是否有用于结构化网格自适应网格细化的通用库？

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自适应网格细化（AMR）是解决PDE数值解中空间尺度变化很大的常见技术。在结构化网格上存在哪些针对AMR的通用库？理想情况下，我希望本着PETSc的精神，库仅处理自适应网格，而我提供物理和离散化（有限差分/体积/元素）。

理想的图书馆是

模块化：不决定如何编写代码或过多的数据结构
General：不在乎我使用的是哪种离散化
高效：不会产生太多开销
并行且高度可扩展

仅适合这些条件中的一个子集的库仍将受到关注。

附录：我知道Donna Calhoun的AMR软件包的详细列表，但是我不知道其中哪个（如果有）符合上述条件。因此，我主要感兴趣的是听取具有一个或多个（或更多）软件包的实际经验的人，以了解他们如何衡量这些术语。

— 大卫·凯奇森
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+1，我也想知道还有什么AMR软件，并且希望它满足您上面提到的标准。

— Geoff Oxberry 2012年

只是想我要提到的是，Chombo的最新版本刚刚发布，并且（据称）应该更容易集成到更大的软件包中（发行说明）。这不是主要修订，因此可能有些内容仍不能满足您的所有条件。

— 杰里米·科兹登

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BoxLib是要考虑的一个库。其主要功能（来自网站）包括：

支持块结构的AMR和可选的子循环

支持以单元为中心，以面部为中心和以节点为中心的数据

支持双曲，抛物线和椭圆求解分层网格结构

C ++和Fortran90版本

通过MPI和OpenMP支持混合编程模型

在燃烧，天体物理学，宇宙学和多孔介质中的成熟应用基础

演示可扩展到超过200,000个处理器

有兴趣的用户可以免费使用

还有一个Fortran版本的Python包装器（由我编写）（尽管还很年轻）。

— 马修·埃米特
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您还应该查看libMesh。它针对的是有限元方法，但除此之外，我认为它会检查您的大多数箱子。与BoxLib不同，它是一个完全非结构化的混合元素类型库，要保持它在同一网格中支持tet，金字塔，棱柱和六面体。对于高阶多项式基函数，它也具有最大的一组集成规则。它的设置旨在让您直接调用PETSc（以及一些其他库），因此您具有与PETSc相同的求解器可伸缩性。

当然，有一种libMesh的处理方式，但是也有PETSc的处理方式。因此希望这不会吓到您。

— 比尔·巴特
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我会尝试SAMRAI，因为我知道至少有一个成功使用它的代码-IBAMR，这是一种用于与AMR进行流体-结构相互作用的浸入边界方法代码。

— 约翰特拉·沃尔塔
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感谢Johntra（并欢迎使用scicomp）！您是否偶然知道SAMRAI和BoxLib之间的显着差异？另外，您可以通过以下方式使用内联链接：在[]中放置链接文本，在（）中

— 放置

不幸的是，我并没有（因为我真的是第一次）（BoxLib）。这正是我决定加入的原因-通过与大家进行非正式讨论来学习新的技术-谢谢。

— 约翰特拉·沃尔塔

我第二次说说SAMRAI，它是AMR的非常有用的通用框架。我也非常喜欢混合C ++ / Fortran设计作者的青睐。计算内核可以按原样使用Fortran编写，C ++类提供隐藏内部MPI和内存管理所需的所有抽象。

— talonmies，2012年

@AronAhmadia：BoxLib无法处理以单元为中心的几何Multigrid中改变的Dirichlet边界的分段线性插值。思想将其添加为一个有趣的观点。

— Gaurav Saxena

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您未指定结构化或非结构化。

看看Paramesh，金字塔，p4est，Dendro，Samrai和Chombo。

Btw金字塔不进行粗化处理。

— 斯塔利
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接得好; 我已经编辑了问题。您能否评论这些库符合我的标准的程度如何？

— David Ketcheson 2012年