刚刚在Windows上安装了git。我将GIT_DIR变量设置为c：\ git \，并验证了该环境变量是由cygwin维护的（即echo $ GIT_DIR应该是它）。我转到了要为其创建git存储库的文件夹，假设c：\ www，然后运行：
git init
git add .
然后我得到错误：
fatal: This operation must be run in a work tree
我不确定出了什么问题，但是c：\ git目录中有一个配置文件，内容为：
[core]
repositoryformatversion = 0
filemode = false
bare = true
symlinks = false
ignorecase = true
我很确定这不应该是裸露的，这就是我们的问题。
Answers:
该错误的直接原因是，是的，不可能git-add与裸仓库一起使用。根据定义，裸仓库没有工作树。git-add从工作树中获取文件并将其添加到索引中，以准备提交。
不过，您可能需要在这里对设置进行一些思考。GIT_DIR是所有git命令使用的存储库目录。您是否真的要为跟踪的所有内容（也许是系统中的所有内容）创建一个存储库？git存储库本质上跟踪单个目录的内容。您需要将GIT_WORK_TREE路径设置为包含要跟踪的所有内容的路径，然后您需要使用a.gitignore来屏蔽对跟踪不感兴趣的所有内容。
也许您正在尝试创建仅跟踪的存储库c:\www？然后，您应该将其放入c:\www（不要设置GIT_DIR）。这是git的正常用法，存储库位于“模块”的顶级目录的.git目录中。
除非您有充分的理由，否则我建议您坚持使用git喜欢的工作方式。如果您要跟踪几件事，则可能需要多个存储库！
git config --unset core.bare。
git branch命令，我可以列出分支，但无法执行git checkout -b feature22。这是否意味着列出分支不需要工作的树，但要签出它呢？
另外，您可能位于.git子文件夹中，将一个文件夹上移到项目根目录。
以防万一我发生的事情正在别人身上发生，我需要这样说：当我收到此错误时，我在项目的.git目录中。我搜寻并搜寻答案，但没有任何效果。我要做的就是回到正确的目录。对我来说，这真像是个脸红的时刻。万一还有其他人像我一样傻，我希望您觉得这个答案有用。
只是克隆在另一个文件夹相同的项目和复制的git的/文件夹到您的项目。
例
创建临时文件夹：
mkdir temp
切换到临时文件夹
cd temp/
在temp文件夹中克隆相同的项目：
git clone [-b branchName] git@path_to_your_git_repository
将.git文件夹复制到您的projet中：
cp -R .git/ path/to/your/project/
切换到您的项目并运行 git status
删除的临时文件夹，如果你完成。
希望这会帮助某人
显式设置GIT_DIR环境变量将强制git使用给定目录作为git存储库。正常使用中永远不需要它。
在您的示例中，由于指定了aGIT_DIR且未命名.git（前导点很重要），并且您未提供任何--work-tree选项或设置GIT_WORK_TREE环境变量，因此您在说时需要一个裸存储库git init。
由于裸存储库没有工作树，因此大量选择命令对裸存储库没有意义。git add只是一个而已。
您是否有特定的原因需要在git存储库中使用非标准位置，而不是在.git工作树根目录下的子文件夹中？尽管可以安排它，但它往往需要更多的工作并且更容易出错。
创建一个裸露的GIT存储库
一个小麻烦：git无法自行创建普通的裸存储库。确实是愚蠢的git。
确切地说，不可能克隆空的存储库。因此，空的存储库是无用的存储库。实际上，您通常会创建一个空的存储库并立即填充它：
git init
git add .
但是，当您创建裸仓库时，git add是不可能的：
git --bare init
git add .
给出错误“致命：此操作必须在工作树中运行”。
您也无法签出：
Initialized empty Git repository in /home/user/myrepos/.git/
fatal: http://repository.example.org/projects/myrepos.git/info/refs not found: did you run git update-server-info on the server?
git --bare init
git update-server-info # this creates the info/refs file
chown -R <user>:<group> . # make sure others can update the repository
解决方案是在其他位置创建另一个存储库，在该存储库中添加文件，然后将其推送到裸存储库。
mkdir temp; cd temp
git init
touch .gitignore
git add .gitignore
git commit -m "Initial commit"
git push (url or path of bare repository) master
cd ..; rm -rf temp
希望这可以帮助你
$ git --bare init bare.git Initialized empty Git repository in /home18/cbailey/gittest8/bare.git/ $ git clone bare.git non-bare Cloning into 'non-bare'... \\ done. \\ warning: You appear to have cloned an empty repository.
我有这个问题，因为.git/config包含在内worktree = D:/git-repositories/OldName。我刚改成worktree = D:/git-repositories/NewName
我发现了这一点，因为我使用了git gui，它显示了更详细的错误消息：
fatal: this operation must be run in a work tree。修改配置文件为我修复了它。
就我而言，我的存储库与“ .git”文件位于同一文件夹中。我不得不上一级目录，它解决了它。
如果似乎没有其他效果，请再次检查中的路径git config core.worktree。如果该路径未指向您的工作目录，则可能需要更新它。
我收到此错误的方法是，我在网络驱动器上创建了一个Git存储库。它在一台计算机上工作正常，但在另一台计算机上返回了此错误。原来，我已将驱动器映射到创建它的计算机上的Windows驱动器盘符上，而不是另一台计算机上，并且Git将工作树的路径保存为映射路径而不是UNC路径。
如果以上任何一种常用方法都无法帮助您，请查看此错误消息（"fatal: This operation . . ."）下方的调用跟踪，然后找到引发实际错误的脚本和行。找到该error（）调用后，将其禁用，看看您尝试执行的操作是否完成，甚至带有一些警告/消息-现在将其忽略。如果是这样，最后在完成后可能会提到操作未成功完成的部分。现在，酌情单独处理此部分。
将上述逻辑与我的情况相关联，"fatal: This operation . . ."当我尝试使用来获取Android-x86代码时，我收到了此错误消息repo sync . . .。并且呼叫跟踪显示raise GitError("cannot initialize work tree")为error（）呼叫，导致上述错误消息（"fatal: . . ."）。因此，评论后GitError()在.repo/repo/project.py，repo sync . . .继续和最后表示错误是没有正确同步三个项目。我只是*.git在本地从Android-x86源代码树中的相关路径中删除了它们的文件夹，然后repo sync . . .再次运行并尝试成功！
此外，显然，如果您克隆到NTFS Ram Drive中，则会发生此错误。