Answers:
Makefile.am是一个程序员定义的文件，并且用于通过automake以生成Makefile.in文件（.am代表一个 UTO 米 AKE）。configure通常在源tarball中看到的脚本将使用Makefile.in生成一个Makefile。
该configure脚本本身是由一个程序员定义的文件生成的，该文件名为configure.acor或configure.in（不建议使用）。我喜欢.ac（为一个反对派ç ONF），因为它从产生它的区别Makefile.in文件和这样我可以有规则，如make dist-clean它运行rm -f *.in。由于它是生成的文件，因此通常不会存储在修订系统（例如Git，SVN，Mercurial或CVS）中，而应该存储在.ac文件中。
阅读有关GNU Autotools的更多信息。阅读make和Makefile第一，然后了解automake，autoconf，libtool，等。
.in扩展名意味着它是用于输入消息的输入configure，而不是应使用的最终文件（例如，带有make）。如果您对为什么这看起来“荒谬”复杂感到好奇，请尝试阅读：stackoverflow.com/a/26832773/939557 如今，随着GitHub等成为常见的发行渠道，autoconf的某些假设正在瓦解：人们正在获得直接从源代码控制工具获取源代码，而不使用维护者创建的源代码分发压缩包。
简单的例子
无耻地改编自：http ://www.gnu.org/software/automake/manual/html_node/Creating-amhello.html，并在Ubuntu 14.04 Automake 1.14.1上进行了测试。
Makefile.am
SUBDIRS = src
dist_doc_DATA = README.md
自述文件
Some doc.
configure.ac
AC_INIT([automake_hello_world], [1.0], [bug-automake@gnu.org])
AM_INIT_AUTOMAKE([-Wall -Werror foreign])
AC_PROG_CC
AC_CONFIG_HEADERS([config.h])
AC_CONFIG_FILES([
Makefile
src/Makefile
])
AC_OUTPUT
src / Makefile.am
bin_PROGRAMS = autotools_hello_world
autotools_hello_world_SOURCES = main.c
src / main.c
#include <config.h>
#include <stdio.h>
int main (void) {
puts ("Hello world from " PACKAGE_STRING);
return 0;
}
用法
autoreconf --install
mkdir build
cd build
../configure
make
sudo make install
autoconf_hello_world
sudo make uninstall
输出：
Hello world from automake_hello_world 1.0
笔记
autoreconf --install生成几个应该由Git跟踪的模板文件，包括Makefile.in。它只需要在第一次运行。
make install 安装：
/usr/local/binREADME.md 至 /usr/local/share/doc/automake_hello_world在GitHub上供您试用。
autoconf并automake：1）autoconf- 创建可交付使用的配置脚本
（安装程序以后将运行该脚本以生成Makefile）
2）automake-在数据文件中 创建可运送的Makefile.in
（配置将在以后读取以制作Makefile）
configure，make并且sudo make install：./configure # Creates Makefile (from Makefile.in).
make # Creates the application (from the Makefile just created).
sudo make install # Installs the application
# Often, by default its files are installed into /usr/local
下面的符号大致是：输入->程序->输出
DEVELOPER运行以下命令：
configure.ac - > autoconf的 - > 配置（脚本）---（* AC = 一个反对派ç ONF）
configure.in - > autoconf的 - > 配置（脚本）---（configure.in折旧使用configure.ac。）
Makefile.am - > 的automake - > Makefile.in -----------（。* 是 = 一个 UTO 米 AKE）
安装程序运行以下命令：
Makefile.in - > 配置 - > 生成文件（* 在 = 在放文件）
Makefile- > make ---------->（将新软件放入您的下载目录或临时目录中）
Makefile- > make install ->（将新软件放入系统目录中）
“ autoconf是M4宏的可扩展程序包，该程序包生成shell脚本以自动配置软件源代码包。这些脚本可以使程序包适应许多类UNIX系统，而无需用户手动干预。Autoconf通过以下方式为程序包创建配置脚本：模板文件，以M4宏调用的形式列出了程序包可以使用的操作系统功能。”
“ automake是一种用于自动生成符合GNU编码标准的Makefile.in文件的工具。Automake需要使用Autoconf。
手册：
免费的在线教程：
用于构建LibreOffice 的主要configure.ac超过12,000行代码，（但子文件夹中还有57个其他configure.ac文件。）
由此我生成的配置超过41k行代码。
而且，尽管Makefile.in和Makefile均为493行代码。（但是，子文件夹中还有768个Makefile.in。）
参考：
Makefile.am-自动输入的用户输入文件
configure.in-要自动配置的用户输入文件
autoconf从configure.in生成configure
automake使Makefile.am中的Makefile.in生效
配置从Makefile.in生成Makefile
例如：
$]
configure.in Makefile.in
$] sudo autoconf
configure configure.in Makefile.in ...
$] sudo ./configure
Makefile Makefile.in
.in？