当一些数字包含逗号作为千位分隔符时,如何读取数据?


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我有一个csv文件,其中一些数值表示为字符串,并用逗号作为千位分隔符,例如"1,513"代替1513。将数据读入R的最简单方法是什么?

我可以使用read.csv(..., colClasses="character"),但是在将这些列转换为数值之前,我必须从相关元素中去除逗号,而且我找不到一种整洁的方式来做到这一点。

Answers:


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不确定如何read.csv正确解释它,但是您可以使用gsub替换",""",然后将字符串转换为numericusing as.numeric

y <- c("1,200","20,000","100","12,111")
as.numeric(gsub(",", "", y))
# [1]  1200 20000 100 12111

先前在R-Help(以及此处的Q2)中对此进行了回答

或者,您可以预处理文件,例如使用sedunix。


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您可以让read.table或read.csv半自动为您完成此转换。首先创建一个新的类定义,然后创建一个转换函数,并使用setAs函数将其设置为“ as”方法,如下所示:

setClass("num.with.commas")
setAs("character", "num.with.commas", 
        function(from) as.numeric(gsub(",", "", from) ) )

然后像这样运行read.csv:

DF <- read.csv('your.file.here', 
   colClasses=c('num.with.commas','factor','character','numeric','num.with.commas'))

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这是非常好的技巧。它可用于导入时转换(例如,使用将Y / N值转换为逻辑向量setAs("character", "logical.Y.N", function(from) c(Y=TRUE,N=FALSE)[from] ))。
Marek'9

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相同技巧用于类似问题。并补充一点:可以使用setClass("num.with.commas")suppresMessage(setAs(.....))避免有关缺少类的消息。
马雷克(Marek)

嗨,格雷格,感谢您分享此便捷功能。执行后,我将收到以下警告:在带有签名“字符”,“ num.with.commas”的“强制”方法中:类“ num.with.commas”没有定义任何想法在这里,我有你的代码一个字一个字吗?
TheGoat's

我检查了类似的问题链接,发现需要设置课程!感谢您的巧妙技巧。
TheGoat

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我想使用R而不是预处理数据,因为它使修改数据时更容易。遵循Shane的use的建议gsub,我认为这差不多可以做到:

x <- read.csv("file.csv",header=TRUE,colClasses="character")
col2cvt <- 15:41
x[,col2cvt] <- lapply(x[,col2cvt],function(x){as.numeric(gsub(",", "", x))})

colClasses =“ char”不会将所有列都强制为char,在这种情况下,除了15:41以外的其他列也都是char?也许让read.csv()决定然后转换cols 15:41中的内容可能会让您“更多”数字列。
Dirk Eddelbuettel,2009年

是的,但是正如我的问题所指出的,其他所有列都是字符。我可以使用as.is = TRUE代替,这会更通用。但是让read.csv()通过使用默认参数来决定是没有帮助的,因为它将将任何看起来像字符的内容转换为一个导致数字列麻烦的因素,因为这样它们就无法使用as.numeric()正确转换。
罗布·海恩德曼

您应该考虑将读取表中的dec =参数设置为“。”。这是read.csv2的默认设置,但逗号硬连接到read.csv()中。
IRTFM '01

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这个问题已经有好几年了,但我偶然发现了,这意味着其他人可能会这样。

readr库/包有一些不错的功能吧。其中之一是解释此类“杂乱”列的好方法。

library(readr)
read_csv("numbers\n800\n\"1,800\"\n\"3500\"\n6.5",
          col_types = list(col_numeric())
        )

这产生

来源:本地数据帧[4 x 1]

  numbers
    (dbl)
1   800.0
2  1800.0
3  3500.0
4     6.5

读取文件时的重要一点:您必须进行预处理,例如上面的注释sed,或者您必须在读取时进行处理。通常,如果您试图在事后解决问题,那么会发现一些危险的假设,这些假设很难找到。(这就是为什么平面文件首先如此邪恶的原因。)

例如,如果没有标记col_types,我将得到以下信息:

> read_csv("numbers\n800\n\"1,800\"\n\"3500\"\n6.5")
Source: local data frame [4 x 1]

  numbers
    (chr)
1     800
2   1,800
3    3500
4     6.5

(请注意,现在它是一个chrcharacter)而不是一个numeric。)

或者,更危险的是,如果它足够长并且大多数早期元素不包含逗号:

> set.seed(1)
> tmp <- as.character(sample(c(1:10), 100, replace=TRUE))
> tmp <- c(tmp, "1,003")
> tmp <- paste(tmp, collapse="\"\n\"")

(这样最后几个元素看起来像:)

\"5\"\n\"9\"\n\"7\"\n\"1,003"

然后,您会发现完全看不懂该逗号!

> tail(read_csv(tmp))
Source: local data frame [6 x 1]

     3"
  (dbl)
1 8.000
2 5.000
3 5.000
4 9.000
5 7.000
6 1.003
Warning message:
1 problems parsing literal data. See problems(...) for more details. 

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dplyr使用mutate_all和管道的解决方案

说您具有以下条件:

> dft
Source: local data frame [11 x 5]

   Bureau.Name Account.Code   X2014   X2015   X2016
1       Senate          110 158,000 211,000 186,000
2       Senate          115       0       0       0
3       Senate          123  15,000  71,000  21,000
4       Senate          126   6,000  14,000   8,000
5       Senate          127 110,000 234,000 134,000
6       Senate          128 120,000 159,000 134,000
7       Senate          129       0       0       0
8       Senate          130 368,000 465,000 441,000
9       Senate          132       0       0       0
10      Senate          140       0       0       0
11      Senate          140       0       0       0

并希望从年份变量X2014-X2016中删除逗号,并将其转换为数字。另外,假设将X2014-X2016作为因素读入(默认)

dft %>%
    mutate_all(funs(as.character(.)), X2014:X2016) %>%
    mutate_all(funs(gsub(",", "", .)), X2014:X2016) %>%
    mutate_all(funs(as.numeric(.)), X2014:X2016)

mutate_all将内部函数应用于funs指定的列

我是按顺序执行的,一次只能执行一个功能(如果您在内部使用多个功能,funs则会创建其他不必要的列)


3
mutate_each不推荐使用。您想使用mutate_at或类似的方式更新您的答案吗?
T_T

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R中的“预处理”:

lines <- "www, rrr, 1,234, ttt \n rrr,zzz, 1,234,567,987, rrr"

可以readLines在上使用textConnection。然后仅删除数字之间的逗号:

gsub("([0-9]+)\\,([0-9])", "\\1\\2", lines)

## [1] "www, rrr, 1234, ttt \n rrr,zzz, 1234567987, rrr"

知道但与该问题不直接相关的是,逗号作为小数点分隔符可以由read.csv2(自动)或read.table(带有'dec'参数的设置)处理,这也很有用。

编辑:后来我发现如何通过设计一个新类使用colClasses。看到:

如何在R中将带有1000个分隔符的df加载为数字类?


谢谢,这是一个很好的指针,但它不工作,对于含有多个小数点符号数字,如1,234,567.89 -需要解决此问题导入谷歌电子表格分为R,看到stackoverflow.com/a/30020171/3096626一个简单可以为多个小数点
做功的

4

如果数字用“。”分隔。并通过调用小数“”(1.200.000,00)gsub你必须set fixed=TRUE as.numeric(gsub(".","",y,fixed=TRUE))


3

readr::read_delim-family 是一种非常方便的方法。从此处获取示例: 将具有多个分隔符的csv导入R中,您可以执行以下操作:

txt <- 'OBJECTID,District_N,ZONE_CODE,COUNT,AREA,SUM
1,Bagamoyo,1,"136,227","8,514,187,500.000000000000000","352,678.813105723350000"
2,Bariadi,2,"88,350","5,521,875,000.000000000000000","526,307.288878142830000"
3,Chunya,3,"483,059","30,191,187,500.000000000000000","352,444.699742995200000"'

require(readr)
read_csv(txt) # = read_delim(txt, delim = ",")

结果为预期的结果:

# A tibble: 3 × 6
  OBJECTID District_N ZONE_CODE  COUNT        AREA      SUM
     <int>      <chr>     <int>  <dbl>       <dbl>    <dbl>
1        1   Bagamoyo         1 136227  8514187500 352678.8
2        2    Bariadi         2  88350  5521875000 526307.3
3        3     Chunya         3 483059 30191187500 352444.7

3

使用readr 库的一部分read_delim函数,可以指定其他参数:

locale = locale(decimal_mark = ",")

read_delim("filetoread.csv", ';", locale = locale(decimal_mark = ","))

*第二行中的分号表示read_delim将读取csv分号分隔的值。

这将有助于读取所有带逗号的数字作为正确的数字。

问候

马特乌斯·卡尼亚(Mateusz Kania)


3

我们也可以使用readr::parse_number,但是列必须是字符。如果我们想将其应用于多个列,我们可以使用lapply

df[2:3] <- lapply(df[2:3], readr::parse_number)
df

#  a        b        c
#1 a    12234       12
#2 b      123  1234123
#3 c     1234     1234
#4 d 13456234    15342
#5 e    12312 12334512

或使用mutate_atfrom dplyr将其应用于特定变量。

library(dplyr)
df %>% mutate_at(2:3, readr::parse_number)
#Or
df %>% mutate_at(vars(b:c), readr::parse_number)

数据

df <- data.frame(a = letters[1:5], 
                 b = c("12,234", "123", "1,234", "13,456,234", "123,12"),
                 c = c("12", "1,234,123","1234", "15,342", "123,345,12"), 
                 stringsAsFactors = FALSE)

1

我认为预处理是要走的路。您可以使用具有正则表达式替换选项的Notepad ++

例如,如果您的文件是这样的:

"1,234","123","1,234"
"234","123","1,234"
123,456,789

然后,您可以使用正则表达式"([0-9]+),([0-9]+)"并将其替换为\1\2

1234,"123",1234
"234","123",1234
123,456,789

然后,您可以使用它 x <- read.csv(file="x.csv",header=FALSE)来读取文件。


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hadley
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