为复杂的图构建手动图例

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我无法弄清楚如何为此图手动设置图例。我真正想要的只是一个简单的图例，该图例使用三种颜色并在每种颜色旁边都有一个名称。

在此处输入图片说明

当前代码如下： 

a <-c("S1","S2","S3","S4","S5","S6","S7","S8","S9") #names
b <-c(0.23,0.26,0.55,0.56,0.36,0.23,0.18,0.06,0.04) #mean t0
c <-c(0.64,0.6,0.81,1.4,0.89,0.55,0.48,0.22,0.09) #mean t1
d <-c(0.20,0.23,0.52,0.53,0.33,0.20,0.15,0.04,0.03) #SD low t0
e <-c(0.26,0.29,0.58,.59,0.39,0.26,0.21,0.08,0.05) #SD high t0
f <-c(0.67,0.63,0.86,1.44,0.93,0.59,0.51,0.25,0.10) #SD high t1
g <-c(0.61,0.57,0.78,1.36,0.85,0.53,0.45,0.19,0.08) #SD low t1
h <-c(0.41,0.34,0.26,0.84,0.53,0.32,0.30,0.16,0.05) #absolute change

data <- data.frame(a,b,c,d,e,f,g,h)

ggplot(data=data,aes(a)) + 
  geom_bar(stat="identity", aes(y=h),fill="#62c76b",colour="#333333")+ #green
  geom_line(aes(y=b,group=1),size=1.0,colour="#f04546") +   #red
  geom_point(aes(y=b),size=3, colour="#f04546") +           #red
  geom_errorbar(aes(ymin=d, ymax=e), colour="#f04546", width=0.1, size=.8) + 
  geom_line(aes(y=c,group=1),size=1.0,colour="#3591d1") +   #blue 
  geom_point(aes(y=c),size=3, colour="#3591d1") +           #blue
  geom_errorbar(aes(ymin=f, ymax=g), colour="#3591d1", width=0.1, size=.8) + 
  ylab("Symptom severity") + xlab("PHQ-9 symptoms") +
  ylim(0,1.6) +
  theme_bw() +
  theme(axis.title.x = element_text(size = 15, vjust=-.2)) +
  theme(axis.title.y = element_text(size = 15, vjust=0.3))
r  data-visualization  ggplot2 
— 托文
source
3
非常有帮助-如果没有文档和教程，我将从哪里获得代码？
— Torvon 2013年

Answers:

108

您需要将属性映射到美学（es语句中的颜色）以生成图例。

cols <- c("LINE1"="#f04546","LINE2"="#3591d1","BAR"="#62c76b")
ggplot(data=data,aes(x=a)) + 
  geom_bar(stat="identity", aes(y=h, fill = "BAR"),colour="#333333")+ #green
  geom_line(aes(y=b,group=1, colour="LINE1"),size=1.0) +   #red
  geom_point(aes(y=b, colour="LINE1"),size=3) +           #red
  geom_errorbar(aes(ymin=d, ymax=e, colour="LINE1"), width=0.1, size=.8) + 
  geom_line(aes(y=c,group=1,colour="LINE2"),size=1.0) +   #blue 
  geom_point(aes(y=c,colour="LINE2"),size=3) +           #blue
  geom_errorbar(aes(ymin=f, ymax=g,colour="LINE2"), width=0.1, size=.8) + 
  scale_colour_manual(name="Error Bars",values=cols) + scale_fill_manual(name="Bar",values=cols) +
  ylab("Symptom severity") + xlab("PHQ-9 symptoms") +
  ylim(0,1.6) +
  theme_bw() +
  theme(axis.title.x = element_text(size = 15, vjust=-.2)) +
  theme(axis.title.y = element_text(size = 15, vjust=0.3))

在此处输入图片说明

我知道Roland的来源，但是由于这仅是3个属性，并且由于条形图和错误条形的叠加而产生了复杂性，因此按原样将数据保留为宽格式可能是合理的。使用geom_pointrange可以稍微降低复杂度。

要更改原始误差线图例的背景色，请添加+ theme(legend.key = element_rect(fill = "white",colour = "white"))到绘图规范中。要合并不同的图例，通常需要对所有元素进行一致的映射，但是当前它为我生成了黑色背景的伪像。我以为guide = guide_legend(fill = NULL,colour = NULL)会将图例的背景设置为空，但事实并非如此。也许值得另一个问题。

ggplot(data=data,aes(x=a)) + 
  geom_bar(stat="identity", aes(y=h,fill = "BAR", colour="BAR"))+ #green
  geom_line(aes(y=b,group=1, colour="LINE1"),size=1.0) +   #red
  geom_point(aes(y=b, colour="LINE1", fill="LINE1"),size=3) +           #red
  geom_errorbar(aes(ymin=d, ymax=e, colour="LINE1"), width=0.1, size=.8) + 
  geom_line(aes(y=c,group=1,colour="LINE2"),size=1.0) +   #blue 
  geom_point(aes(y=c,colour="LINE2", fill="LINE2"),size=3) +           #blue
  geom_errorbar(aes(ymin=f, ymax=g,colour="LINE2"), width=0.1, size=.8) + 
  scale_colour_manual(name="Error Bars",values=cols, guide = guide_legend(fill = NULL,colour = NULL)) + 
  scale_fill_manual(name="Bar",values=cols, guide="none") +
  ylab("Symptom severity") + xlab("PHQ-9 symptoms") +
  ylim(0,1.6) +
  theme_bw() +
  theme(axis.title.x = element_text(size = 15, vjust=-.2)) +
  theme(axis.title.y = element_text(size = 15, vjust=0.3))

在此处输入图片说明

要消除图例中的黑色背景，您需要在中使用override.aes参数guide_legend。这样做的目的是让您指定图例的特定方面，而该方面可能未正确分配。

ggplot(data=data,aes(x=a)) + 
  geom_bar(stat="identity", aes(y=h,fill = "BAR", colour="BAR"))+ #green
  geom_line(aes(y=b,group=1, colour="LINE1"),size=1.0) +   #red
  geom_point(aes(y=b, colour="LINE1", fill="LINE1"),size=3) +           #red
  geom_errorbar(aes(ymin=d, ymax=e, colour="LINE1"), width=0.1, size=.8) + 
  geom_line(aes(y=c,group=1,colour="LINE2"),size=1.0) +   #blue 
  geom_point(aes(y=c,colour="LINE2", fill="LINE2"),size=3) +           #blue
  geom_errorbar(aes(ymin=f, ymax=g,colour="LINE2"), width=0.1, size=.8) + 
  scale_colour_manual(name="Error Bars",values=cols, 
                      guide = guide_legend(override.aes=aes(fill=NA))) + 
  scale_fill_manual(name="Bar",values=cols, guide="none") +
  ylab("Symptom severity") + xlab("PHQ-9 symptoms") +
  ylim(0,1.6) +
  theme_bw() +
  theme(axis.title.x = element_text(size = 15, vjust=-.2)) +
  theme(axis.title.y = element_text(size = 15, vjust=0.3))

在此处输入图片说明

— 安迪·W
source
安迪，非常感谢。（1）有没有一种方法可以将2行与1条图例“合并”？（2）有没有办法手动更改图例？例如LINE1和LINE2周围的灰色边框的颜色？我没有在ggplot2文档中找到任何内容（我的所有代码均来自此文档）。
— Torvon 2013年
@Torvon，要合并图例，通常需要为每个几何图形具有一致的映射。我将用一个示例进行更新，但这会产生一个奇怪的伪像（可能是因为线条没有内部填充）。可能值得另一个问题，看看是否可以根据您的喜好进行修改。我会说，尽管我认为不同的传说不是一个好主意。带有两个图例IMO的过程非常简单。
— 安迪W
这是非常有用的，但是我遇到的唯一问题是我的图例与第一个示例（错误栏，Line1，Line2，Bar，Bar）的合并方式不同，而是出现了“错误Bars，Bar，Line 1，Line 2，Bar” ...任何想法我可以传递什么参数scale_color_manual来调整？
— dre
创建一个可重现的示例并打开一个新问题@dre可能值得。没有那个可复制的例子，真的很难提供帮助。
— 安迪W
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如果您正在努力进行更改linetypes，以下答案应该会有所帮助。（这是Andy W解决方案的补充。）

我们将尝试扩展学习的模式：

cols <- c("LINE1"="#f04546","LINE2"="#3591d1","BAR"="#62c76b")
line_types <- c("LINE1"=1,"LINE2"=3)
ggplot(data=data,aes(x=a)) + 
  geom_bar(stat="identity", aes(y=h,fill = "BAR"))+ #green
  geom_line(aes(y=b,group=1, colour="LINE1", linetype="LINE1"),size=0.5) +   #red
  geom_point(aes(y=b, colour="LINE1", fill="LINE1"),size=2) +           #red
  geom_line(aes(y=c,group=1,colour="LINE2", linetype="LINE2"),size=0.5) +   #blue 
  geom_point(aes(y=c,colour="LINE2", fill="LINE2"),size=2) +           #blue
  scale_colour_manual(name="Error Bars",values=cols, 
                  guide = guide_legend(override.aes=aes(fill=NA))) + 
  scale_linetype_manual(values=line_types)+
  scale_fill_manual(name="Bar",values=cols, guide="none") +
  ylab("Symptom severity") + xlab("PHQ-9 symptoms") +
  ylim(0,1.6) +
  theme_bw() +
  theme(axis.title.x = element_text(size = 15, vjust=-.2)) +
  theme(axis.title.y = element_text(size = 15, vjust=0.3))

但是，我们得到以下结果： 没有名称的手册

问题在于linetype不会在主图例中合并。注意，我们没有给该方法起任何名字scale_linetype_manual。这里起作用的窍门是给它命名与您使用的名称相同scale_colour_manual。更具体地说，如果将相应的行更改为以下内容，则将获得所需的结果：

scale_linetype_manual(name="Error Bars",values=line_types)

同名手册

现在，使用相同的想法很容易更改行的大小。

请注意，geom_bar不再具有color属性。（我没有尝试解决此问题。）而且，添加geom_errorbarcolor属性会破坏结果。如果有人能提出一个更好的解决方案，同时解决这两个问题，那就太好了。

— 萨巴萨迪德
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