教科书在解释主题时,通常会以漂亮的示例样条为基础,说明统一样条曲线的基础。像是线性样条线的一排小三角形,或者是三次样条线的一排小驼峰。
这是一个典型的例子:
我想知道是否有使用标准R函数(如bs或ns)生成样条曲线基础图的简便方法。我猜想有一个简单的矩阵算术与一个琐碎的R程序相结合,可以优雅地吐出漂亮的样条曲线图。我只是想不到!
教科书在解释主题时,通常会以漂亮的示例样条为基础,说明统一样条曲线的基础。像是线性样条线的一排小三角形,或者是三次样条线的一排小驼峰。
这是一个典型的例子:
我想知道是否有使用标准R函数(如bs或ns)生成样条曲线基础图的简便方法。我猜想有一个简单的矩阵算术与一个琐碎的R程序相结合,可以优雅地吐出漂亮的样条曲线图。我只是想不到!
Answers:
这里有一个autoplot
方法为“基础”课(两者BS和NS继承):
library(ggplot2)
library(magrittr)
library(reshape2)
library(stringr)
autoplot.basis <- function(basis, n=1000) {
all.knots <- sort(c(attr(basis,"Boundary.knots") ,attr(basis, "knots"))) %>%
unname
bounds <- range(all.knots)
knot.values <- predict(basis, all.knots) %>%
set_colnames(str_c("S", seq_len(ncol(.))))
newx <- seq(bounds[1], bounds[2], length.out = n+1)
interp.values <- predict(basis, newx) %>%
set_colnames(str_c("S", seq_len(ncol(.))))
knot.df <- data.frame(x=all.knots, knot.values) %>%
melt(id.vars="x", variable.name="Spline", value.name="y")
interp.df <- data.frame(x=newx, interp.values) %>%
melt(id.vars="x", variable.name="Spline", value.name="y")
ggplot(interp.df) +
aes(x=x, y=y, color=Spline, group=Spline) +
geom_line() +
geom_point(data=knot.df) +
scale_color_discrete(guide=FALSE)
}
这使您可以仅调用autoplot
ns或bs对象。以jbowman为例:
library(splines)
x <- seq(0, 1, by=0.001)
spl <- bs(x,df=6)
autoplot(spl)
产生:
编辑:这将包含在ggfortify软件包的下一版本中:https : //github.com/sinhrks/ggfortify/pull/129。在那之后,我相信您所需要的只是:
library(splines)
library(ggfortify)
x <- seq(0, 1, by=0.001)
spl <- bs(x,df=6)
autoplot(spl)
matplot
函数比遍历各列要有效得多。