如何在Jupyter Notebook中设置环境变量

我有一个问题，Jupyter在bashrc文件中看不到env变量，有没有办法在jupyter中加载这些变量或向其中添加自定义变量？

要在jupyter笔记本中设置env变量，只需使用%魔术命令%env或%set_env，例如%env MY_VAR=MY_VALUE或%env MY_VAR MY_VALUE。（单独使用%env以打印当前的环境变量。）

请参阅：http : //ipython.readthedocs.io/en/stable/interactive/magics.html

您还可以在kernel.json文件中设置变量：

如果每次启动jupyter内核时都需要相同的环境变量，特别是如果您有多组环境变量用于不同的任务，则我的解决方案很有用。

要使用环境变量创建新的ipython内核，请执行以下操作：

• 请阅读https://jupyter-client.readthedocs.io/en/stable/kernels.html#kernel-specs上的文档
• 运行jupyter kernelspec list以查看包含已安装内核以及文件存储位置的列表。
• 将包含kernel.json的目录（例如名为python2）复制到新目录（例如python2_myENV）。
• display_name在新kernel.json文件中更改。
• 添加env定义环境变量的字典。

您的内核json可能看起来像这样（除了display_name和，我没有对已安装的kernel.json进行任何修改env）：

{
 "display_name": "Python 2 with environment",
 "language": "python",
 "argv": [
  "/usr/bin/python2",
  "-m",
  "ipykernel_launcher",
  "-f",
  "{connection_file}"
 ],
 "env": {"LD_LIBRARY_PATH":""}
}

这种方法的用例和优点

• 在我的用例中，我想设置变量LD_LIBRARY_PATH，该变量影响如何加载已编译模块（例如，用C编写）。使用设置此变量%set_env无效。
• 我可以在不同的环境中使用多个python内核。
• 要更改环境，我只需要切换/重新启动内核，而不必重新启动jupyter实例（很有用，如果我不想在另一个笔记本中松开变量）。参见-但是-https: //github.com/jupyter/notebook/issues/2647

如果您使用的是Python，则可以在.env文件中定义环境变量，然后使用python-dotenv从Jupyter笔记本中加载它们。

安装python-dotenv：

pip install python-dotenv

将.env文件加载到Jupyter笔记本中：

%load_ext dotenv
%dotenv

您可以按照以下步骤在代码中设置环境变量：

import sys,os,os.path
sys.path.append(os.path.expanduser('~/code/eol_hsrl_python'))
os.environ['HSRL_INSTRUMENT']='gvhsrl'
os.environ['HSRL_CONFIG']=os.path.expanduser('~/hsrl_config')

如果要获得永久性修复，这当然是一种临时修复，您可能需要将变量导出到您的~.profile，更多信息可以在这里找到

如果你需要的变量设置你开始在笔记本前，只有为我工作的解决方案是env VARIABLE=$VARIABLE jupyter notebook用export VARIABLE=value在.bashrc。

在我的情况下，tensorflow需要导出的变量才能成功将其导入到笔记本中。

我遇到了一个陷阱：以下两个命令是等效的。请注意，第一个不能使用引号。有点违反直觉的是，使用时对字符串进行引用%env VAR ...将导致引号包含在变量值中，这可能不是您想要的。

%env MYPATH=C:/Folder Name/file.txt

和

import os
os.environ['MYPATH'] = "C:/Folder Name/file.txt"

如果您使用的是systemd，我刚刚发现您似乎必须将它们添加到systemd单元文件中。这在Ubuntu 16上。将它们放入.profile和.bashrc（甚至/ etc / profile）中，导致juypter笔记本中不提供ENV Vars。

我必须编辑：

/lib/systemd/system/jupyer-notebook.service

并输入要在单位文件中读取的变量，例如：

Environment=MYOWN_VAR=theVar

只有到那时，我才能从juypter笔记本中阅读它。

一个相关的（短期）解决方案是将环境变量存储在一个可预测格式的单个文件中，该文件可在启动终端和/或读入笔记本时获取。例如，我有一个文件，.env其环境变量定义的格式为VARIABLE_NAME=VARIABLE_VALUE（无空行或多余空格）。您可以在开始新的终端会话时在.bashrc或.bash_profile文件中获取此文件，也可以使用类似以下内容的文件将其读入笔记本：

import os
env_vars = !cat ../script/.env
for var in env_vars:
    key, value = var.split('=')
    os.environ[key] = value

我使用了一个相对路径来显示此.env文件可以存在于任何位置，并且可以相对于包含笔记本文件的目录进行引用。这也具有不在代码中的任何位置显示变量值的优点。