安装Graphviz 2.38后，“ RuntimeError：确保Graphviz可执行文件在系统路径上”

我下载了Graphviz 2.38MSI版本并安装在文件夹下C:\Python34，然后运行pip install Graphviz，一切顺利。在系统的路径中，我添加了C:\Python34\bin。在尝试在线运行测试脚本时filename=dot.render(filename='test')，我收到一条消息

 RuntimeError: failed to execute ['dot', '-Tpdf', '-O', 'test'], make sure the Graphviz executables are on your systems' path

我试图"C:\Python34\bin\dot.exe"输入系统的路径，但是它没有用，甚至创建了一个"GRAPHVIZ_DOT"带有value 的新环境变量"C:\Python34\bin\dot.exe"，但仍然没有用。我尝试卸载Graphviz和pip uninstall graphviz，然后重新安装并再次进行pip安装，但是没有任何效果。

整个回溯消息是：

Traceback (most recent call last):
  File "C:\Python34\lib\site-packages\graphviz\files.py", line 220, in render
    proc = subprocess.Popen(cmd, startupinfo=STARTUPINFO)
  File "C:\Python34\lib\subprocess.py", line 859, in __init__
    restore_signals, start_new_session)
  File "C:\Python34\lib\subprocess.py", line 1112, in _execute_child
    startupinfo)
FileNotFoundError: [WinError 2] The system cannot find the file specified

During handling of the above exception, another exception occurred:

Traceback (most recent call last):
  File "C:\Users\Documents\Kissmetrics\curves and lines\eventNodes.py", line 56, in <module>
    filename=dot.render(filename='test')
  File "C:\Python34\lib\site-packages\graphviz\files.py", line 225, in render
    'are on your systems\' path' % cmd)
RuntimeError: failed to execute ['dot', '-Tpdf', '-O', 'test'], make sure the Graphviz executables are on your systems' path

有人有经验吗？

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'D:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/'

在Windows中，只需在开头添加这两行，其中“ D：/ Program Files（x86）/Graphviz2.38/bin/”将替换为bin文件所在的地址。

那解决了问题。

您应该在系统中安装graphviz软件包（而不仅仅是python软件包）。在Ubuntu上，您应该尝试：

sudo apt-get install graphviz

这是我在MAC上为我解决的问题：

  brew install graphviz

对于Windows：

1. 从以下位置安装Windows软件包：https : //graphviz.gitlab.io/_pages/Download/Download_windows.html
2. 安装python graphviz包
3. 添加C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin到用户路径
4. 添加C:\Program Files (x86)\Graphviz2.38\bin\dot.exe到系统路径

这对我有用！

尝试使用：

conda install python-graphviz

如果使用，graphviz可执行文件与conda目录位于不同的路径pip install graphviz。

OSX Sierra，Python 2.7，Graphviz 2.38

使用pip install graphviz和conda install graphviz解决了该问题。

pip只得到与您相同的路径问题，并且conda只得到导入错误。

只需将以下内容添加到 Windows上的环境变量（系统）路径

C：\ Program档案（x86）\ Graphviz2.38 \ bin

在那里，您可以找到 .exe文件

如果不行

在您的程序文件中而不是python lib中找到Graphviz2.38 / bin文件夹

然后，添加到您的PATH

找到存在.exe文件的文件夹很重要

步骤1：安装Graphviz二进制文件

视窗：

1. 从http://www.graphviz.org/download/下载Graphviz
2. 在下面添加到PATH环境变量中（提及已安装的graphviz版本）：
   • C：\ Program档案（x86）\ Graphviz2.38 \ bin
   • C：\ Program Files（x86）\ Graphviz2.38 \ bin \ dot.exe
3. 关闭所有打开的Juypter笔记本和命令提示符
4. 重新启动Jupyter / cmd提示并测试

Linux：

1. sudo apt-get更新
2. 须藤apt-get install graphviz
3. 或从http://www.graphviz.org/download/手动构建

步骤2：为Python安装graphviz模块

点：

• 点安装graphviz

康达：

• 康达安装graphviz

尝试conda install graphviz。我有同样的问题，我通过MacOS中提到的命令解决了。

对我来说，在Windows10上使用conda install graphviz和conda install python-graphviz安装GraphViz所需的路径是C：/ ProgramData / Anaconda3 / Library / bin / graphviz /。即添加

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'C:/ProgramData/Anaconda3/Library/bin/graphviz/'

为我解决了这个问题。

conda install python-graphviz

对于Windows，请安装Python Graphviz，它将在路径中包含可执行文件。

在Ubuntu Linux上，这为我解决了问题：

pip install graphviz
sudo apt-get install graphviz

conda install -c conda-forge graphviz如果使用Anaconda，也可以尝试代替pip。

在为自己解决此问题时，我使用了此GitHub教程，该教程分析了导致此问题的原因。如果我们在两行之间阅读，它说它需要系统以及python graph viz。除了conda install，我们还需要运行：

conda install -c conda-forge python-graphviz

然后重启内核；它就像一个魅力。

1）Graphviz –在系统的特定位置下载解压缩文件（pip在Windows中不起作用），并在每个程序中手动设置的路径中包含bin文件夹（“在Windows中设置环境变量”或）

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'C:/GraphViz/bin'

2）然后将模型绘制

clf = xgb.train(params, d_train, 1000, evals=evallist, early_stopping_rounds=10)
xgb.plot_tree(clf)
plt.rcParams['figure.figsize'] = [50, 10]
plt.show()

安装软件包后（如果尚未安装，请链接），将dot.exe的路径添加为新的系统变量。

默认路径是：

C：\ Program Files（x86）\ Graphviz2.38 \ bin \ dot.exe

我在使用Jupyter的Linux上遇到了相同的问题。

为了解决这个问题，我已经将点库添加到python sys.path中

首先：检查是否dot已安装，

然后：
找到他的路径whereis dot-> / local / notebook / miniconda2 / envs / ik2 / bin / dot

最后在python脚本中：sys.path.append（“ / local / notebook / miniconda2 / envs / ik2 / bin / dot”）

首先，您应该使用pip install，然后在http://www.graphviz.org/Download_windows.php中下载另一个软件包 ，并将安装位置添加到环境路径中，然后它可以工作。

在Mac OS（El Capitan）上，我使用PyCharm IDE遇到了相同的错误消息。我已按照RZK的答案中的建议使用brew安装了Graphviz，并使用PyCharm 安装了graphviz python软件包（我可以通过dot -V在终端中尝试并获取以下内容来检查Graphviz是否已正确安装：dot - graphviz version 2.40.1 (20161225.0304)）。但是，当尝试从PyCharm调用Graphviz时，我仍然收到错误消息。

我必须按照此问题的答案中的建议，在PyCharm选项中添加路径/ usr / local / bin 。

这显示了一些路径问题：

pip install graphviz

所以这对我有用：

sudo apt-get install graphviz

我在macOS Catalina 10.15.3上，并且遇到了类似的错误： ExecutableNotFound: failed to execute ['dot', '-Tsvg'], make sure the Graphviz executables are on your systems' PATH

使用以下方法修复了该问题：

pip3 install graphviz 和 brew install graphviz

请注意，pip3 install只会返回成功消息，Successfully installed graphviz-0.13.2因此我们仍然需要运行brew install以获得graphviz 2.42.3（截至2020年3月10日，下午6点）。

对于没有root权限并因此无法sudo按照其他答案中的建议使用命令的Linux用户...

首先，通过以下方法激活您的conda虚拟环境（如果要使用）：

source activate virtual-env-name

然后安装graphviz，即使您已经使用pip完成了它：

conda install graphviz

然后复制以下命令的结果：

whereis dot

就我而言，其输出为：

/home/nader/anaconda2/bin/dot

并将其添加到您的PATH变量中。只需运行以下命令

nano ~/.bashrc

并将这些行添加到打开的文件的末尾：

PATH="/home/username/anaconda2/bin/dot:$PATH"
export PATH

现在按Ctrl+ O，然后Ctrl+ X保存并退出。

现在应该解决问题。

Pycharm用户，请注意：Pycharm并不总是看到与您的终端相同的PATH变量。该解决方案不适用于Pycharm以及其他IDE。但是您可以通过添加以下代码行来解决此问题：

os.environ["PATH"] += os.pathsep + '/home/nader/anaconda2/bin'

到您的python程序。不要忘记

import os

首先:)

编辑：如果您不想使用conda，您仍然可以在没有任何root权限的情况下从此处安装graphviz ，并将bin文件夹添加到PATH变量中。我没有测试。

1.从以下位置安装Windows软件包：https ://graphviz.gitlab.io/_pages/Download/Download_windows.html 并下载msi文件

添加环境变量2.将C：\ Program Files（x86）\ Graphviz2.38 \ bin添加到用户路径

3. 将C：\ Program Files（x86）\ Graphviz2.38 \ bin \ dot.exe添加到系统路径

4. 重新启动您的python笔记本。

会的。

将graphviz添加到系统路径

1. Windows-编辑系统环境变量。
2. 选择环境变量。
3. 选择路径-新建
4. 添加graphviz的路径

例如：C：\ Users \ AppData \ Local \ Continuum \ anaconda3 \ Library \ bin \ graphviz

OS Mojave 10.14。，Python 3.6

使用pip install graphviz在终端上有很好的反馈，但是当我尝试在Jupyter笔记本中绘制图形时导致使用此错误。然后brew install graphviz，我运行，这在终端中给出了错误。然后我跑conda install graphviz了，图开始工作了。

来自@Leighton的评论：pip仅会遇到与您相同的路径问题，而conda仅会导致导入错误。

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + "/Macintosh HD⁩/anaconda3⁩/lib⁩/⁨python3.7⁩/site-packages⁩/sphinx⁩/templates⁩/graphviz"

这为我解决了MAC上的PATH问题！

如果您不是使用Conda而是使用Vanilla Python，则“ brew install graphviz”有效。

#Write this on anaconda prompt in admin mode
conda install -c anaconda graphviz
conda install -c conda-forge python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/broken python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/cf201901 python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/cf202003 python-graphviz

#check dot -v in window's cmd prompt
C:\WINDOWS\system32>dot -V
dot - graphviz version 2.38.0 (20140413.2041)
(this means graphviz installed successfully)

#Add path to sys and user eve variables
PATH
C:\Anaconda3\pkgs\graphviz-2.38-hfd603c8_2\Library\bin
(search bin folder of graphviz and then copy n paste path in env variables)

#Re-run all cmds in jyupter notebook
#if error occurs (less chances)
#then 
#Restart anaconda and again run all cmds in jyupter notebook
eg.
import graphviz as gp
with open("tree.dot") as f:
    dot_read=f.read()
display(gp.Source(dot_read))

尝试在anaconda提示中一一键入以下代码。

这对我有用。

资料来源：https : //anaconda.org/conda-forge/python-graphviz

conda install -c conda-forge python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/broken python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/cf201901 python-graphviz
conda install -c conda-forge/label/cf202003 python-graphviz 

尝试在python import sys中做到这一点！conda install --yes --prefix {sys.prefix} graphviz import graphviz