我有一个具有不同值的概率的文件,例如:
1 0.1
2 0.05
3 0.05
4 0.2
5 0.4
6 0.2
我想使用此分布生成随机数。是否存在处理此问题的现有模块?自己编写代码是很简单的(构建累积密度函数,生成随机值[0,1]并选择相应的值),但这似乎是一个常见问题,可能有人为它创建了一个函数/模块它。
我需要这个,因为我想生成一个生日列表(不遵循标准random
模块中的任何分布)。
我有一个具有不同值的概率的文件,例如:
1 0.1
2 0.05
3 0.05
4 0.2
5 0.4
6 0.2
我想使用此分布生成随机数。是否存在处理此问题的现有模块?自己编写代码是很简单的(构建累积密度函数,生成随机值[0,1]并选择相应的值),但这似乎是一个常见问题,可能有人为它创建了一个函数/模块它。
我需要这个,因为我想生成一个生日列表(不遵循标准random
模块中的任何分布)。
Answers:
scipy.stats.rv_discrete
可能就是您想要的。您可以通过values
参数提供概率。然后,您可以使用rvs()
分发对象的方法来生成随机数。
正如Eugene Pakhomov在评论中指出的那样,您还可以将p
关键字参数传递给numpy.random.choice()
,例如
numpy.random.choice(numpy.arange(1, 7), p=[0.1, 0.05, 0.05, 0.2, 0.4, 0.2])
如果您使用的是Python 3.6或更高版本,则可以random.choices()
在标准库中使用–请参见Mark Dickinson的答案。
numpy.random.choice()
上,速度快了将近20倍。
numpy.random.choice(numpy.arange(1, 7), p=[0.1, 0.05, 0.05, 0.2, 0.4, 0.2])
从Python 3.6开始,Python的标准库中提供了一个解决方案random.choices
。
用法示例:让我们设置与OP中的问题相匹配的总体和权重:
>>> from random import choices
>>> population = [1, 2, 3, 4, 5, 6]
>>> weights = [0.1, 0.05, 0.05, 0.2, 0.4, 0.2]
现在choices(population, weights)
生成一个样本:
>>> choices(population, weights)
4
可选的仅关键字参数k
允许一个参数一次请求多个样本。这很有价值,因为random.choices
在生成任何样本之前,每次调用时都要做一些准备工作。通过一次生成许多样本,我们只需要做一次准备工作。在这里,我们生成了一百万个样本,并collections.Counter
用来检查我们得到的分布与我们赋予的权重大致匹配。
>>> million_samples = choices(population, weights, k=10**6)
>>> from collections import Counter
>>> Counter(million_samples)
Counter({5: 399616, 6: 200387, 4: 200117, 1: 99636, 3: 50219, 2: 50025})
使用CDF生成列表的一个优点是可以使用二进制搜索。当您需要O(n)的时间和空间进行预处理时,您可以在O(k log n)中获得k个数字。由于普通的Python列表效率低下,因此可以使用array
模块。
如果您坚持使用恒定的空间,则可以执行以下操作;O(n)时间,O(1)空间。
def random_distr(l):
r = random.uniform(0, 1)
s = 0
for item, prob in l:
s += prob
if s >= r:
return item
return item # Might occur because of floating point inaccuracies
l[-1]
返回列表的最后一个元素吗?
也许有点晚了。但是您可以使用numpy.random.choice()
传递p
参数:
val = numpy.random.choice(numpy.arange(1, 7), p=[0.1, 0.05, 0.05, 0.2, 0.4, 0.2])
random.choice()
-请参阅注释。
numpy.random.choice()
完全不同于random.choice()
并支持概率分布。
(好吧,我知道您正在要求收缩包装,但是也许这些自制的解决方案还不够简洁,无法满足您的喜好。:-)
pdf = [(1, 0.1), (2, 0.05), (3, 0.05), (4, 0.2), (5, 0.4), (6, 0.2)]
cdf = [(i, sum(p for j,p in pdf if j < i)) for i,_ in pdf]
R = max(i for r in [random.random()] for i,c in cdf if c <= r)
我通过确认此表达式的输出来伪确认此方法有效:
sorted(max(i for r in [random.random()] for i,c in cdf if c <= r)
for _ in range(1000))
i
不是对象。
我写了一个从自定义连续分布中抽取随机样本的解决方案。
我需要一个与您的用例类似的用例(即生成具有给定概率分布的随机日期)。
您只需要功能random_custDist
和功能samples=random_custDist(x0,x1,custDist=custDist,size=1000)
。剩下的就是装饰^^。
import numpy as np
#funtion
def random_custDist(x0,x1,custDist,size=None, nControl=10**6):
#genearte a list of size random samples, obeying the distribution custDist
#suggests random samples between x0 and x1 and accepts the suggestion with probability custDist(x)
#custDist noes not need to be normalized. Add this condition to increase performance.
#Best performance for max_{x in [x0,x1]} custDist(x) = 1
samples=[]
nLoop=0
while len(samples)<size and nLoop<nControl:
x=np.random.uniform(low=x0,high=x1)
prop=custDist(x)
assert prop>=0 and prop<=1
if np.random.uniform(low=0,high=1) <=prop:
samples += [x]
nLoop+=1
return samples
#call
x0=2007
x1=2019
def custDist(x):
if x<2010:
return .3
else:
return (np.exp(x-2008)-1)/(np.exp(2019-2007)-1)
samples=random_custDist(x0,x1,custDist=custDist,size=1000)
print(samples)
#plot
import matplotlib.pyplot as plt
#hist
bins=np.linspace(x0,x1,int(x1-x0+1))
hist=np.histogram(samples, bins )[0]
hist=hist/np.sum(hist)
plt.bar( (bins[:-1]+bins[1:])/2, hist, width=.96, label='sample distribution')
#dist
grid=np.linspace(x0,x1,100)
discCustDist=np.array([custDist(x) for x in grid]) #distrete version
discCustDist*=1/(grid[1]-grid[0])/np.sum(discCustDist)
plt.plot(grid,discCustDist,label='custom distribustion (custDist)', color='C1', linewidth=4)
#decoration
plt.legend(loc=3,bbox_to_anchor=(1,0))
plt.show()
该解决方案的性能肯定可以提高,但是我更喜欢可读性。
根据以下内容列出项目weights
:
items = [1, 2, 3, 4, 5, 6]
probabilities= [0.1, 0.05, 0.05, 0.2, 0.4, 0.2]
# if the list of probs is normalized (sum(probs) == 1), omit this part
prob = sum(probabilities) # find sum of probs, to normalize them
c = (1.0)/prob # a multiplier to make a list of normalized probs
probabilities = map(lambda x: c*x, probabilities)
print probabilities
ml = max(probabilities, key=lambda x: len(str(x)) - str(x).find('.'))
ml = len(str(ml)) - str(ml).find('.') -1
amounts = [ int(x*(10**ml)) for x in probabilities]
itemsList = list()
for i in range(0, len(items)): # iterate through original items
itemsList += items[i:i+1]*amounts[i]
# choose from itemsList randomly
print itemsList
一种优化可能是通过最大公约数对数量进行归一化,以使目标列表更小。
另外,这可能很有趣。
另一个答案,可能更快:)
distribution = [(1, 0.2), (2, 0.3), (3, 0.5)]
# init distribution
dlist = []
sumchance = 0
for value, chance in distribution:
sumchance += chance
dlist.append((value, sumchance))
assert sumchance == 1.0 # not good assert because of float equality
# get random value
r = random.random()
# for small distributions use lineair search
if len(distribution) < 64: # don't know exact speed limit
for value, sumchance in dlist:
if r < sumchance:
return value
else:
# else (not implemented) binary search algorithm
from __future__ import division
import random
from collections import Counter
def num_gen(num_probs):
# calculate minimum probability to normalize
min_prob = min(prob for num, prob in num_probs)
lst = []
for num, prob in num_probs:
# keep appending num to lst, proportional to its probability in the distribution
for _ in range(int(prob/min_prob)):
lst.append(num)
# all elems in lst occur proportional to their distribution probablities
while True:
# pick a random index from lst
ind = random.randint(0, len(lst)-1)
yield lst[ind]
验证:
gen = num_gen([(1, 0.1),
(2, 0.05),
(3, 0.05),
(4, 0.2),
(5, 0.4),
(6, 0.2)])
lst = []
times = 10000
for _ in range(times):
lst.append(next(gen))
# Verify the created distribution:
for item, count in Counter(lst).iteritems():
print '%d has %f probability' % (item, count/times)
1 has 0.099737 probability
2 has 0.050022 probability
3 has 0.049996 probability
4 has 0.200154 probability
5 has 0.399791 probability
6 has 0.200300 probability
根据其他解决方案,您可以生成累积分布(任意形式为整数或浮点数),然后可以使用二等分来使其快速
这是一个简单的示例(我在这里使用了整数)
l=[(20, 'foo'), (60, 'banana'), (10, 'monkey'), (10, 'monkey2')]
def get_cdf(l):
ret=[]
c=0
for i in l: c+=i[0]; ret.append((c, i[1]))
return ret
def get_random_item(cdf):
return cdf[bisect.bisect_left(cdf, (random.randint(0, cdf[-1][0]),))][1]
cdf=get_cdf(l)
for i in range(100): print get_random_item(cdf),
该get_cdf
函数会将其从20、60、10、10转换为20、20 + 60、20 + 60 + 10、20 + 60 + 10 + 10
现在我们使用选取最大为20 + 60 + 10 + 10的随机数,random.randint
然后使用bisect快速获取实际值
这些答案都不是特别清楚或简单的。
这是保证可以正常工作的一种清晰,简单的方法。
accumulate_normalize_probabilities采用字典p
将符号映射到概率或频率。它输出要选择的元组的可用列表。
def accumulate_normalize_values(p):
pi = p.items() if isinstance(p,dict) else p
accum_pi = []
accum = 0
for i in pi:
accum_pi.append((i[0],i[1]+accum))
accum += i[1]
if accum == 0:
raise Exception( "You are about to explode the universe. Continue ? Y/N " )
normed_a = []
for a in accum_pi:
normed_a.append((a[0],a[1]*1.0/accum))
return normed_a
产量:
>>> accumulate_normalize_values( { 'a': 100, 'b' : 300, 'c' : 400, 'd' : 200 } )
[('a', 0.1), ('c', 0.5), ('b', 0.8), ('d', 1.0)]
为什么运作
所述积累步骤变成每个符号到(在第一符号的情况下或0)本身和先前符号概率或频率之间的间隔。通过简单地逐步遍历列表,直到间隔0.0-> 1.0中的随机数(之前已准备好)小于或等于当前符号的间隔端点,可以使用这些间隔进行选择(从而对提供的分布进行采样)。
在规范化释放我们从需求,以确保一切资金以一定的价值。归一化后,概率的“向量”总计为1.0。
下面是用于从分布中选择并生成任意长样本的其余代码:
def select(symbol_intervals,random):
print symbol_intervals,random
i = 0
while random > symbol_intervals[i][1]:
i += 1
if i >= len(symbol_intervals):
raise Exception( "What did you DO to that poor list?" )
return symbol_intervals[i][0]
def gen_random(alphabet,length,probabilities=None):
from random import random
from itertools import repeat
if probabilities is None:
probabilities = dict(zip(alphabet,repeat(1.0)))
elif len(probabilities) > 0 and isinstance(probabilities[0],(int,long,float)):
probabilities = dict(zip(alphabet,probabilities)) #ordered
usable_probabilities = accumulate_normalize_values(probabilities)
gen = []
while len(gen) < length:
gen.append(select(usable_probabilities,random()))
return gen
用法:
>>> gen_random (['a','b','c','d'],10,[100,300,400,200])
['d', 'b', 'b', 'a', 'c', 'c', 'b', 'c', 'c', 'c'] #<--- some of the time
这是一种更有效的方法:
只需使用您的“权重”数组(假定索引为对应项)和否调用以下函数。需要的样本数。可以轻松修改此功能以处理有序对。
使用各自的概率返回采样/挑选(替换)的索引(或项目):
def resample(weights, n):
beta = 0
# Caveat: Assign max weight to max*2 for best results
max_w = max(weights)*2
# Pick an item uniformly at random, to start with
current_item = random.randint(0,n-1)
result = []
for i in range(n):
beta += random.uniform(0,max_w)
while weights[current_item] < beta:
beta -= weights[current_item]
current_item = (current_item + 1) % n # cyclic
else:
result.append(current_item)
return result
关于while循环中使用的概念的简短说明。我们从累积beta减少当前项目的权重,该累积值是随机统一构造的累积值,并增加当前索引以找到其权重与beta值匹配的项目。
random.choice()
?您使用适当的出现次数来构建主列表,然后选择一个。当然,这是一个重复的问题。