ValueError:使用序列设置数组元素


183

此Python代码:

import numpy as p

def firstfunction():
    UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray = []
    MeanOutputHeader=['TestID','ConditionName','FilterType','RRMean','HRMean',
                      'dZdtMaxVoltageMean','BZMean','ZXMean','LVETMean','Z0Mean',
                      'StrokeVolumeMean','CardiacOutputMean','VelocityIndexMean']
    dataMatrix = BeatByBeatMatrixOfMatrices[column]
    roughTrimmedMatrix = p.array(dataMatrix[1:,1:17])


    trimmedMatrix = p.array(roughTrimmedMatrix,dtype=p.float64)  #ERROR THROWN HERE


    myMeans = p.mean(trimmedMatrix,axis=0,dtype=p.float64)
    conditionMeansArray = [TestID,testCondition,'UnfilteredBefore',myMeans[3], myMeans[4], 
                           myMeans[6], myMeans[9], myMeans[10], myMeans[11], myMeans[12],
                           myMeans[13], myMeans[14], myMeans[15]]
    UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray.append(conditionMeansArray)
    secondfunction(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray)
    return

def secondfunction(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray):
    RRDuringArray = p.array(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray,dtype=p.float64)[1:,3]
    return

firstfunction()

引发此错误消息:

File "mypath\mypythonscript.py", line 3484, in secondfunction
RRDuringArray = p.array(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray,dtype=p.float64)[1:,3]
ValueError: setting an array element with a sequence.

谁能告诉我该怎么做才能解决上面破碎的代码中的问题,以便停止抛出错误消息?


编辑: 我做了一个打印命令来获取矩阵的内容,这就是它打印出来的内容:

UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray为:

[['TestID', 'ConditionName', 'FilterType', 'RRMean', 'HRMean', 'dZdtMaxVoltageMean', 'BZMean', 'ZXMean', 'LVETMean', 'Z0Mean', 'StrokeVolumeMean', 'CardiacOutputMean', 'VelocityIndexMean'],
[u'HF101710', 'PreEx10SecondsBEFORE', 'UnfilteredBefore', 0.90670000000000006, 66.257731979420001, 1.8305673000000002, 0.11750000000000001, 0.15120546389880002, 0.26870546389879996, 27.628261216480002, 86.944190346160013, 5.767261352345999, 0.066259118585869997],
[u'HF101710', '25W10SecondsBEFORE', 'UnfilteredBefore', 0.68478571428571422, 87.727887206978565, 2.2965444125714285, 0.099642857142857144, 0.14952476549885715, 0.24916762264164286, 27.010483303721429, 103.5237336525, 9.0682762747642869, 0.085022572648242867],
[u'HF101710', '50W10SecondsBEFORE', 'UnfilteredBefore', 0.54188235294117659, 110.74841107829413, 2.6719262705882354, 0.077705882352917643, 0.15051306356552943, 0.2282189459185294, 26.768787504858825, 111.22827075238826, 12.329456404418824, 0.099814258468417641],
[u'HF101710', '75W10SecondsBEFORE', 'UnfilteredBefore', 0.4561904761904762, 131.52996981880955, 3.1818159523809522, 0.074714285714290493, 0.13459344175047619, 0.20930772746485715, 26.391156337028569, 123.27387909873812, 16.214243779323812, 0.1205685359981619]]

对我来说,这看起来像是5行乘13列的矩阵,但是当通过脚本运行不同的数据时,行数是可变的。使用我要添加的相同数据。

编辑2:但是,脚本抛出错误。因此,我认为您的想法不能解释此处正在发生的问题。谢谢你 还有其他想法吗?


编辑3:

仅供参考,如果我替换此有问题的代码行:

    RRDuringArray = p.array(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray,dtype=p.float64)[1:,3]

与此相反:

    RRDuringArray = p.array(UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray)[1:,3]

然后,脚本的该部分可以正常工作而不会引发错误,但是此代码行更进一步:

p.ylim(.5*RRDuringArray.min(),1.5*RRDuringArray.max())

引发此错误:

File "mypath\mypythonscript.py", line 3631, in CreateSummaryGraphics
  p.ylim(.5*RRDuringArray.min(),1.5*RRDuringArray.max())
TypeError: cannot perform reduce with flexible type

因此,您可以看到我需要指定数据类型以便能够在matplotlib中使用ylim,但是指定数据类型会引发引发此帖子的错误消息。


有人要删除此问题中所有不相关的细节吗?
Chris_Rands

Answers:


254

从您展示给我们的代码中,我们唯一可以看出的是您正在尝试从形状不像多维数组的列表中创建数组。例如

numpy.array([[1,2], [2, 3, 4]])

要么

numpy.array([[1,2], [2, [3, 4]]])

将产生此错误消息,因为输入列表的形状不是可以转换为多维数组的(通用)“框”。因此可能UnFilteredDuringExSummaryOfMeansArray包含不同长度的序列。

编辑:此错误消息的另一个可能原因是尝试将字符串用作类型数组中的元素float

numpy.array([1.2, "abc"], dtype=float)

那就是您根据编辑尝试的内容。如果您确实想拥有一个同时包含字符串和浮点数的NumPy数组,则可以使用dtype object,它使该数组可以容纳任意Python对象:

numpy.array([1.2, "abc"], dtype=object)

不知道您的代码将完成什么,我无法判断这是否是您想要的。


1
谢谢,但我认为这不是答案。当它引发上面的错误时,我已经添加了数组的内容。在我看来,这是一个盒子,当我将其粘贴到记事本中并逐行检查时。还有其他想法吗?
MedicalMath 2011年

2
您的修改似乎已经解决了我的问题。我需要设置dtype = object。非常感谢你。
MedicalMath 2011年

这个问题已经完全回答。
MedicalMath 2011年

另一种可能是1.9中的一个问题,当构建__getitem__按此处指定实现的对象数组(不一定是列表)时:github.com/numpy/numpy/issues/5100
dashesy 2014年

47

Python ValueError:

ValueError: setting an array element with a sequence.

就是说的意思,您正在尝试将一系列数字填充到单个数字槽中。它可以在各种情况下抛出。

1.当您将python元组或列表传递为numpy数组元素时:

import numpy

numpy.array([1,2,3])               #good

numpy.array([1, (2,3)])            #Fail, can't convert a tuple into a numpy 
                                   #array element


numpy.mean([5,(6+7)])              #good

numpy.mean([5,tuple(range(2))])    #Fail, can't convert a tuple into a numpy 
                                   #array element


def foo():
    return 3
numpy.array([2, foo()])            #good


def foo():
    return [3,4]
numpy.array([2, foo()])            #Fail, can't convert a list into a numpy 
                                   #array element

2.通过尝试将长度大于1的numpy数组塞入numpy数组元素:

x = np.array([1,2,3])
x[0] = np.array([4])         #good



x = np.array([1,2,3])
x[0] = np.array([4,5])       #Fail, can't convert the numpy array to fit 
                             #into a numpy array element

正在创建一个numpy数组,并且numpy不知道如何将多值元组或数组填充到单个元素插槽中。它期望您给它提供的任何结果都可以求出单个数字,如果没有,Numpy会回答说它不知道如何设置带有序列的数组元素。


非常好的解释
Tejas Shetty

15

就我而言,我在Tensorflow中遇到此错误,原因是我试图输入具有不同长度或序列的数组:

例如:

import tensorflow as tf

input_x = tf.placeholder(tf.int32,[None,None])



word_embedding = tf.get_variable('embeddin',shape=[len(vocab_),110],dtype=tf.float32,initializer=tf.random_uniform_initializer(-0.01,0.01))

embedding_look=tf.nn.embedding_lookup(word_embedding,input_x)

with tf.Session() as tt:
    tt.run(tf.global_variables_initializer())

    a,b=tt.run([word_embedding,embedding_look],feed_dict={input_x:example_array})
    print(b)

如果我的数组是:

example_array = [[1,2,3],[1,2]]

然后我会得到错误:

ValueError: setting an array element with a sequence.

但是如果我做填充,那么:

example_array = [[1,2,3],[1,2,0]]

现在可以了。


我在使用pyCUDA并意外地将一个gpuarray元素分配给numpy array。我遇到了同样的错误。
Tirtha R

@Aaditya Ura,如何进行这种填充,您可以参考一下吗?
巴黎

7

对于那些在Numpy中遇到类似问题的人,一个非常简单的解决方案是:

定义dtype=object限定的阵列用于向它分配值时。例如:

out = np.empty_like(lil_img, dtype=object)

3
它与Edit接受的答案有何不同?
सत्यमेवजयते

像魅力一样工作!
mcagriardic

5

就我而言,问题是另一个。我正在尝试将int列表转换为array。问题在于,一个列表的长度与其他列表不同。如果要证明这一点,则必须执行以下操作:

print([i for i,x in enumerate(list) if len(x) != 560])

在我的情况下,长度参考为560。


2

就我而言,问题在于数据帧X []的散点图:

ax.scatter(X[:,0],X[:,1],c=colors,    
       cmap=CMAP, edgecolor='k', s=40)  #c=y[:,0],

#ValueError: setting an array element with a sequence.
#Fix with .toarray():
colors = 'br'
y = label_binarize(y, classes=['Irrelevant','Relevant'])
ax.scatter(X[:,0].toarray(),X[:,1].toarray(),c=colors,   
       cmap=CMAP, edgecolor='k', s=40)

一些更多的解释会很好。
Tejas Shetty

1
值错误表示我们正在尝试将n元素数组(序列)加载到只有浮点数的单个数字插槽中。因此,您尝试使用序列设置数组元素。使用.toarray()我们将其放大为序列数组。toarray()返回一个ndarray;
Max Kleiner

0

当形状不规则或元素具有不同的数据类型时,dtype传递给np.array 的参数只能为object

import numpy as np

# arr1 = np.array([[10, 20.], [30], [40]], dtype=np.float32)  # error
arr2 = np.array([[10, 20.], [30], [40]])  # OK, and the dtype is object
arr3 = np.array([[10, 20.], 'hello'])     # OK, and the dtype is also object

``


欢迎来到SO。这个问题很老了,看来您的答案至少重复了另一个。如果您的答案实际上有所不同,请尝试添加一些更详细的解释方式。
Jens Ehrich
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