加载软件包时禁用消息

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我有一个R包（ROCR），需要在R环境中加载。装入包装后，将打印一组消息。通常，这很好，但是由于R脚本的输出正用于进一步分析，因此我想完全禁用所有这些输出。我怎么做？此外，我宁愿完全不必修改ROCR来执行此操作，这样该脚本的未来用户也不必这样做。

至今：

sink()在这里不起作用-将stdout和std err都重定向到/dev/null对我没有任何作用。
毫不奇怪，它们options(warnings=-1)什么也不做，因为这些本身并不是警告，而是要打印出来的。

有什么想法吗？

r messages

— 学习者
source

正在打印什么消息？

1

虽然不需要整个输出，但前几行是： Loading required package: gplots Loading required package: gtools Loading required package: gdata-请注意，它不会让我正确格式化消息。

— 学习者

然后加载gplots，gtools然后gdata再加载ROCR。

2

@Jack，不，请参阅下面的正确答案。

— Dirk Eddelbuettel 2011年

6

强制性的“它的包，而不是图书馆”在这里评论

— Spacedman 2011年

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只需suppressMessages()在library()通话中使用：

edd@max:~$ R

R version 2.14.1 (2011-12-22)
Copyright (C) 2011 The R Foundation for Statistical Computing
ISBN 3-900051-07-0
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
[...]

R> suppressMessages(library(ROCR))
R>                                               # silently loaded
R> search() 
 [1] ".GlobalEnv"         "package:ROCR"         # it's really there      
 [3] "package:gplots"     "package:KernSmooth"
 [5] "package:grid"       "package:caTools"   
 [7] "package:bitops"     "package:gdata"     
 [9] "package:gtools"     "package:stats"     
[11] "package:graphics"   "package:grDevices" 
[13] "package:utils"      "package:datasets"  
[15] "package:methods"    "Autoloads"         
[17] "package:base"      
R>

— 德克·埃德比布特尔
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19

你不应该使用suppressPackageStartupMessages吗？

— hadley 2011年

9

除了花费X个以上的字符外，没有任何净收益。加号suppressPackageStartupMessages仅抑制启动消息，而我首选suppressMessages()抑制任何和所有消息（但不cat()包括我记得的）。但是不应该在启动文本中使用它。

— Dirk Eddelbuettel 2011年

1

Dirk的建议也很好地抑制了消息在加载时也依赖于依赖包。

— 马特·班纳特

2

有没有办法捕获这些启动消息？我可以捕获警告和错误，但不知道如何捕获其他此类消息。

— 阿德里安

1

@Adrian是的，包装到tryCatch中并提供消息处理程序

— jangorecki

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Dirk的答案禁止显示所有消息，并且不特定于加载程序包时生成的消息。

提出的问题的更准确解决方案是：

suppressPackageStartupMessages(library(THE_PACKAGE_NAME))

可以在这里找到更详细的解释

— 迈赫拉德·马哈茂迪（Mehrad Mahmoudian）
source

10

使用preventPackageStartupMessages，请参阅@MehradMahmoudian的答案。为了完整起见，请添加用法示例：

对于一个库，请使用suppressPackageStartupMessages(...)，例如：

suppressPackageStartupMessages(library(ggplot2))

对于多个库，请使用suppressPackageStartupMessages({...})，例如：

suppressPackageStartupMessages({
    library(ggplot2)
    library(ggdendro)
})

— 帖木儿
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1

library(ROCR, quietly = TRUE) 可能是一个更优雅的选择。

— 安德烈·马丁斯（Andrei Martins）
source

4

并非如此，请尝试library(data.table, quietly = TRUE)

— Gaurav Singhal '18年

1

通过quietly = T如下所示添加将解决该问题：

suppressWarnings(suppressMessages(library("dplyr", quietly = T)))

如果有多个包装，您可以使用：

## specify the package names
PKGs <- c("affy","gcrma","readxl","ggplot2","lattice" )

他们使用lapply如下：

lapply(PKGs, library, character.only = TRUE ,quietly = T)

— 优素福
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