查找null的列)为'b'。然后,以下代码段在数据框中给出了所需的null索引:

   for i in range(df.shape[0]):
       if df['b'].isnull().iloc[i]:
           print(i)
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