关于“实验室笔记本”软件的想法?


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因此,这很奇怪,尽管实际上我认为这对任何站点都非常合适,所以我认为我会在我的数据处理专家中尝试一下。

我从生物学学到流行病学和生物统计学,但仍然肯定有该领域的一些习惯。其中之一是保留实验室笔记本。它对于记录思想,决策,关于分析的沉思等等很有用。所有这些都集中在一个地方,所有的事情都发生了,所以我以后可以回顾分析并了解我的所作所为。

但是,最好将其转移到21世纪。特别是因为即使实验室笔记本系统对于一个人来说足够体面并记录决策,还是能够附加来自EDA的图表,来自讨论特定数据集的数据管理员的电子邮件等,这还是很好的。

我猜想这将涉及从许多不同的地方联合起来组装我自己的系统,但是目前有人在使用系统并有任何建议吗?


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我认为,可以让祖父(即,保持开放)此线程。
gung-恢复莫妮卡

Answers:


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这些被称为电子实验室笔记本(ELN)。

这是我看过的一些开源选项:

  1. 鼠尾草笔记本

  2. 新的IPython Notebook现在可以作为Webapp在EC2和Azure上运行。

  3. Leo,可以与IPython以及其他许多方式一起使用。

  4. 各种Wiki,博客和CMS解决方案。


我最终使用了免费的Wikispaces Wiki作为我目前的实验实验室笔记本替代品。
Fomite,2011年

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我最喜欢的:Evernote。您可以标记条目(例如“分析”,“想法”等),可以粘贴图片和图形,还可以与合作者共享笔记本。并且:它基本上是免费的(嗯,免费增值)。但是免费版对我来说绝对足够。


此外,还有适用于Android和iOS的免费应用程序。
Jose Zubcoff

+1我发现Evernote的移动应用在实验室之间跑来跑去或离开计算机时记下想法时特别有用。
jthetzel

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我从未亲自使用过它,但是Microsoft在Office套件中有一个名为OneNote的软件,可以实现与您的电子实验室笔记本规格类似的目标。请参阅他们的网站以获取更多信息。他们还提供免费试用与MS Office捆绑在这里


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@mbq您是否找到了可以替代Onenote的不错的Linux?
andreas-h 2013年

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我发现Xmind有用。您可以附加任何内容,树结构对于组织确实很有用。我特别喜欢该功能,您可以在其中深入节点(主题)。还有更多利用相同概念的相似软件产品。


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Freeplane和Freemind是我用于各种项目的两个免费替代方案。FreeMind的新分支是SciPlore MindMappings,它包括对BibTeX引用的支持以及从PDF导入书签的支持。
韦恩

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我个人已经找到了上帝派来的Livescribe “智能笔”。

它融合了传统的笔和纸质笔记本的可信赖的“旧世界的魅力”,但包括录制声音(与您的笔触同步)以备以后修改的功能。NB-有一个缺点,那就是您必须购买可以用笔操作的特殊纸张。..实际上,摆动和回合

音频/笔的笔迹可以上传到网络上,然后附加到上面已经隐藏的许多其他程序中。

我教过的学生(生物力学)绝对喜欢这一点,并且发现以后对困难概念的学习比以前容易得多(prelivescribe)


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您可能想查看最新的Zotero beta,它现在是独立的,不需要Firefox。


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Zotero是书目经理,而不是ELN。
nico

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@nico:我相信您可以在Zotero中存储任何您想要的东西,包括您自己的文档。它不完全是ELN,但它是免费的,并且可以轻松地包含(和索引)其他材料。
韦恩

当然,您提到它真是太好了(我经常使用它,而且令人惊讶),但是还存在其他被认为是ELN的开源替代方案,那么为什么不使用它们呢?
nico

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请查看《自然先驱》中的这篇文章,美化现实世界中的数据,以获取一些想法。


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那是一篇不错的文章,但这将有助于总结您答案中的某些信息
日安倍晋三

@Abe,您好,是的,这会有所帮助。我还没有自己读过这篇文章,只是在昨天才发现它,而自己对此主题并没有特别的兴趣。我以为我还是会分享。
查理

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