在从字符串> 4k创建的谓词中使用Oracle Clob

我正在尝试从> 4000个字符（在file_data绑定变量中提供）的字符串创建一个Clob，以在下面的Oracle SELECT谓词中使用：

myQuery=
select *
from dcr_mols
WHERE flexmatch(ctab,:file_data,'MATCH=ALL')=1;

如果我将TO_CLOB（）添加到file_data的周围，则它将无法达到臭名昭著的Oracle 4k对varchar的限制（对于<4k的字符串就可以）。错误（在SQL Developer中）为：

ORA-01460: unimplemented or unreasonable conversion requested
01460. 00000 -  "unimplemented or unreasonable conversion requested"

仅供参考，flexmatch函数用于搜索分子，在此处进行了描述：http : //help.accelrysonline.com/ulm/onelab/1.0/content/ulm_pdfs/direct/developers/direct_2016_developersguide.pdf

函数本身有点复杂，但本质是第二个参数必须是Clob。所以我的问题是如何将超过4000个字符的Java字符串bind_variable转换为sql（或Java）中的clob。

我使用以下方法在Java（Spring boot 2）中尝试了以下方法（在插入Clob时有效）：

MapSqlParameterSource parameters = new MapSqlParameterSource();
parameters.addValue("file_data", fileDataStr,Types.CLOB);
jdbcNamedParameterTemplate.query(myQuery,parameters,…

此方法应该可以工作，但是会失败，并会产生一个弹性匹配错误，仅供参考：

SQL state [99999]; error code [29902]; ORA-29902: error in executing ODCIIndexStart() routine\nORA-20100: 
MDL-0203: Unable to read from CLOB (csfrm=1, csid=873): 
ORA-22922: nonexistent LOB value\nMDL-0021: Unable to copy LOB to string\nMDL-1051: Molstructure search query is not a valid molecule\nMDL-0976: 
Molecule index search initialization failed\nORA-06512: at \"C$MDLICHEM80.MDL_MXIXMDL\", line 329\nORA-06512: at \"C$MDLICHEM80.MDL_MXIXMDL\", line 309\n; nested exception is java.sql.SQLException: 
ORA-29902: error in executing ODCIIndexStart() routine\nORA-20100: MDL-0203: Unable to read from CLOB (csfrm=1, csid=873): 
ORA-22922: nonexistent LOB value\nMDL-0021: Unable to copy LOB to string\nMDL-1051: Molstructure search query is not a valid molecule\nMDL-0976: 
Molecule index search initialization failed\nORA-06512: at \"C$MDLICHEM80.MDL_MXIXMDL\", line 329\nORA-06512: at \"C$MDLICHEM80.MDL_MXIXMDL\", line 309\n"

注意我正在使用SpringBoot 2，但是我无法使用任何使用OracleConnection的方法（从我的Spring NamedParametersJdbcTemplate对象获得）来工作（即使是在<4k的Clob上），所以我怀疑我做了一些愚蠢的事情。我试过了：

 @Autowired
 NamedParameterJdbcTemplate  jdbcNamedParameterTemplate;
OracleConnection conn =  this.jdbcNamedParameterTemplate.getJdbcTemplate().getDataSource().getConnection().unwrap(OracleConnection.class);
Clob myClob =  conn.createClob();
myClob.setString( 1, fileDataStr);
MapSqlParameterSource parameters = new MapSqlParameterSource();
parameters.addValue("file_data", myClob,Types.CLOB);

application.properties：

spring.datasource.url=jdbc:oracle:thin:@//${ORA_HOST}:${ORA_PORT}/${ORA_SID}
spring.datasource.username=${ORA_USER}
spring.datasource.password=${ORA_PASS}

请注意，如果我去上学，并使用非弹簧连接加上带有setClob（）方法的PreparedStatement，它会很好地工作：

OracleDataSource ods = new OracleDataSource();
String url ="jdbc:oracle:thin:@//" + ORA_HOST +":"+ORA_PORT +"/"+ORA_SID;
ods.setURL(url);
ods.setUser(user);
ods.setPassword(passwd);
Connection conn = ods.getConnection();
Clob myClob=conn.createClob();
PreparedStatement ps = conn.prepareStatement("select dcr_number from dcr_mols WHERE flexmatch(ctab,?,'MATCH=ALL')=1");
myClob.setString(1,myMol);
ps.setClob(1,myClob);
ResultSet rs =ps.executeQuery();

但是我更喜欢Java或Sql的Spring 2解决方案。任何帮助，建议表示赞赏。

流式传输。您不能只是将巨大的值粘贴到SQL语句中。

您需要：

• 在INSERT语句中插入一个空的BLOB （使用EMPTY_BLOB（）？...不太记得）。
• 获取空Blob的输出流。
• 然后从文件获取输入流。请不要将整个文件加载到内存中。
• 然后使用缓冲将块从输入流传输到输出流。16 KB缓冲区应该可以。
• 关闭两个流。

这是在Oracle中处理海量数据的标准方法。那里有很多例子。

检索海量数据（BLOB和CLOB类型）的方法相同。在这种情况下，只需使用InputStreams。

阅读“ BIOVIA Direct” API的文档，第27页上有一个有趣的示例，摘录如下所示：

select ...
from ...
where flexmatch(
ctab,
(select ctab from nostruct_table),
'all'
)=1

它使用已加载的 CLOB。因此，我想一个不错的解决方案是将CLOB加载到您的表中（或预先将它们全部预加载），然后再使用它们。

步骤＃1-将您的CLOB加载到表中：

create table mol_file (
  id number(12) primary key not null,
  content clob
);

insert into mol_file (id, content) values (:id, :content);

并使用您的Java代码来执行CLOB插入（可能使用流），如另一个答案（Internet中的大量示例）所示。例如，插入ID =的mol数据内容123。

步骤＃2-使用已加载的mol文件运行查询：

select *
from dcr_mols
WHERE flexmatch(
        ctab,
        (select content from mol_file where id = :id),
        'MATCH=ALL'
      ) = 1;

您可以将:id参数设置123为使用之前加载的文件（或任何其他文件）。

您可以像这样调用旧的时尚功能。创建一个类来处理ResultSet

 class MyPreparedStatementCallback implements PreparedStatementCallback {
    public Object doInPreparedStatement(PreparedStatement preparedStatement)
            throws SQLException, DataAccessException {
        ResultSet rs = preparedStatement.executeQuery();
        List result = new LinkedList();
        rs.close();
        return result;
    }
}

并在方法中使用JdbcTemplate调用查询

 jdbcTemplate.execute(new PreparedStatementCreator() {
        @Override
        public PreparedStatement createPreparedStatement(Connection connection)

                throws SQLException, DataAccessException {

            PreparedStatement ps = connection.prepareStatement("select dcr_number from dcr_mols WHERE flexmatch(ctab,?,'MATCH=ALL')=1");
            Clob myClob =  connection.createClob();
            myClob.setString( 1, fileDataStr);
            MapSqlParameterSource parameters = new MapSqlParameterSource();
            parameters.addValue("file_data", myClob, Types.CLOB);
            ps.setClob(1,myClob);
            return ps;

        };
    }, new MyPreparedStatementCallback());

我不得不恢复到使用PreparedStatement，但是通过从Spring获取连接并使用apache commons BeanListHandler将ResultSet映射到对象List，我已经改善了常规实现。

import org.apache.commons.dbutils.ResultSetHandler;
import org.apache.commons.dbutils.handlers.BeanListHandler;

@Autowired
NamedParameterJdbcTemplate  jdbcTemplate;

List<MyDao> myMethod(String fileData){
    String myQuery="select * from dcr_mols WHERE flexmatch(ctab,?,'MATCH=ALL')=1";

try {
    Connection conn =  this.jdbcTemplate.getJdbcTemplate().getDataSource().getConnection().unwrap(OracleConnection.class);   // Get connection from spring

    Clob myClob =  conn.createClob();   // Open a dB clob 
    myClob.setString( 1, fileData);     // add data to clob
    PreparedStatement ps = conn.prepareStatement(myQuery);
    ps.setClob(1,myClob);              // Add a clob into the PreparedStatement
    ResultSet rs =ps.executeQuery();   // Execute the prepared statement

    //ResultSetHandler<List<MyDao>> handler = new BeanListHandler<MyDao>(MyDao.class);   // Define the ResultSet handler
    ResultSetHandler<List<MyDao>> handler = new BeanListHandler<MyDao>(MyDao.class, new BasicRowProcessor(new GenerousBeanProcessor()));  // This is better than the above handler , because GenerousBeanProcessor removes the requirement for the column names to exactly match the java variables

    List<MyDao> myDaoList = handler.handle(rs);   // Map ResultSet to List of MyDao objects
    }catch (Exception e) {
        e.printStackTrace();
    }

return myDaoList;
}

您可以使用con声明fileDataStr为CLOB，即连接

java.sql.Clob fileDataStr = oracle.sql.CLOB.createTemporary
(con, false, oracle.sql.CLOB.DURATION_SESSION);

然后像下面一样使用它

 parameters.addValue("file_data", fileDataStr,Types.CLOB);

另外，如果您在连接字符串中使用SID代替服务名称，请尝试如下更改属性文件

spring.datasource.url=jdbc:oracle:thin:@//${ORA_HOST}:${ORA_PORT}:${ORA_SID}