在组对象上应用vs变换


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考虑以下数据帧:

     A      B         C         D
0  foo    one  0.162003  0.087469
1  bar    one -1.156319 -1.526272
2  foo    two  0.833892 -1.666304
3  bar  three -2.026673 -0.322057
4  foo    two  0.411452 -0.954371
5  bar    two  0.765878 -0.095968
6  foo    one -0.654890  0.678091
7  foo  three -1.789842 -1.130922

以下命令起作用:

> df.groupby('A').apply(lambda x: (x['C'] - x['D']))
> df.groupby('A').apply(lambda x: (x['C'] - x['D']).mean())

但以下任何一项均无效:

> df.groupby('A').transform(lambda x: (x['C'] - x['D']))
ValueError: could not broadcast input array from shape (5) into shape (5,3)

> df.groupby('A').transform(lambda x: (x['C'] - x['D']).mean())
 TypeError: cannot concatenate a non-NDFrame object

为什么? 文档上的示例似乎建议通过调用transform组,可以进行行操作处理:

# Note that the following suggests row-wise operation (x.mean is the column mean)
zscore = lambda x: (x - x.mean()) / x.std()
transformed = ts.groupby(key).transform(zscore)

换句话说,我认为转换本质上是一种特定的应用类型(不聚合)。我哪里错了?

供参考,以下是上面原始数据帧的构造:

df = pd.DataFrame({'A' : ['foo', 'bar', 'foo', 'bar',
                          'foo', 'bar', 'foo', 'foo'],
                   'B' : ['one', 'one', 'two', 'three',
                         'two', 'two', 'one', 'three'],
                   'C' : randn(8), 'D' : randn(8)})

1
传递给的函数transform必须返回数字,行或与参数相同的形状。如果是数字,则将数字设置为组中的所有元素;如果是行,则将其广播到组中的所有行。在您的代码中,lambda函数返回一列,该列无法广播到该组。
HYRY 2014年

1
谢谢@HYRY,但我很困惑。如果您看一下我在上面复制的文档中的示例(即使用zscore),则会transform收到一个lambda函数,该函数假定每个x都是内的一个项目group,并且还为组中的每个项目返回一个值。我想念什么?
阿梅利奥·瓦兹奎兹·雷纳

对于那些寻求非常详细的解决方案的人,请参阅下面的内容
泰德·彼得鲁

@TedPetrou:其tl; dr是:1)apply传递整个df,但transform将每个列作为Series分别传递。2)apply可以返回任何形状输出(标量/系列/数据框架/数组/列表...),而transform必须返回与组长度相同的序列(一维系列/数组/列表)。这就是为什么OP需要apply()transform()。这是一个很好的问题,因为文档没有明确解释这两种差异。(类似于apply/map/applymap或其他事物之间的区别...)
smci

Answers:


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apply和之间的两个主要区别transform

transformapplygroupby方法之间有两个主要区别。

  • 输入:
    • apply将每个组的所有列作为DataFrame隐式传递给自定义函数。
    • 同时transform将每个组的每一列作为系列分别传递给自定义函数。
  • 输出:
    • 传递给的自定义函数apply可以返回标量,或者返回Series或DataFrame(或numpy数组,甚至是list)
    • 传递给的自定义函数transform必须返回与group长度相同的序列(一维Series,数组或列表)。

因此,transform一次只能处理一个Series,而一次apply可以处理整个DataFrame。

检查自定义功能

检查传递给applyor的自定义函数的输入可能会很有帮助transform

例子

让我们创建一些示例数据并检查组,以便您可以了解我在说什么:

import pandas as pd
import numpy as np
df = pd.DataFrame({'State':['Texas', 'Texas', 'Florida', 'Florida'], 
                   'a':[4,5,1,3], 'b':[6,10,3,11]})

     State  a   b
0    Texas  4   6
1    Texas  5  10
2  Florida  1   3
3  Florida  3  11

让我们创建一个简单的自定义函数,该函数打印出隐式传递的对象的类型,然后引发一个错误,以便可以停止执行。

def inspect(x):
    print(type(x))
    raise

现在,让我们将此函数传递给groupby applytransformmethod,以查看传递给它的对象:

df.groupby('State').apply(inspect)

<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
<class 'pandas.core.frame.DataFrame'>
RuntimeError

如您所见,DataFrame被传递到inspect函数中。您可能想知道为什么将DataFrame类型打印两次。熊猫两次参加第一组比赛。这样做是为了确定是否存在快速完成计算的方法。这是您不应该担心的次要细节。

现在,让我们用 transform

df.groupby('State').transform(inspect)
<class 'pandas.core.series.Series'>
<class 'pandas.core.series.Series'>
RuntimeError

它传递了一个Series-一个完全不同的Pandas对象。

因此,一次transform只能使用一个系列。它并非不可能同时作用于两根色谱柱。因此,如果尝试ab自定义函数中减去column ,则会出现错误transform。见下文:

def subtract_two(x):
    return x['a'] - x['b']

df.groupby('State').transform(subtract_two)
KeyError: ('a', 'occurred at index a')

当熊猫试图找到a不存在的Series索引时,我们得到一个KeyError 。您可以通过完整apply的DataFrame 来完成此操作:

df.groupby('State').apply(subtract_two)

State     
Florida  2   -2
         3   -8
Texas    0   -2
         1   -5
dtype: int64

输出是一个Series,并且保留了原始索引,因此有些混乱,但是我们可以访问所有列。


显示传递的熊猫对象

它可以在自定义函数中显示整个pandas对象,从而提供更多帮助,因此您可以确切地看到所使用的对象。您可以使用print我喜欢使用模块中的display函数的语句,IPython.display以便在Jupyter笔记本中以HTML形式很好地输出DataFrame:

from IPython.display import display
def subtract_two(x):
    display(x)
    return x['a'] - x['b']

屏幕截图: 在此处输入图片说明


变换必须返回与组大小相同的一维序列

另一个区别是transform必须返回与该组相同大小的一维序列。在这种特定情况下,每个组都有两行,因此transform必须返回两行的序列。如果没有,则会引发错误:

def return_three(x):
    return np.array([1, 2, 3])

df.groupby('State').transform(return_three)
ValueError: transform must return a scalar value for each group

该错误消息并不能真正说明问题。您必须返回与组长度相同的序列。因此,这样的功能将起作用:

def rand_group_len(x):
    return np.random.rand(len(x))

df.groupby('State').transform(rand_group_len)

          a         b
0  0.962070  0.151440
1  0.440956  0.782176
2  0.642218  0.483257
3  0.056047  0.238208

返回单个标量对象也适用于 transform

如果仅从自定义函数返回单个标量,transform则将其用于组中的每一行:

def group_sum(x):
    return x.sum()

df.groupby('State').transform(group_sum)

   a   b
0  9  16
1  9  16
2  4  14
3  4  14

3
np没有定义。如果您import numpy as np将答案包括在内,我想初学者将不胜感激。
Qaswed

187

就像我对.transform操作vs 感到困惑一样,.apply我找到了一些答案,这使我对该问题有所了解。例如,此答案非常有帮助。

到目前为止,我的建议是彼此隔离地.transform处理(或处理)Series(列)。这意味着在最后两个呼叫中:

df.groupby('A').transform(lambda x: (x['C'] - x['D']))
df.groupby('A').transform(lambda x: (x['C'] - x['D']).mean())

您要求.transform从两列中获取值,而“它”实际上并没有同时“看到”它们(可以这么说)。transform将逐一查看数据框列,然后返回一系列“(由一系列)标量组成的”(或一组系列),这些标量被重复了len(input_column)几次。

因此,应使用此标量.transform来使之Series成为输入上应用某种归约函数的结果Series(并且一次只能应用于一个系列/列)。

考虑以下示例(在您的数据框上):

zscore = lambda x: (x - x.mean()) / x.std() # Note that it does not reference anything outside of 'x' and for transform 'x' is one column.
df.groupby('A').transform(zscore)

将产生:

       C      D
0  0.989  0.128
1 -0.478  0.489
2  0.889 -0.589
3 -0.671 -1.150
4  0.034 -0.285
5  1.149  0.662
6 -1.404 -0.907
7 -0.509  1.653

这与您一次只在一列上使用它完全相同:

df.groupby('A')['C'].transform(zscore)

产生:

0    0.989
1   -0.478
2    0.889
3   -0.671
4    0.034
5    1.149
6   -1.404
7   -0.509

请注意,.apply在上一个示例(df.groupby('A')['C'].apply(zscore))中,它的工作方式完全相同,但是如果您尝试在数据帧上使用它,它将失败:

df.groupby('A').apply(zscore)

给出错误:

ValueError: operands could not be broadcast together with shapes (6,) (2,)

那么还有什么.transform用处呢?最简单的情况是尝试将归约函数的结果分配回原始数据帧。

df['sum_C'] = df.groupby('A')['C'].transform(sum)
df.sort('A') # to clearly see the scalar ('sum') applies to the whole column of the group

产生:

     A      B      C      D  sum_C
1  bar    one  1.998  0.593  3.973
3  bar  three  1.287 -0.639  3.973
5  bar    two  0.687 -1.027  3.973
4  foo    two  0.205  1.274  4.373
2  foo    two  0.128  0.924  4.373
6  foo    one  2.113 -0.516  4.373
7  foo  three  0.657 -1.179  4.373
0  foo    one  1.270  0.201  4.373

尝试用同样.apply会给NaNssum_C。因为.apply会返回reduce Series,所以它不知道如何广播回去:

df.groupby('A')['C'].apply(sum)

给予:

A
bar    3.973
foo    4.373

在某些情况下,什么时候.transform用于过滤数据:

df[df.groupby(['B'])['D'].transform(sum) < -1]

     A      B      C      D
3  bar  three  1.287 -0.639
7  foo  three  0.657 -1.179

我希望这可以增加一些清晰度。


4
我的天啊。区别是如此微妙。
大维

3
.transform()也可以用于填充缺失值。特别是如果您要向NaN该组中的值广播组均值或组统计信息。不幸的是,熊猫文档对我也没有帮助。
网络数学

我认为在最后一种情况下,会.groupby().filter()做同样的事情。感谢您的解释,这.apply().transform()让我感到困惑。
嘉祥

这就解释了为什么df.groupby().transform()不能为子组df工作,我总是会收到错误,ValueError: transform must return a scalar value for each group因为transform一一看到一列
jerrytim,

我真的很喜欢最后一个用于过滤数据的示例.transform。超好!
Rishi Jain

13

我将使用一个非常简单的代码片段来说明不同之处:

test = pd.DataFrame({'id':[1,2,3,1,2,3,1,2,3], 'price':[1,2,3,2,3,1,3,1,2]})
grouping = test.groupby('id')['price']

DataFrame看起来像这样:

    id  price   
0   1   1   
1   2   2   
2   3   3   
3   1   2   
4   2   3   
5   3   1   
6   1   3   
7   2   1   
8   3   2   

该表中有3个客户ID,每个客户进行三笔交易,每次支付1,2,3美元。

现在,我想找到每个客户的最低付款额。有两种方法:

  1. 使用apply

    grouping.min()

回报看起来像这样:

id
1    1
2    1
3    1
Name: price, dtype: int64

pandas.core.series.Series # return type
Int64Index([1, 2, 3], dtype='int64', name='id') #The returned Series' index
# lenght is 3
  1. 使用transform

    分组变换(最小值)

回报看起来像这样:

0    1
1    1
2    1
3    1
4    1
5    1
6    1
7    1
8    1
Name: price, dtype: int64

pandas.core.series.Series # return type
RangeIndex(start=0, stop=9, step=1) # The returned Series' index
# length is 9    

这两个方法都返回一个Series对象,但是第一个的对象length为3,length第二个的对象为9。

如果要回答What is the minimum price paid by each customer,则该apply方法是更适合选择的一种。

如果要回答What is the difference between the amount paid for each transaction vs the minimum payment,则要使用transform,因为:

test['minimum'] = grouping.transform(min) # ceates an extra column filled with minimum payment
test.price - test.minimum # returns the difference for each row

Apply 不能简单地在这里工作,因为它返回的是大小为3的Series,但是原始df的长度为9。您无法轻松地将其集成回原始df。


3
我认为这是一个很好的答案!感谢您在提出问题后四年多的时间里花时间回答问题!
本杰明·杜布勒

4
tmp = df.groupby(['A'])['c'].transform('mean')

就好像

tmp1 = df.groupby(['A']).agg({'c':'mean'})
tmp = df['A'].map(tmp1['c'])

要么

tmp1 = df.groupby(['A'])['c'].mean()
tmp = df['A'].map(tmp1)
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