在版本控制下使用IPython笔记本
使IPython笔记本保持版本控制的好策略是什么？ 笔记本格式非常适合版本控制：如果要对笔记本及其输出进行版本控制，则效果很好。当人们只希望对输入进行版本控制时，就会感到烦恼，不包括可能是大型二进制Blob（尤其是电影和情节）的像元输出（又称“生成产品”）。特别是，我试图找到一个好的工作流程： 让我可以选择是包含还是排除输出， 防止我不想要我的输出， 允许我将输出保持在本地版本中， 允许我使用版本控制系统查看何时更改了输入（即，如果仅对版本进行控制，但是本地文件具有输出，那么我希望能够查看输入是否已更改（需要提交） ）。由于本地文件具有输出，因此使用version control status命令将始终记录差异。） 允许我从更新的干净笔记本中更新我的工作笔记本（包含输出）。（更新） 如前所述，如果我选择包括输出（例如，在使用nbviewer时是理想的），那么一切都很好。问题是，当我不想要的版本控制输出。有一些工具和脚本可用于剥离笔记本的输出，但是我经常遇到以下问题： 我不小心用输出提交了一个版本，从而污染了我的存储库。 我清除了输出以使用版本控制，但实际上宁愿将输出保留在我的本地副本中（例如，有时需要一段时间才能重现）。 与Cell/All Output/Clear菜单选项相比，某些剥离输出的脚本会稍微改变格式，从而在差异中产生不必要的噪音。这可以通过一些答案解决。 将更改拉到文件的干净版本时，我需要找到某种方式将这些更改合并到我的工作笔记本中，而不必重新运行所有内容。 （更新） 我考虑了以下将要讨论的几种选择，但是还没有找到一个好的综合解决方案。完整的解决方案可能需要对IPython进行一些更改，或者可能依赖于一些简单的外部脚本。我目前使用mercurial，但是想要一个也可以与git一起使用的解决方案：理想的解决方案是版本控制无关的。 已经多次讨论了此问题，但是从用户的角度来看，没有确定的或明确的解决方案。这个问题的答案应该提供确定的策略。如果需要最新的（甚至是开发的）IPython版本或易于安装的扩展，那就很好。 更新：我一直在使用修改过的笔记本版本，该.clean版本可以使用Gregory Crosswhite的建议每次保存时都保存一个版本。这满足了我的大部分约束，但以下问题尚未解决： 这还不是标准解决方案（需要对ipython源进行修改。是否可以通过简单的扩展来实现此行为？需要某种保存上的钩子。 我当前的工作流程存在一个问题，就是要进行更改。这些将进入.clean文件，然后需要以某种方式集成到我的工作版本中。（当然，我总是可以重新执行笔记本，但是这可能会很痛苦，尤其是如果某些结果取决于长时间的计算，并行计算等时。）关于如何解决这个问题我还没有个好主意。也许涉及像ipycache这样的扩展程序的工作流程可能会起作用，但这似乎有点太复杂了。 笔记 移除（剥离）输出 笔记本计算机运行时，可以使用Cell/All Output/Clear菜单选项删除输出。 有一些脚本可以删除输出，例如脚本nbstripout.py可以删除输出，但不会产生与使用笔记本界面相同的输出。最终将其包含在ipython / nbconvert存储库中，但已关闭，说明更改已包含在ipython / ipython中，但似乎尚未包含相应的功能。 （更新）话虽如此，Gregory Crosswhite的解决方案表明，即使不调用ipython / nbconvert，此操作也非常容易，因此，如果可以正确地挂接，则该方法可能是可行的。（但是，将其附加到每个版本控制系统似乎不是一个好主意-应该以某种方式挂接到笔记本机制上。） 新闻组 关于版本控制的笔记本格式的思考。 问题 977：笔记本功能请求（打开）。 1280：全部清除保存选项（打开）。（此讨论之后。） 3295：自动导出的笔记本：仅导出显式标记的单元格（关闭）。扩展程序已解决11添加了writeandexecute magic（合并）。 拉取请求 1621：清除“清除所有输出”（合并）上的In []提示数字。（另请参见2519（合并）。） 1563：clear_output改进（合并）。 3065：笔记本电脑的扩散性（关闭）。 3291：添加了在保存时跳过输出单元格的选项。（已关闭）。这似乎非常相关，但是建议不要使用“清洁/涂抹”过滤器。一个相关的问题，如果要在运行git diff之前剥离输出，可以使用什么？似乎没有得到答复。 …