如何在Python中计算逻辑Sigmoid函数?


145

这是逻辑S形函数:

在此处输入图片说明

我知道x。我现在如何在Python中计算F(x)?

假设x = 0.458。

F(x)=?

Answers:


218

应该这样做:

import math

def sigmoid(x):
  return 1 / (1 + math.exp(-x))

现在,您可以通过调用以下命令进行测试:

>>> sigmoid(0.458)
0.61253961344091512

更新:请注意,以上内容主要旨在将给定表达式直接一对一转换为Python代码。它没有经过测试或已知是数字上正确的实现。如果您知道您需要一个非常强大的实现,那么我相信其他人实际上已经对此问题进行了一些思考。


7
只是因为我经常需要尝试一些小事情:sigmoid = lambda x: 1 / (1 + math.exp(-x))
Martin Thoma 2014年

2
这不适用于x的极负值。我一直在使用这个不幸的实现,直到我发现它正在创建NaN。
Neil G

3
如果用替换math.expnp.exp则不会得到NaN,尽管会收到运行时警告。
理查德·拉斯特

2
math.exp与numpy数组一起使用会产生一些错误,例如:TypeError: only length-1 arrays can be converted to Python scalars。为了避免它,您应该使用numpy.exp
ViniciusArruda

可以通过x = max(-709,x)在表达式前添加来减轻数值不稳定性吗?
Elias Hasle

201

它也可以在scipy中使用:http ://docs.scipy.org/doc/scipy/reference/produced/scipy.stats.logistic.html

In [1]: from scipy.stats import logistic

In [2]: logistic.cdf(0.458)
Out[2]: 0.61253961344091512

这只是另一个scipy函数的昂贵包装器(因为它允许您缩放和翻译逻辑函数):

In [3]: from scipy.special import expit

In [4]: expit(0.458)
Out[4]: 0.61253961344091512

如果您担心表演,请继续阅读,否则请使用expit

一些基准测试:

In [5]: def sigmoid(x):
  ....:     return 1 / (1 + math.exp(-x))
  ....: 

In [6]: %timeit -r 1 sigmoid(0.458)
1000000 loops, best of 1: 371 ns per loop


In [7]: %timeit -r 1 logistic.cdf(0.458)
10000 loops, best of 1: 72.2 µs per loop

In [8]: %timeit -r 1 expit(0.458)
100000 loops, best of 1: 2.98 µs per loop

正如预期的那样logistic.cdf(比)慢expit。当用单个值调用时,它expit仍然比python sigmoid函数要慢,因为它是用C(http://docs.scipy.org/doc/numpy/reference/ufuncs.html)编写的通用函数,因此具有调用开销。expit当使用单个值调用时,此开销大于其编译性质给定的计算速度。但是当涉及到大数组时,它可以忽略不计:

In [9]: import numpy as np

In [10]: x = np.random.random(1000000)

In [11]: def sigmoid_array(x):                                        
   ....:    return 1 / (1 + np.exp(-x))
   ....: 

(您会注意到从math.exp到的微小变化np.exp(第一个不支持数组,但是如果您只有一个要计算的值则更快))

In [12]: %timeit -r 1 -n 100 sigmoid_array(x)
100 loops, best of 1: 34.3 ms per loop

In [13]: %timeit -r 1 -n 100 expit(x)
100 loops, best of 1: 31 ms per loop

但是,当您确实需要性能时,通常的做法是在RAM中拥有一个预先计算好的Sigmoid函数表,并以某种速度交换一些精度和内存(例如:http : //radimrehurek.com/2013/09 / word2vec-in-python-part-two-optimizing /

另外,请注意,expit从版本0.14.0开始,实现在数值上是稳定的:https : //github.com/scipy/scipy/issues/3385


4
通过在Sigmoid函数中使用浮点数(1.)而不是整数(1),可以将运行时间减少约10%
kd88

我不确定我理解您的意思(示例中使用浮点数),但是无论如何,很少会在整数上计算出S形。
西奥牛逼

2
kd88的意思是,您在函数(1)中使用的数字文字被解析为整数,并且必须在运行时强制转换为浮点数。使用浮点文字(1.0)可获得更好的性能。
krs013 '17

您始终可以对函数进行矢量化处理,使其支持数组。
阿卡拉(Agcala)'18年

您想谈谈昂贵的包装纸吗?%timeit -r 1 expit(0.458)%timeit -r 1 1 /(1 + np.exp(0.458))
Andrew Louw

42

这里是你将如何实现在数字上稳定的方式物流乙状结肠(如描述这里):

def sigmoid(x):
    "Numerically-stable sigmoid function."
    if x >= 0:
        z = exp(-x)
        return 1 / (1 + z)
    else:
        z = exp(x)
        return z / (1 + z)

也许这更准确:

import numpy as np

def sigmoid(x):  
    return math.exp(-np.logaddexp(0, -x))

在内部,它实现与上述相同的条件,但随后使用log1p

通常,多项式逻辑乙状结肠为:

def nat_to_exp(q):
    max_q = max(0.0, np.max(q))
    rebased_q = q - max_q
    return np.exp(rebased_q - np.logaddexp(-max_q, np.logaddexp.reduce(rebased_q)))

(但是,logaddexp.reduce可能更准确。)


参照多项式逻辑乙状结肠(softmax),如果我还想要用于强化学习温度参数,除以max_qrebased_q乘以就足够了tau吗?因为我尝试过但没有得到总计为1的概率
CiprianTomoiagă17年

@CiprianTomoiaga如果您想要一个温度,只需将证据(q)除以温度即可。rebased_q可以是任何东西:它不会改变答案;它提高了数值稳定性。
Neil G

您确定nat_to_exp等于softmax(如您在其他答案中所述)吗?复制粘贴返回的概率不等于1
CiprianTomoiagă17年

@CiprianTomoiaga简短的回答是,我省略了输入和输出的最后一部分,因此,如果您希望将其减去其余部分的总和,则必须进行计算。更具统计意义的解释是,分类分布具有n-1个自然参数或n-1个期望参数。
尼尔·G

很有道理 关心我的问题吗?
CiprianTomoiagă17年

7

其他方式

>>> def sigmoid(x):
...     return 1 /(1+(math.e**-x))
...
>>> sigmoid(0.458)

1
此功能与unwind的功能有什么区别?math.e **-x比math.exp(-x)好吗?
理查德·诺普

在输出结果方面没有差异。如果您想了解速度的差异,可以使用timeit来计时它们的执行时间。但这真的不重要。
ghostdog74 2010年

9
pow通常使用exp和来实现log,因此exp几乎可以肯定直接使用更好。
japreiss

2
当它x为负数时,会遭受溢出。
Neil G

7

通过转换tanh函数的另一种方式:

sigmoid = lambda x: .5 * (math.tanh(.5 * x) + 1)

@NeilG在数学上,sigmoid(x)==(1 + tanh(x / 2))/ 2。因此,这是一个有效的解决方案,尽管数值稳定化方法是优越的。
scottclowe

6

我觉得许多人可能对更改S型函数的自由参数感兴趣。其次,对于许多应用程序,您想使用镜像的S型函数。第三,您可能想要进行简单的归一化,例如输出值在0到1之间。

尝试:

def normalized_sigmoid_fkt(a, b, x):
   '''
   Returns array of a horizontal mirrored normalized sigmoid function
   output between 0 and 1
   Function parameters a = center; b = width
   '''
   s= 1/(1+np.exp(b*(x-a)))
   return 1*(s-min(s))/(max(s)-min(s)) # normalize function to 0-1

并进行比较:

def draw_function_on_2x2_grid(x): 
    fig, ((ax1, ax2), (ax3, ax4)) = plt.subplots(2, 2)
    plt.subplots_adjust(wspace=.5)
    plt.subplots_adjust(hspace=.5)

    ax1.plot(x, normalized_sigmoid_fkt( .5, 18, x))
    ax1.set_title('1')

    ax2.plot(x, normalized_sigmoid_fkt(0.518, 10.549, x))
    ax2.set_title('2')

    ax3.plot(x, normalized_sigmoid_fkt( .7, 11, x))
    ax3.set_title('3')

    ax4.plot(x, normalized_sigmoid_fkt( .2, 14, x))
    ax4.set_title('4')
    plt.suptitle('Different normalized (sigmoid) function',size=10 )

    return fig

最后:

x = np.linspace(0,1,100)
Travel_function = draw_function_on_2x2_grid(x)

乙状结肠功能图


6

使用numpy包允许您的Sigmoid函数解析向量。

根据深度学习,我使用以下代码:

import numpy as np
def sigmoid(x):
    s = 1/(1+np.exp(-x))
    return s

2

来自@unwind的好答案。但是,它不能处理极端的负数(引发OverflowError)。

我的进步:

def sigmoid(x):
    try:
        res = 1 / (1 + math.exp(-x))
    except OverflowError:
        res = 0.0
    return res

这样会更好,但是您仍然会遇到带有负值的数字打击乐问题。
Neil G

2

Tensorflow还包含一个sigmoid功能:https : //www.tensorflow.org/versions/r1.2/api_docs/python/tf/sigmoid

import tensorflow as tf

sess = tf.InteractiveSession()
x = 0.458
y = tf.sigmoid(x)

u = y.eval()
print(u)
# 0.6125396

2

Logistic Sigmoid函数的数字稳定版本。

    def sigmoid(x):
        pos_mask = (x >= 0)
        neg_mask = (x < 0)
        z = np.zeros_like(x,dtype=float)
        z[pos_mask] = np.exp(-x[pos_mask])
        z[neg_mask] = np.exp(x[neg_mask])
        top = np.ones_like(x,dtype=float)
        top[neg_mask] = z[neg_mask]
        return top / (1 + z)

1
如果x为正,我们只是使用1 /(1 + np.exp(-x)),但是当x为负时,我们使用函数np.exp(x)/(1 + np.exp(x))而不是使用1 /(1 + np.exp(-x)),因为当x为负数时-x将为正数,因此,由于-x值较大,np.exp(-x)可能会爆炸。
Yash Khare

2

一班

In[1]: import numpy as np

In[2]: sigmoid=lambda x: 1 / (1 + np.exp(-x))

In[3]: sigmoid(3)
Out[3]: 0.9525741268224334

1

使用pandas DataFrame/Series或时的向量化方法numpy array

最佳答案是针对单点计算的优化方法,但是当您要将这些方法应用于pandas系列或numpy数组时,它需要require apply,这基本上是在后台循环的方法,它将遍历每行并应用该方法。这是相当低效的。

为了加快我们的代码,我们可以使用向量化和numpy广播:

x = np.arange(-5,5)
np.divide(1, 1+np.exp(-x))

0    0.006693
1    0.017986
2    0.047426
3    0.119203
4    0.268941
5    0.500000
6    0.731059
7    0.880797
8    0.952574
9    0.982014
dtype: float64

或搭配pandas Series

x = pd.Series(np.arange(-5,5))
np.divide(1, 1+np.exp(-x))

1

您可以将其计算为:

import math
def sigmoid(x):
  return 1 / (1 + math.exp(-x))

或概念上,更深入,没有任何意义:

def sigmoid(x):
  return 1 / (1 + 2.718281828 ** -x)

或者您可以将numpy用于矩阵:

import numpy as np #make sure numpy is already installed
def sigmoid(x):
  return 1 / (1 + np.exp(-x))

0
import numpy as np

def sigmoid(x):
    s = 1 / (1 + np.exp(-x))
    return s

result = sigmoid(0.467)
print(result)

上面的代码是python中的逻辑Sigmoid函数。如果我知道x = 0.467,则S型函数F(x) = 0.385。您可以尝试替换上面代码中已知的x的任何值,您将获得的其他值F(x)

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