熊猫concat:ValueError:传递的值的形状等等,索引暗示blah2


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我正在尝试合并(Pandas 14.1)数据框和一系列数据。该系列应该形成一个带有一些NA的新列(因为该系列的索引值是数据帧的索引值的子集)。

这适用于玩具示例,但不适用于我的数据(详细信息如下)。

例:

import pandas as pd
import numpy as np

df1 = pd.DataFrame(np.random.randn(6, 4), columns=['A', 'B', 'C', 'D'], index=pd.date_range('1/1/2011', periods=6, freq='D'))
df1

A   B   C   D
2011-01-01  -0.487926   0.439190    0.194810    0.333896
2011-01-02  1.708024    0.237587    -0.958100   1.418285
2011-01-03  -1.228805   1.266068    -1.755050   -1.476395
2011-01-04  -0.554705   1.342504    0.245934    0.955521
2011-01-05  -0.351260   -0.798270   0.820535    -0.597322
2011-01-06  0.132924    0.501027    -1.139487   1.107873

s1 = pd.Series(np.random.randn(3), name='foo', index=pd.date_range('1/1/2011', periods=3, freq='2D'))
s1

2011-01-01   -1.660578
2011-01-03   -0.209688
2011-01-05    0.546146
Freq: 2D, Name: foo, dtype: float64

pd.concat([df1, s1],axis=1)

A   B   C   D   foo
2011-01-01  -0.487926   0.439190    0.194810    0.333896    -1.660578
2011-01-02  1.708024    0.237587    -0.958100   1.418285    NaN
2011-01-03  -1.228805   1.266068    -1.755050   -1.476395   -0.209688
2011-01-04  -0.554705   1.342504    0.245934    0.955521    NaN
2011-01-05  -0.351260   -0.798270   0.820535    -0.597322   0.546146
2011-01-06  0.132924    0.501027    -1.139487   1.107873    NaN

数据的情况(见下文)似乎基本相同-用DatetimeIndex封装一个序列,该DatetimeIndex的值是数据帧的子集。但是它在标题中给出了ValueError(blah1 =(5,286)blah2 =(5,276))。为什么不起作用?:

In[187]: df.head()
Out[188]:
high    low loc_h   loc_l
time                
2014-01-01 17:00:00 1.376235    1.375945    1.376235    1.375945
2014-01-01 17:01:00 1.376005    1.375775    NaN NaN
2014-01-01 17:02:00 1.375795    1.375445    NaN 1.375445
2014-01-01 17:03:00 1.375625    1.375515    NaN NaN
2014-01-01 17:04:00 1.375585    1.375585    NaN NaN
In [186]: df.index
Out[186]:
<class 'pandas.tseries.index.DatetimeIndex'>
[2014-01-01 17:00:00, ..., 2014-01-01 21:30:00]
Length: 271, Freq: None, Timezone: None

In [189]: hl.head()
Out[189]:
2014-01-01 17:00:00    1.376090
2014-01-01 17:02:00    1.375445
2014-01-01 17:05:00    1.376195
2014-01-01 17:10:00    1.375385
2014-01-01 17:12:00    1.376115
dtype: float64

In [187]:hl.index
Out[187]:
<class 'pandas.tseries.index.DatetimeIndex'>
[2014-01-01 17:00:00, ..., 2014-01-01 21:30:00]
Length: 89, Freq: None, Timezone: None

In: pd.concat([df, hl], axis=1)
Out: [stack trace] ValueError: Shape of passed values is (5, 286), indices imply (5, 276)

2
您尝试了append替代concat吗?如果我理解ValueError正确的话,就是说有286行数据,但是数据帧的索引期望有276行。尝试签出len(df.index)len(h1.index)
alacy 2014年

df.append(hl)失败,并发生TypeError:“ NoneType”对象不可迭代。但是后来我尝试加入-谢谢!:)
birone 2014年

没问题。确保将您的答案标记为正确,以便将来的SO用户在遇到类似问题时可以快速找到您的解决方案。
alacy 2014年

会...当它允许我时。
birone 2014年

3
该错误消息可能会更有帮助,例如说“您可能有一些重复的索引” ...
wordforthewise,

Answers:


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我有一个类似的问题(join可行,但concat失败了)。

检查重复索引值df1s1(例如df1.index.is_unique

删除重复的索引值(例如df.drop_duplicates(inplace=True))或此处https://stackoverflow.com/a/34297689/7163376中的一种方法应可以解决该问题。


3
那工作了,谢谢!我正在这样做:df = pd.concat([df1,df2],axis = 1,join_axes = [df1.index])。如果我在df2中有dups,则出现此错误。之所以有意义,是因为它不知道如何在两个DF之间映射多个重复的索引。
麻雀

1
要删除重复的索引,请使用df = df.loc[df.index.drop_duplicates()]。CF pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/generated/...
BallpointBen

1
建议在两个索引中检查重复的索引值可能会帮助许多人阅读此问题
dsugasa

27

我的问题是不同的索引,以下代码解决了我的问题。

df1.reset_index(drop=True, inplace=True)
df2.reset_index(drop=True, inplace=True)
df = pd.concat([df1, df2], axis=1)

2
您忘记了inplace=True
Alaa M.

4

要删除重复的索引,请使用df = df.loc[df.index.drop_duplicates()]。CF pandas.pydata.org/pandas-docs/stable/generated/... - BallpointBen 4月18日15:25

这是错误的,但是由于声誉低下,我无法直接回复BallpointBen的评论。错误的原因是df.index.drop_duplicates()返回唯一索引列表,但是当您使用这些唯一索引将其索引回到数据框时,它仍会返回所有记录。我认为这很可能是因为使用重复索引之一的索引将返回该索引的所有实例。

而是使用df.index.duplicated(),它返回一个布尔值列表(添加~以获得未重复的记录):

df = df.loc[~df.index.duplicated()]

3

Aus_lacy的帖子给了我尝试相关方法的想法,其中join确实起作用:

In [196]:

hl.name = 'hl'
Out[196]:
'hl'
In [199]:

df.join(hl).head(4)
Out[199]:
high    low loc_h   loc_l   hl
2014-01-01 17:00:00 1.376235    1.375945    1.376235    1.375945    1.376090
2014-01-01 17:01:00 1.376005    1.375775    NaN NaN NaN
2014-01-01 17:02:00 1.375795    1.375445    NaN 1.375445    1.375445
2014-01-01 17:03:00 1.375625    1.375515    NaN NaN NaN

可以理解为什么concat可以在示例中工作,但不能提供此数据!


3

您的索引可能包含重复的值。

import pandas as pd

T1_INDEX = [
    0,
    1,  # <= !!! if I write e.g.: "0" here then it fails
    0.2,
]
T1_COLUMNS = [
    'A', 'B', 'C', 'D'
]
T1 = [
    [1.0, 1.1, 1.2, 1.3],
    [2.0, 2.1, 2.2, 2.3],
    [3.0, 3.1, 3.2, 3.3],
]

T2_INDEX = [
    1.2,
    2.11,
]

T2_COLUMNS = [
    'D', 'E', 'F',
]
T2 = [
    [54.0, 5324.1, 3234.2],
    [55.0, 14.5324, 2324.2],
    # [3.0, 3.1, 3.2],
]
df1 = pd.DataFrame(T1, columns=T1_COLUMNS, index=T1_INDEX)
df2 = pd.DataFrame(T2, columns=T2_COLUMNS, index=T2_INDEX)


print(pd.concat([pd.DataFrame({})] + [df2, df1], axis=1))


-3

我尝试了加入和追加,但没有一个起作用。我在代码的这一部分使用了“ try:...,除了:continue”,它运行良好。

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