RuntimeWarning：numpy.dtype大小已更改，可能表明二进制不兼容

我尝试加载已保存的SVM模型时遇到此错误。我尝试卸载sklearn，NumPy和SciPy，然后再次重新安装最新版本（使用pip）。我仍然收到此错误。为什么？

In [1]: import sklearn; print sklearn.__version__
0.18.1
In [3]: import numpy; print numpy.__version__
1.11.2
In [5]: import scipy; print scipy.__version__
0.18.1
In [7]: import pandas; print pandas.__version__
0.19.1

In [10]: clf = joblib.load('model/trained_model.pkl')
---------------------------------------------------------------------------
RuntimeWarning                            Traceback (most recent call last)
<ipython-input-10-5e5db1331757> in <module>()
----> 1 clf = joblib.load('sentiment_classification/model/trained_model.pkl')

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/sklearn/externals/joblib/numpy_pickle.pyc in load(filename, mmap_mode)
    573                     return load_compatibility(fobj)
    574
--> 575                 obj = _unpickle(fobj, filename, mmap_mode)
    576
    577     return obj

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/sklearn/externals/joblib/numpy_pickle.pyc in _unpickle(fobj, filename, mmap_mode)
    505     obj = None
    506     try:
--> 507         obj = unpickler.load()
    508         if unpickler.compat_mode:
    509             warnings.warn("The file '%s' has been generated with a "

/usr/lib/python2.7/pickle.pyc in load(self)
    862             while 1:
    863                 key = read(1)
--> 864                 dispatch[key](self)
    865         except _Stop, stopinst:
    866             return stopinst.value

/usr/lib/python2.7/pickle.pyc in load_global(self)
   1094         module = self.readline()[:-1]
   1095         name = self.readline()[:-1]
-> 1096         klass = self.find_class(module, name)
   1097         self.append(klass)
   1098     dispatch[GLOBAL] = load_global

/usr/lib/python2.7/pickle.pyc in find_class(self, module, name)
   1128     def find_class(self, module, name):
   1129         # Subclasses may override this
-> 1130         __import__(module)
   1131         mod = sys.modules[module]
   1132         klass = getattr(mod, name)

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/sklearn/svm/__init__.py in <module>()
     11 # License: BSD 3 clause (C) INRIA 2010
     12
---> 13 from .classes import SVC, NuSVC, SVR, NuSVR, OneClassSVM, LinearSVC, \
     14         LinearSVR
     15 from .bounds import l1_min_c

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/sklearn/svm/classes.py in <module>()
      2 import numpy as np
      3
----> 4 from .base import _fit_liblinear, BaseSVC, BaseLibSVM
      5 from ..base import BaseEstimator, RegressorMixin
      6 from ..linear_model.base import LinearClassifierMixin, SparseCoefMixin, \

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/sklearn/svm/base.py in <module>()
      6 from abc import ABCMeta, abstractmethod
      7
----> 8 from . import libsvm, liblinear
      9 from . import libsvm_sparse
     10 from ..base import BaseEstimator, ClassifierMixin

__init__.pxd in init sklearn.svm.libsvm (sklearn/svm/libsvm.c:10207)()

RuntimeWarning: numpy.dtype size changed, may indicate binary incompatibility. Expected 96, got 80

更新：确定，请按照此处和

pip uninstall -y scipy scikit-learn
pip install --no-binary scipy scikit-learn

该错误现在已经消失了，尽管我仍然不知道为什么会首先发生它。

根据MAINT：沉默有关更改dtype / ufunc大小的Cython警告。-numpy / numpy：

每当您导入针对比已安装的numpy早的numpy编译的scipy（或其他软件包）时，这些警告都是可见的。

支票由Cython插入（因此，在任何使用它编译的模块中都存在）。

长话短说，这些警告在的特定情况下应该是良性的numpy，并且从numpy 1.8（此提交进入的分支）开始，这些消息就会被过滤掉。虽然scikit-learn 0.18.1针对编译numpy 1.6.1。

要自己过滤这些警告，您可以执行与补丁程序相同的操作：

import warnings
warnings.filterwarnings("ignore", message="numpy.dtype size changed")
warnings.filterwarnings("ignore", message="numpy.ufunc size changed")

当然，你可以重新编译从源代码的所有受影响的模块对当地numpy有pip install --no-binary :all:¹ ，而不是如果你有球该工具。

更长的故事：补丁程序的支持者声称专门针对numpy，应该没有任何风险，并且第3方软件包是有意针对较早版本构建的：

[针对当前的numpy重建所有内容]不是可行的解决方案，当然也没有必要。Scipy（与许多其他软件包一样）与numpy的许多版本兼容。因此，当我们分发scipy二进制文件时，我们将根据支持的最低numpy版本（截至目前为1.5.1）构建它们，并且它们也可与1.6.x，1.7.x和numpy master一起使用。

真正的正确之处在于，Cython仅在dtypes / ufuncs的大小发生变化而导致破坏ABI时发出警告，否则保持沉默。

结果，Cython的开发人员同意信任numpy团队手工维护二进制兼容性，因此我们可以期望使用具有破坏性的ABI更改的版本会产生特制的异常或某些其他显式的阻止程序。

¹ _{自以来，先前可用的--no-use-wheel选项已被删除。pip 10.0.0}

这是新的numpy版本（1.15.0）的问题

您可以降级numpy，此问题将得到解决：

sudo pip uninstall numpy
sudo pip install numpy==1.14.5

最终发布了numpy 1.15.1版本，从而解决了警告问题。

须藤点安装numpy == 1.15.1

这正在工作..

如果您在anaconda环境中，请使用：

conda update --all

我已经尝试了上述方法，但是没有任何效果。但是在我通过apt install安装库之后，问题就消失了，

对于Python3，

pip3 uninstall -y numpy scipy pandas scikit-learn
sudo apt update
sudo apt install python3-numpy python3-scipy python3-pandas python3-sklearn 

对于Python2，

pip uninstall -y numpy scipy pandas scikit-learn
sudo apt update
sudo apt install python-numpy python-scipy python-pandas python-sklearn 

希望有帮助。

只需升级您的numpy模块，现在它是1.15.4。对于窗户

pip install numpy --upgrade

发生此错误是因为已安装的软件包是numpy的另一个版本。
我们需要针对本地重建scipy和scikit-learnnumpy。

对于新的pip（在我的情况下pip 18.0），它起作用：

pip uninstall -y scipy scikit-learn
pip install --no-binary scipy,scikit-learn -I scipy scikit-learn

--no-binary列出您要忽略二进制文件的软件包的名称列表。在这种情况下，我们通过--no-binary scipy,scikit-learn了它将忽略软件包scipy，scikit-learn的二进制文件。没帮我

元信息：安装sklearn的推荐方法

如果您已经可以正常安装numpy和scipy，则安装scikit-learn的最简单方法是使用 pip

pip install -U scikit-learn 

或conda：

conda install scikit-learn

[...不要使用pip从源代码编译]

如果您还没有一个Python安装与numpy的和SciPy的，我们建议通过你的包管理器，或通过任何安装一个 python的 包。这些带有numpy，scipy，scikit-learn，matplotlib和许多其他有用的科学和数据处理库。

请注意，从cython 0.29开始，有一个新的check_size选项可以消除源代码中的警告，因此，一旦该版本渗入到各种软件包中，则无需任何解决方法

我的环境是Python 2.7.15

我尝试

pip uninstall
pip install --no-use-wheel

但它不起作用。它显示错误：

没有这样的选择：--no-use-wheel

然后我尝试：

pip uninstall
pip install --user --install-option="--prefix=" -U scikit-learn

而且有效：不会显示无用的警告。

导入scipy时，错误信息显示：RuntimeWarning：内置 .type大小已更改，可能表示二进制不兼容。预期的zd，得到了zd

我通过将python版本从2.7.2更新到2.7.13解决了这个问题