我有3个CSV文件。每个列都有第一列作为人员的(字符串)名称,而每个数据框中的所有其他列都是该人员的属性。
如何将所有三个CSV文档“连接”在一起以创建一个CSV,而每一行都具有该人的字符串名称的每个唯一值的所有属性?
join()
pandas中的函数指定我需要一个多索引,但是我对层次化索引方案与基于单个索引进行联接有何关系感到困惑。
df1.join([df2, df3], on=[df2_col1, df3_col1])
没有用。
我有3个CSV文件。每个列都有第一列作为人员的(字符串)名称,而每个数据框中的所有其他列都是该人员的属性。
如何将所有三个CSV文档“连接”在一起以创建一个CSV,而每一行都具有该人的字符串名称的每个唯一值的所有属性?
join()
pandas中的函数指定我需要一个多索引,但是我对层次化索引方案与基于单个索引进行联接有何关系感到困惑。
df1.join([df2, df3], on=[df2_col1, df3_col1])
没有用。
Answers:
假设进口:
import pandas as pd
John Galt的答案基本上是一项reduce
手术。如果我有几个数据帧,则将它们放在这样的列表中(通过列表推导或循环或其他方式生成):
dfs = [df0, df1, df2, dfN]
假设它们有一些共同的列,例如name
您的示例,我将执行以下操作:
df_final = reduce(lambda left,right: pd.merge(left,right,on='name'), dfs)
这样,您的代码应该可以与要合并的任意数量的数据框一起使用。
编辑2016年8月1日:对于使用Python 3的用户:reduce
已移入functools
。因此,要使用此功能,您首先需要导入该模块:
from functools import reduce
name1
,name2
和name3
分别。
n-1
调用了merge函数吗?我想在这种情况下,数据帧的数量很小并不重要,但是我想知道是否有更可扩展的解决方案。
df
的具有列多索引的s 不太有效(它将“ on”作为对第一次合并有效的列进行注入,但是随后的合并失败),而是让它与以下对象一起使用:df = reduce(lambda left, right: left.join(right, how='outer', on='Date'), dfs)
如果您有3个数据框,则可以尝试
# Merge multiple dataframes
df1 = pd.DataFrame(np.array([
['a', 5, 9],
['b', 4, 61],
['c', 24, 9]]),
columns=['name', 'attr11', 'attr12'])
df2 = pd.DataFrame(np.array([
['a', 5, 19],
['b', 14, 16],
['c', 4, 9]]),
columns=['name', 'attr21', 'attr22'])
df3 = pd.DataFrame(np.array([
['a', 15, 49],
['b', 4, 36],
['c', 14, 9]]),
columns=['name', 'attr31', 'attr32'])
pd.merge(pd.merge(df1,df2,on='name'),df3,on='name')
或者,如cwharland所述
df1.merge(df2,on='name').merge(df3,on='name')
df1.merge(df2,on='name').merge(df3,on='name')
name1
,name2
和name3
分别
df1.merge(df2,left_on='name1', right_on='name2').merge(df3,left_on='name1', right_on='name3').drop(columns=['name2', 'name3']).rename(columns={'name1':'name'})
join
方法的理想情况该join
方法正是针对这些类型的情况而构建的。您可以将任意数量的DataFrame与其一起加入。调用DataFrame与传递的DataFrames集合的索引连接。要使用多个DataFrame,必须将联接列放在索引中。
代码看起来像这样:
filenames = ['fn1', 'fn2', 'fn3', 'fn4',....]
dfs = [pd.read_csv(filename, index_col=index_col) for filename in filenames)]
dfs[0].join(dfs[1:])
使用@zero的数据,您可以执行以下操作:
df1 = pd.DataFrame(np.array([
['a', 5, 9],
['b', 4, 61],
['c', 24, 9]]),
columns=['name', 'attr11', 'attr12'])
df2 = pd.DataFrame(np.array([
['a', 5, 19],
['b', 14, 16],
['c', 4, 9]]),
columns=['name', 'attr21', 'attr22'])
df3 = pd.DataFrame(np.array([
['a', 15, 49],
['b', 4, 36],
['c', 14, 9]]),
columns=['name', 'attr31', 'attr32'])
dfs = [df1, df2, df3]
dfs = [df.set_index('name') for df in dfs]
dfs[0].join(dfs[1:])
attr11 attr12 attr21 attr22 attr31 attr32
name
a 5 9 5 19 15 49
b 4 61 14 16 4 36
c 24 9 4 9 14 9
pd.DataFrame().join(dfs, how="outer")
。在某些情况下这可以更清洁。
dfs[0].join(dfs[1:])
应该被编辑为dfs[0].join(dfs[1:], sort=False)
,否则FutureWarning
会弹出一个。感谢您的好例子。
ValueError: Indexes have overlapping values
尽管通过检查列表中的各个数据框,它们似乎没有重叠的值。
在python
3.6.3和pandas
0.22.0中concat
,只要将要用于联接的列设置为索引,也可以使用
pd.concat(
(iDF.set_index('name') for iDF in [df1, df2, df3]),
axis=1, join='inner'
).reset_index()
其中df1
,df2
和df3
定义为John Galt的答案
import pandas as pd
df1 = pd.DataFrame(np.array([
['a', 5, 9],
['b', 4, 61],
['c', 24, 9]]),
columns=['name', 'attr11', 'attr12']
)
df2 = pd.DataFrame(np.array([
['a', 5, 19],
['b', 14, 16],
['c', 4, 9]]),
columns=['name', 'attr21', 'attr22']
)
df3 = pd.DataFrame(np.array([
['a', 15, 49],
['b', 4, 36],
['c', 14, 9]]),
columns=['name', 'attr31', 'attr32']
)
一个并不需要一个多指标进行连接操作。只需正确设置要在其上执行联接操作的索引列(df.set_index('Name')
例如,该命令)
join
默认情况下,该操作是对索引执行的。对于您的情况,只需要指定该Name
列对应于您的索引即可。下面是一个例子
甲教程可能是有用的。
# Simple example where dataframes index are the name on which to perform the join operations
import pandas as pd
import numpy as np
name = ['Sophia' ,'Emma' ,'Isabella' ,'Olivia' ,'Ava' ,'Emily' ,'Abigail' ,'Mia']
df1 = pd.DataFrame(np.random.randn(8, 3), columns=['A','B','C'], index=name)
df2 = pd.DataFrame(np.random.randn(8, 1), columns=['D'], index=name)
df3 = pd.DataFrame(np.random.randn(8, 2), columns=['E','F'], index=name)
df = df1.join(df2)
df = df.join(df3)
# If you a 'Name' column that is not the index of your dataframe, one can set this column to be the index
# 1) Create a column 'Name' based on the previous index
df1['Name']=df1.index
# 1) Select the index from column 'Name'
df1=df1.set_index('Name')
# If indexes are different, one may have to play with parameter how
gf1 = pd.DataFrame(np.random.randn(8, 3), columns=['A','B','C'], index=range(8))
gf2 = pd.DataFrame(np.random.randn(8, 1), columns=['D'], index=range(2,10))
gf3 = pd.DataFrame(np.random.randn(8, 2), columns=['E','F'], index=range(4,12))
gf = gf1.join(gf2, how='outer')
gf = gf.join(gf3, how='outer')
这是一种合并数据帧字典,同时使列名与字典同步的方法。如果需要,它还会填写缺失值:
def MergeDfDict(dfDict, onCols, how='outer', naFill=None):
keys = dfDict.keys()
for i in range(len(keys)):
key = keys[i]
df0 = dfDict[key]
cols = list(df0.columns)
valueCols = list(filter(lambda x: x not in (onCols), cols))
df0 = df0[onCols + valueCols]
df0.columns = onCols + [(s + '_' + key) for s in valueCols]
if (i == 0):
outDf = df0
else:
outDf = pd.merge(outDf, df0, how=how, on=onCols)
if (naFill != None):
outDf = outDf.fillna(naFill)
return(outDf)
def GenDf(size):
df = pd.DataFrame({'categ1':np.random.choice(a=['a', 'b', 'c', 'd', 'e'], size=size, replace=True),
'categ2':np.random.choice(a=['A', 'B'], size=size, replace=True),
'col1':np.random.uniform(low=0.0, high=100.0, size=size),
'col2':np.random.uniform(low=0.0, high=100.0, size=size)
})
df = df.sort_values(['categ2', 'categ1', 'col1', 'col2'])
return(df)
size = 5
dfDict = {'US':GenDf(size), 'IN':GenDf(size), 'GER':GenDf(size)}
MergeDfDict(dfDict=dfDict, onCols=['categ1', 'categ2'], how='outer', naFill=0)
pandas文档中还有另一种解决方案(我在这里看不到),
使用 .append
>>> df = pd.DataFrame([[1, 2], [3, 4]], columns=list('AB'))
A B
0 1 2
1 3 4
>>> df2 = pd.DataFrame([[5, 6], [7, 8]], columns=list('AB'))
A B
0 5 6
1 7 8
>>> df.append(df2, ignore_index=True)
A B
0 1 2
1 3 4
2 5 6
3 7 8
将ignore_index=True
被用来忽略所附数据帧的索引,在源一个可用下一个索引代替。
如果列名不同,Nan
将引入。