什么是最好的贝叶斯统计入门教材?


192

哪个是贝叶斯统计的最佳入门教科书?

请给每个答案一本书。


36
在答复中,请解释为什么您推荐一本 “最好的”
ub

3
这样的问题问题怎么会有一个以上的答案?
naught101

7
现在这是一个旧话题,但我又给新书“ Statistical Rethinking” +1 +1了。在寻找该话题中排名较高的答案时,我认为还没有一个关键的区别:谁能“入门”?统计学的第一门课程(恰好采用贝叶斯方法)?对具有基本的本科(非贝叶斯)统计课程的人介绍贝叶斯方法?或为最终拥有非贝叶斯统计学的从业者介绍贝叶斯统计被说服这贝叶斯的东西不是时尚吗?引言截然不同
韦恩

Answers:


79

John Kruschke于2011年中发布了一本书,名为《做贝叶斯数据分析:R和BUGS教程》。(第二版于2014年11月发布:做贝叶斯数据分析,第二版:R,JAGS和Stan教程。)它确实是入门。但是,如果您想从常客统计数据转到贝叶斯数据,特别是在使用多层次建模时,我建议使用Gelman和Hill。

John Kruschke也有一个用于该书网站,该书以BUGS和JAGS形式提供了本书中的所有示例。他有关贝叶斯统计的博客也与该书链接。


@Amir的建议与此重复。(这本书的完整标题是“进行贝叶斯数据分析:R和BUGS教程”。)作为一本真正的入门书籍,我分别对+1。
韦恩2012年

更新了标题并添加了两个相关链接。
Jeromy Anglim

4
我也投票支持克鲁施克的书。我已经浏览了答案中列出的大多数书籍,而这是我发现的最清晰的书籍。IMO,这是我读过的最清晰的统计书。R代码可用于将公式与代码相匹配,这在很大程度上有用。作者从非常简单的示例开始,并以此为基础。需要很少的背景。亚马逊上的所有评论都非常好评。霍夫的书是我的第二本。
julieth

哈哈,我喜欢这本书的封面:“为什么
要给

我的投票也投给了克鲁斯克(Kruschke)的2010年著作。在尝试学习贝叶斯统计时,我尝试了其中的几种,而这一点很成功。硬。
Patrick Coulombe 2014年

55

我最喜欢的是Gelman等人的“贝叶斯数据分析”


28
这是一本入门书籍,适用于已经拥有相当数量的统计背景的人们。
约翰·萨尔瓦捷

38
我9个月前开始统计学专业的博士学位,说实话,盖尔曼的BDA仍然在我之上,所以我不会将其称为介绍性文字!
肖恩

5
-1,因为根据多个评论和其他答案,这不是入门。
naught101

6
@ naught101,所以您不了解这本书就投反对票了吗?
推测2015年

5
前四,五章是真正的入门!所以属于这里。
kjetil b halvorsen

33

统计重新思考Statistical Rethinking)刚刚在几周前发布,因此我仍在阅读,但我认为这是对有关贝叶斯统计的真正入门书籍的很好的补充。作者所用的方法与约翰•克鲁施克(John Kruschke)在其幼书中所用的方法类似; 他非常冗长,详尽的解释,漂亮的教学示例,他还使用计算而非数学方法。

您也可以从这里获得YouTube讲座和其他材料。

代码移植到Python / PyMC3


4
+1我正在听讲座。他很有娱乐性,而且态度很好。这本书非常好,将您从基础知识带入了层次模型。它仅假设读者具有一定的科学知识,对数学有一定的了解(不包括微积分),并且听说过一些有关统计的知识。这是我希望得到的书。他呈现事物的顺序,他的助手系统非常出色。
韦恩

1
我碰到了一堵墙,试图遍历克鲁什克的书,他开始在逻辑上取得我无法理解的重大飞跃。幸运的是,我遇到了《统计重新思考》,这是迄今为止我发现的唯一一本能够真正使您对该主题有直观理解的书。
Brideau

学习完该主题后,我尝试阅读本书的第一章,发现作为非英语母语者非科学家很难。首先,我必须经历诸如认识论特质之类的词,然后是长长的句子,我必须阅读两次/三次,才能理解tehy的字面意思(忘记这些句子的结论)。然后第一个例子是关于自然进化的,对我来说听起来像是希腊语:位点数量,等位基因数量,中性。这本书对很多人来说可能很容易,但是对许多人来说却可能很困难
Gaurav Singhal '18

30

吉尔曼(Gelman)等人的另一票,但对我来说紧随其后的是-边干边学的说服力-吉姆·阿尔伯特(Jim Albert)的“用R进行贝叶斯计算”


5
强烈同意。都是很棒的书。从R的贝叶斯计算开始,然后得到Gelman等。
PeterR

26

Sivia and Skilling,数据分析:贝叶斯教程(第二版)2006 246p 0198568320 books.goo

统计讲座已经使几代学生感到困惑和沮丧。本书试图通过对数据分析的整个主题阐述一种逻辑统一的方法来纠正这种情况。本文旨在作为科学和工程专业的高年级本科生和研究生的教程指南...

我不知道其他建议。


3
这本书很棒。它简短实用。
约翰·萨尔瓦捷

2
我认为这是比Gelman 好得多的介绍性文字。
肖恩

21

作为介绍,我将推荐Cam Davidson-Pilon的《概率概率编程和贝叶斯黑客方法》,可在线免费获得。

从其描述:

从计算/理解第一,数学第二的角度介绍贝叶斯方法和概率编程。

它具有高度的视觉效果,可以直接切入值并稍后回填粗砂细节,包含大量示例,具有交互式代码(在IPython Notebook中)。


4
我认为这本网上书很难听懂/写得不好。
captain_ahab 2015年

2
我认为这本书很好。
SmallChess

1
我认为这本书是一个梦幻般的介绍为程序员与贝叶斯统计一个伟大的经历
SARose

19

我彻底推荐了ET Jaynes的有趣的辩论性的“概率论:科学的逻辑”。

这是一种介绍性文本,其含义是不需要(实际上更喜欢)没有统计学知识,但最终确实使用了相当复杂的数学。与所提供的大多数其他答案相比,这本书并不实用或不易理解,而是为您为什么要使用贝叶斯方法以及为什么不使用常客方法提供了哲学基础。它是历史性和哲学性的,但不是教学性的。


8
这是一本关于贝叶斯思想的出色著作,而不是应用贝叶斯方法。我认为这是贝叶斯计算的好伴侣。
概率

3
这是放置它的好方法。我认为Sivia and Skilling是在实践中介绍方法的理想伴侣(已经在另一个答案中提出了建议)。
Bogdanovist 2012年

2
娱乐性,辩论性和原创性,当然,但绝对不是入门书。
西安

19

我是一名电气工程师,而不是统计学家。我花了很多时间来学习Gelman,但我认为根本不会把Gelman当作入门。卡内基·梅隆大学的贝叶斯大师教授对此表示同意。对统计信息和R和Bug的了解最少(这是使用贝叶斯stat做某事的简便方法) 做贝叶斯数据分析:R和BUGS教程 是一个了不起的起点。您可以通过书的封面轻松比较所有提供的书!

5年后更新:我想补充一点,也许另一个快速学习(40分钟)的主要方法是浏览基于贝叶斯Net GUI的工具(如Netica 2)的文档。它从基础开始,逐步引导您根据情况和数据构建网络,以及如何来回运行自己的问题以“获取信息!”。


1
这是上面@rosser答案的重复。作为一本真正的入门书籍,我为每本书+1。
韦恩

16

它的重点并不严格地放在贝叶斯统计上,因此它缺少一些方法论,但是戴维·麦凯的信息论,推理和学习算法使我比其他人更直观地掌握贝叶斯统计-大多数都做得很好,但是我觉得麦凯解释了为什么更好。


6
可在作者页面免费下载:inference.phy.cam.ac.uk/mackay/itila/book.html
PeterR

5
像Sivia一样,如果您具有一定的物理背景,这会非常好,否则,可能会很粗糙。对于任何类型的应用社会统计(对于使用Gelman和Hill或上述Gelman等人的应用)而言,这都不是一个很好的指南,但是对于促使您真正思考核心问题确实很有用。
conjugateprior 2010年

16

盖尔曼的书都是非常出色的书,但不一定是入门书,因为它们假定您已经知道一些统计数据。因此,它们是贝叶斯统计方法的简介,而不是一般的统计信息。但是,我还是会给他们竖起大拇指。

作为一本介绍贝叶斯观点的统计学/计量经济学入门书籍,我将推荐加里·库普(Gary Koop)的贝叶斯计量经济学


15

Marin和Robert,Springer-Verlag(2007)提出的“ 贝叶斯核心:计算贝叶斯统计的实用方法 ” 。

“为什么?”:作者解释了为什么选择贝叶斯,以及如何做得很好。这是一本实用的书,但由世界上最好的贝叶斯思想家之一撰写。这并不详尽。其他书有这个目标。它挑选了一些相关的,有用的并且阐明了基础的主题。

关于“选择”:如果您真的想深入了解贝叶斯基础,那么西安的“贝叶斯选择”清晰,深刻,必不可少。


7
@西安和盖比,请解释为什么可以推荐这本书。适合谁呢?从什么意义上说“最好”?
ub

4
我不想陷入自我推销。贝叶斯核心是针对最常用模型和计算方法(已提供R代码)的贝叶斯推理的独立入口。它需要一些概率论的背景知识,对于某些读者来说可能太过...(它与法国的4年级和5年级学生很好地兼容。)
西安


13

我不知道为什么没人提到关于贝叶斯的入门书籍:

在此处输入图片说明

该书有一个免费的PDF版本。这本书为那些几乎没有贝叶斯经验的人提供了足够的材料。它介绍了先验分布,后验分布,β分布等概念。

试一试,它是免费的。

http://greenteapress.com/thinkbayes/






9

看看“贝叶斯选择”。它具有完整的软件包:基础,应用程序和计算。写清楚。


如果解决方案手册可供自学,那么它不仅是“贝叶斯”,而且是“绝佳选择”。看来这只供大学使用...
gwr

9

我至少浏览了此列表中的大多数内容,但我认为这些都不如新的贝叶斯思想和数据分析那么好。

编辑:阅读本书很容易立即开始进行贝叶斯分析。不仅要根据具有已知方差的正态分布对均值建模,还需要对前几章进行实际数据分析。所有代码示例和数据都在本书的网站上。涵盖了相当数量的理论,但重点是应用程序。大量模型中的许多示例。关于贝叶斯非参数的不错的一章。Winbugs,R和SAS示例。与进行贝叶斯数据分析相比,我更喜欢它(两者都有)。在我看来,此处的大多数书籍(Gelman,Robert等)都不是入门书籍,除非您与他人交谈,否则您可能会遇到更多问题,而没有答案。阿尔伯特的书没有涵盖足够的材料,无法轻松地分析与书中提供的数据不同的数据(再次我认为)。


2
“好”在什么意义上?
ub

好点子。和最佳入门贝叶斯教科书一样好。我相信它比Albert的R的贝叶斯数据分析“更好”,我发现Gelman等人的贝叶斯数据分析。作为介绍还不够。但是,在学习了一些贝叶斯材料之后,它是一个很好的参考。
Glen



7

我只是必须将MCMC包括在实践中。它提供了关于MCMC的出色介绍,也许不像其他书本所介绍的那么概括,但是对于获得洞察力和直觉非常有用。我建议在使用R进行贝叶斯计算之后(或与之并行)阅读它。


我认为,mcmc不应成为贝叶斯统计入门的重点。我认为拒绝采样作为了解贝叶斯学习如何工作的一种方法更具吸引力。同样,最小二乘是贝叶斯(最大似然),因此与mcmc相比,它也代表了对贝叶斯统计的更温和的介绍。
概率

2
我的观点是,应避免使用mcmc并将其用作最后的手段-在大多数情况下,它花费的时间太长了(尽管我处理的大数据集基本上都是mle)。mcmc在某种程度上是“大锤”。另外,mcmc是用于数值积分的算法。仅此而已。它应该接受与其他算法(例如拉普拉斯方法和四边形)相同的介绍性处理。否则,人们将对“贝叶斯统计”是什么持狭develop看法。
概率

6

如果您碰巧来自物理科学(物理学/天文学),我建议您使用贝叶斯逻辑科学的数据分析:格雷戈里(2006)的Mathematica®支持比较方法

尽管标题的“具有Mathematica®支持”部分仅用于商业问题(Mathematica代码的用法非常差),但这本书的好处是,它确实是对概率和统计学主题的介绍。它甚至有一些关于常客统计的章节。但是,一旦您尝试一下,就去看看Gelman等人的书。还有很多人推荐你 格雷戈里书中的大部分材料都是轻描淡写的(如果不是,那不是介绍):盖尔曼的书对我而言确实是格雷戈里的重新唤醒。


菲尔·格雷格里(Phil Gregory)的书确实是一个非常不错的介绍,有点像博尔斯塔德(Bolstad)对具有高级数学背景的人的介绍。在Phil Gregory的网站上可以找到更多的资源,还有一个补充文件,它解决了层次模型和缺失数据处理问题。
gwr

6

我读:

Gelman等人(2013)。贝叶斯数据分析。CRC Press LLC。第三版。

霍夫,彼得D(2009)。贝叶斯统计方法的第一门课程。统计资料中的史宾格文字。

Kruschke,《进行贝叶斯数据分析:R和Bug教程》,2011年。AcademicPress / Elsevier。

我认为最好的一本书是克鲁斯克的书。对于第一种贝叶斯思维方法而言,它是完美的:概念解释得很清楚,没有太多的数学,并且有很多很好的例子!

Gelman等。是一本很棒的书,但它更高级,我建议在克鲁什克的书之后再读。

相反,我不喜欢霍夫的书,因为它是入门书籍,但是概念(和贝叶斯思想)没有得到清晰的解释。我建议通过。


6

如果我必须为初学者选择一个文本,那将是

              Sivia DS and Skilling J (2006) book (see below). 

在下面列出的所有书籍中,力求直观地理解基本思想,但是仍然需要从第1页开始进行一些数学上的改进。

以下是我的书的进一步阅读清单,以及对每个出版物的评论。

Bernardo,JM和Smith,A,(2000年)4。贝叶斯理论对贝叶斯方法的严格说明,其中包含许多实际示例。

Bishop,C(2006)5。模式识别和机器学习。如标题所示,这主要是关于机器学习的,但是它提供了对贝叶斯方法的清晰而全面的描述。

Cowan G(1998)6。统计数据分析。出色的非贝叶斯统计分析入门。

Dienes,Z(2008)8。将心理学理解为一门科学:科学和统计推断简介。提供有关贝叶斯规则的教程材料,并对贝叶斯统计和常客统计之间的区别进行清晰的分析。

Gelman A,Carlin J,Stern H和Rubin D.(2003年)14。贝叶斯数据分析。贝叶斯分析的严格而全面的说明,其中包含许多实际示例。

Jaynes E和Bretthorst G(2003)18。概率论:科学逻辑。贝叶斯分析的现代经典。这是全面而明智的。它的论述风格使它很长(600页),但从不枯燥,并且充满了见解。

Khan,S,2012,贝叶斯定理简介。Salman Khan的在线数学视频很好地介绍了各种主题,包括贝叶斯定律。

李PM(2004)27。贝叶斯统计:简介。严谨而全面的文本,带有鲜明的贝叶斯风格。

MacKay DJC(2003)28。信息论,推理和学习算法。信息论的现代经典。可读性很强的文本,涉及许多主题,几乎所有主题都利用贝叶斯规则。

Migon,HS和Gamerman,D(1999)30.统计推断:一种综合方法。一个简单(明确列出)的推理说明,它比较了贝叶斯方法和非贝叶斯方法。尽管相当先进,但写作风格实际上是教程。

Pierce JR(1980)34第二版。信息理论导论:符号,信号和噪声。皮尔斯以非正式的教程式的写作方式写作,但毫不畏缩地介绍信息论的基本定理。

Reza,FM(1961)35。信息理论导论。与上面的皮尔斯书相比,它是一本更全面,更数学上更严格的书,理想情况下,应在初读皮尔斯的非正式文本后才能阅读。

Sivia DS和Skilling J(2006)38。数据分析:贝叶斯教程。这是贝叶斯方法的极好的教程风格介绍。

Spiegelhalter,D和Rice,K(2009)36。贝叶斯统计。学术论文集,4(8):5230。 http://www.scholarpedia.org/article/Bayesian_statistics 贝叶斯统计信息的当前状态的可靠且全面的摘要。

而且,这是我的书,2013年6月出版。

贝叶斯法则:贝叶斯分析入门,詹姆斯五世博士,ISBN 978-0956372840

可以从以下网站下载第1章:http : //jim-stone.staff.shef.ac.uk/BookBayes2012/BayesRuleBookMain.html

描述:贝叶斯规则是由18世纪的数学家和传教士发现的,是现代概率论的基石。在这本插图丰富的书中,使用了一系列易于理解的示例来说明贝叶斯规则实际上是常识性推理的自然结果。贝叶斯规则是使用直观的概率图形表示得出的,而贝叶斯分析则使用提供的MatLab程序应用于参数估计。教程的写作风格以及全面的词汇表使其成为希望熟悉贝叶斯分析基本原理的新手的理想入门书。

在此处输入图片说明


4

并不是严格说来的贝叶斯统计,但是我可以强烈推荐罗杰斯和吉罗拉米(Rogers and Girolami)撰写的“机器学习第一门课程”,它本质上是对贝叶斯机器学习方法的介绍。它的结构非常清晰明了,适合没有深厚数学背景的学生。这意味着这是对贝叶斯思想的很好的入门。还有MATLAB / OCTAVE代码,这是一个不错的功能。


4

社会科学家的贝叶斯统计。菲利普斯(Phillips),劳伦斯(Lawrence D.)(1973),托马斯·克罗威尔(Thomas Crowell&Co.)非常清楚,通俗易懂,无需任何统计知识,而且与博尔斯塔德(Bolstad)一样,我发现他很干,但有些个性。


3

本书建议针对入门级本科生

生物统计学:贝叶斯导论。乔治·伍兹沃斯(George G Woodsworth)。

由John Wiley&Sons发布



2

由于问题中未指定初学者的类型,因此这是我对初学者的建议:

Andrew B.Lawson和Emmanuel Lesaffre(2012):贝叶斯生物统计

这本书是我们统计科学硕士课程的第一年使用的,对于这样一个困难的主题,我发现它相对容易理解。与大多数“生物统计学”书籍一样,这些示例主要是临床生物学,但方法并不限于在临床科学中有用的方法。在此之前,我们接受了大约半年的统计教育,除了贝叶斯定理外,还没有引入贝叶斯统计。

很好的是,随附的演示文稿的全部649张幻灯片都可以在线获得

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