该SciPy的网页用来提供构建和安装说明,但说明现在依靠操作系统二进制分发。要在没有预编译所需库软件包的操作系统上构建SciPy(和NumPy),必须先构建然后静态链接到Fortran库BLAS和LAPACK:
mkdir -p ~/src/
cd ~/src/
wget http://www.netlib.org/blas/blas.tgz
tar xzf blas.tgz
cd BLAS-*
## NOTE: The selected Fortran compiler must be consistent for BLAS, LAPACK, NumPy, and SciPy.
## For GNU compiler on 32-bit systems:
#g77 -O2 -fno-second-underscore -c *.f # with g77
#gfortran -O2 -std=legacy -fno-second-underscore -c *.f # with gfortran
## OR for GNU compiler on 64-bit systems:
#g77 -O3 -m64 -fno-second-underscore -fPIC -c *.f # with g77
gfortran -O3 -std=legacy -m64 -fno-second-underscore -fPIC -c *.f # with gfortran
## OR for Intel compiler:
#ifort -FI -w90 -w95 -cm -O3 -unroll -c *.f
# Continue below irrespective of compiler:
ar r libfblas.a *.o
ranlib libfblas.a
rm -rf *.o
export BLAS=~/src/BLAS-*/libfblas.a
仅执行五个g77 / gfortran / ifort命令之一。我已注释掉所有内容,但我使用的是gfortran。随后的LAPACK安装需要一个Fortran 90编译器,并且由于两个安装都应使用相同的Fortran编译器,因此g77不应用于BLAS。
接下来,您需要安装LAPACK东西。SciPy网页的说明在这里也对我有所帮助,但我必须对其进行修改以适合我的环境:
mkdir -p ~/src
cd ~/src/
wget http://www.netlib.org/lapack/lapack.tgz
tar xzf lapack.tgz
cd lapack-*/
cp INSTALL/make.inc.gfortran make.inc # On Linux with lapack-3.2.1 or newer
make lapacklib
make clean
export LAPACK=~/src/lapack-*/liblapack.a
2015年9月3日更新:今天验证了一些评论(感谢所有):运行之前,make lapacklib
编辑make.inc
文件-fPIC
并向OPTS
和NOOPT
设置添加选项。如果您使用的是64位体系结构或要编译为64位体系结构,请同时添加-m64
。重要的是,在将这些选项设置为相同值的情况下编译BLAS和LAPACK。如果您忘记了,-fPIC
SciPy实际上会给您有关符号丢失的错误,并建议您使用此开关。make.inc
我的设置中的特定部分如下所示:
FORTRAN = gfortran
OPTS = -O2 -frecursive -fPIC -m64
DRVOPTS = $(OPTS)
NOOPT = -O0 -frecursive -fPIC -m64
LOADER = gfortran
在旧机器(例如RedHat 5)上,gfortran可能安装在旧版本(例如4.1.2)中,并且不理解option -frecursive
。make.inc
在这种情况下,只需将其从文件中删除即可。
Makefile的lapack测试目标在我的设置中失败,因为它找不到blas库。如果您周全,则可以将blas库临时移至指定位置以测试lapack。我是一个懒惰的人,所以我相信开发人员可以使其工作并仅在SciPy中进行验证。