汇总data.frame或矩阵中的行

79

我有一个非常大的数据框，其中行作为观察值，列作为遗传标记。我想创建一个新列，其中包含使用R为每个观察选择的列数之和。

如果我有200列和100行，我想创建一个新列，该列有100行，其总和是从43到167列。这些列有1或0。新列包含每个列的总和行，我将能够对那些遗传标记最多的人进行排序。

我觉得这很接近：

data$new=sum(data$[,43:167])

r

— 用户483502
source

102

您可以使用 rowSums

rowSums(data) 应该给你你想要的。

— 格雷格
source

16

对于OP问题data$new <- rowSums(data[43:167])

— Marek 2010年

5

为了节省时间，也许是：避免与其他功能混淆rowsum！

— Augustin'1

37

rowSums函数（如Greg所述）将完成您想做的事情，但是您在答案中混合了子集技术，使用“ []”时不要使用“ $”，您的代码应类似于：

data$new <- rowSums( data[,43:167] )

如果要使用sum以外的函数，请查看？apply以在行或列上应用常规函数。

— 格雷格·雪诺
source

我不确定为什么会收到此错误：rowSums（incomeData）中的错误：“ x”必须是数字

— munmunbb

1

@munmunbb，您收到此错误，因为incomeData不是数字。使用类似的东西str(incomeData)来查看它是什么，然后可能将其转换为数值矩阵。

— 格雷格·斯诺

5

我来到这里是希望找到一种方法来获取数据表中所有列的总和，并遇到实现上述解决方案的问题。一种使用所有列的总和添加列的方法使用以下cbind函数：

cbind(data, total = rowSums(data))

此方法将一total列添加到数据中，避免了在使用上述解决方案尝试对所有列求和时产生的对齐问题（请参见下面的帖子，以获取有关此问题的讨论）。

— Seeiespi
source

参见dplyr :: mutate_all。

— Paul Rougieux