在SciPy中创建低通滤波器-了解方法和单位


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我正在尝试使用python过滤嘈杂的心率信号。因为心率永远不应该超过每分钟220次跳动,所以我想过滤掉所有220 bpm以上的噪音。我将220 /分钟转换为3.66666666赫兹,然后将该赫兹转换为rad / s,以获得23.0383461 rad / sec。

采集数据的芯片的采样频率为30Hz,因此我将其转换为rad / s以获得188.495559 rad / s。

在网上查找了一些东西之后,我发现了一些我想做成低通的带通滤波器的功能。这是带通代码的链接,所以我将其转换为:

from scipy.signal import butter, lfilter
from scipy.signal import freqs

def butter_lowpass(cutOff, fs, order=5):
    nyq = 0.5 * fs
    normalCutoff = cutOff / nyq
    b, a = butter(order, normalCutoff, btype='low', analog = True)
    return b, a

def butter_lowpass_filter(data, cutOff, fs, order=4):
    b, a = butter_lowpass(cutOff, fs, order=order)
    y = lfilter(b, a, data)
    return y

cutOff = 23.1 #cutoff frequency in rad/s
fs = 188.495559 #sampling frequency in rad/s
order = 20 #order of filter

#print sticker_data.ps1_dxdt2

y = butter_lowpass_filter(data, cutOff, fs, order)
plt.plot(y)

我对此感到非常困惑,因为我很确定黄油功能会以rad / s为单位输入截止频率和采样频率,但是我似乎得到了一个奇怪的输出。实际上是Hz吗?

其次,这两行的目的是什么:

    nyq = 0.5 * fs
    normalCutoff = cutOff / nyq

我知道这与标准化有关,但我认为奈奎斯特是采样频率的2倍,而不是一半。为什么要使用奈奎斯特作为归一化器?

有人可以解释更多有关如何使用这些功能创建过滤器的信息吗?

我使用以下方法绘制了过滤器:

w, h = signal.freqs(b, a)
plt.plot(w, 20 * np.log10(abs(h)))
plt.xscale('log')
plt.title('Butterworth filter frequency response')
plt.xlabel('Frequency [radians / second]')
plt.ylabel('Amplitude [dB]')
plt.margins(0, 0.1)
plt.grid(which='both', axis='both')
plt.axvline(100, color='green') # cutoff frequency
plt.show()

得到的结果显然不会以23 rad / s的速度截止:

结果

Answers:


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一些评论:

  • 奈奎斯特频率是采样率的一半。
  • 您正在使用定期采样的数据,因此需要数字滤波器而不是模拟滤波器。这意味着您不应analog=True在调用中使用butter,而应使用scipy.signal.freqz(而非freqs)来生成频率响应。
  • 这些简短实用程序功能的目标之一是允许您保留所有以Hz表示的频率。您不必转换为弧度/秒。只要您以一致的单位表示频率,实用程序功能中的缩放就可以为您进行标准化。

这是我对脚本的修改后的版本,后面是该脚本生成的图。

import numpy as np
from scipy.signal import butter, lfilter, freqz
import matplotlib.pyplot as plt


def butter_lowpass(cutoff, fs, order=5):
    nyq = 0.5 * fs
    normal_cutoff = cutoff / nyq
    b, a = butter(order, normal_cutoff, btype='low', analog=False)
    return b, a

def butter_lowpass_filter(data, cutoff, fs, order=5):
    b, a = butter_lowpass(cutoff, fs, order=order)
    y = lfilter(b, a, data)
    return y


# Filter requirements.
order = 6
fs = 30.0       # sample rate, Hz
cutoff = 3.667  # desired cutoff frequency of the filter, Hz

# Get the filter coefficients so we can check its frequency response.
b, a = butter_lowpass(cutoff, fs, order)

# Plot the frequency response.
w, h = freqz(b, a, worN=8000)
plt.subplot(2, 1, 1)
plt.plot(0.5*fs*w/np.pi, np.abs(h), 'b')
plt.plot(cutoff, 0.5*np.sqrt(2), 'ko')
plt.axvline(cutoff, color='k')
plt.xlim(0, 0.5*fs)
plt.title("Lowpass Filter Frequency Response")
plt.xlabel('Frequency [Hz]')
plt.grid()


# Demonstrate the use of the filter.
# First make some data to be filtered.
T = 5.0         # seconds
n = int(T * fs) # total number of samples
t = np.linspace(0, T, n, endpoint=False)
# "Noisy" data.  We want to recover the 1.2 Hz signal from this.
data = np.sin(1.2*2*np.pi*t) + 1.5*np.cos(9*2*np.pi*t) + 0.5*np.sin(12.0*2*np.pi*t)

# Filter the data, and plot both the original and filtered signals.
y = butter_lowpass_filter(data, cutoff, fs, order)

plt.subplot(2, 1, 2)
plt.plot(t, data, 'b-', label='data')
plt.plot(t, y, 'g-', linewidth=2, label='filtered data')
plt.xlabel('Time [sec]')
plt.grid()
plt.legend()

plt.subplots_adjust(hspace=0.35)
plt.show()

低通示例


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是,我确定。考虑一下“您需要以两倍的带宽采样”的措辞;也就是说采样率必须是信号带宽的两倍。
沃伦·韦克瑟

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换句话说:您正在以30 Hz采样。这意味着您的信号带宽不应超过15 Hz。奈奎斯特频率为15 Hz。
沃伦·韦克瑟

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恢复这一点:我在另一个线程中看到了使用filtfilt的建议,该建议执行向后/向前过滤而不是lfilter。您对此有何看法?
2014年

1
@Bar:这些评论不是解决您问题的正确位置。您可以创建一个新的stackoverflow问题,但主持人可能会关闭它,因为它不是编程问题。最好的地方可能是dsp.stackexchange.com
Warren Weckesser 2014年

1
@samjewell这是我似乎经常使用的随机数freqz。我喜欢平滑的图,它具有足够的超分辨率,可以放大一点而不必重新生成图,并且8000足够大,可以在大多数情况下完成该图。
沃伦·韦克瑟
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