SAS和R中ANOVA中III型平方和的冲突结果


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我从不平衡因子实验都与分析数据SASR。双方SASR提供平方类似的I型和广场,但他们的III型总和彼此不同。以下是SASR代码以及输出。

DATA ASD;
INPUT Y T B;
DATALINES;
 20 1 1
 25 1 2
 26 1 2
 22 1 3
 25 1 3
 25 1 3
 26 2 1
 27 2 1
 22 2 2
 31 2 3
;

PROC GLM DATA=ASD;
CLASS T B;
MODEL Y=T|B;
RUN;

SAS的I型SS

Source  DF       Type I SS     Mean Square    F Value    Pr > F
T       1     17.06666667     17.06666667       9.75    0.0354
B       2     12.98000000      6.49000000       3.71    0.1227
T*B     2     47.85333333     23.92666667      13.67    0.0163

SAS的III型SS

Source  DF     Type III SS     Mean Square    F Value    Pr > F
T       1     23.07692308     23.07692308      13.19    0.0221
B       2     31.05333333     15.52666667       8.87    0.0338
T*B     2     47.85333333     23.92666667      13.67    0.0163

R代码

Y <- c(20, 25, 26, 22, 25, 25, 26, 27, 22, 31)
T <- factor(x=rep(c(1, 2), times=c(6, 4)))
B <- factor(x=rep(c(1, 2, 3, 1, 2, 3), times=c(1, 2, 3, 2, 1, 1)))
Data <- data.frame(Y, T, B)
Data.lm <- lm(Y~T*B, data = Data)
anova(Data.lm)
drop1(Data.lm,~.,test="F") 

R型I SS

Analysis of Variance Table

Response: Y
          Df Sum Sq Mean Sq F value  Pr(>F)  
T          1 17.067  17.067  9.7524 0.03543 *
B          2 12.980   6.490  3.7086 0.12275  
T:B        2 47.853  23.927 13.6724 0.01629 *
Residuals  4  7.000   1.750                  
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1   1 

R型III型SS

Single term deletions

Model:
Y ~ T * B
       Df Sum of Sq    RSS     AIC F value  Pr(>F)  
<none>               7.000  8.4333                  
T       1    28.167 35.167 22.5751 16.0952 0.01597 *
B       2    20.333 27.333 18.0552  5.8095 0.06559 .
T:B     2    47.853 54.853 25.0208 13.6724 0.01629 *
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1   1 

我在这里想念什么吗?如果不是哪一种是正确的III型SS?


请在此处查看John Fox的回复:tolstoy.newcastle.edu.au/R/help/05/11/16368.html
Aaron

Answers:


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III型SS取决于所使用的参数设置。如果我设置

  options(contrasts=c("contr.sum","contr.poly"))

在运行之前lm()drop1()我得到与SAS完全相同的III型SS。对于有关此问题的R社区教条,您应该阅读关于线性模型的 Venables的训ege

另请参阅:R中的III型SS ANOVA如何使用对比代码?


1
@Peter如果您认为它可以发表评论,那为什么不呢。我不这么认为,所以为什么不问一个新问题(并链接到这个问题)?
chl 2012年

1
@chl我的基本观点是,在存在交互作用时,主要效果确实具有意义-它们是另一个变量为0时的效果。通常,这是有意义的。不确定是否值得使用整个线程。
彼得·弗洛姆-恢复莫妮卡

3
我同意在某些情况下可以解释主要影响-Venables有很强的界限-但在很多情况下很难做到。我认为“除非您知道自己在做什么,否则不要这样做”是一个合理的默认设置……
Ben Bolker

1
以下内容是否会将对比度重置为R标准?options(contrasts=c("contr.treatment", "contr.poly"))
Rasmus Larsen

1
是的.........
Ben Bolker
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