我最近开始使用MCMC算法(实际上是R中的MCMCglmm函数)在贝叶斯框架中拟合回归混合模型。
我相信我已经了解了如何诊断估计过程的收敛性(迹线,geweke图,自相关,后验分布...)。
在贝叶斯框架中给我留下深刻印象的一件事是,似乎花了很多精力来进行这些诊断,而在检查拟合模型的残差方面却似乎做得很少。例如,在MCMCglmm中,确实存在残留的.mcmc()函数,但实际上尚未实现(即返回:“尚未为MCMCglmm对象实现的残留物”; predict.mcmc()的情况相同)。在其他软件包中似乎也缺少它,而且在我发现的文献中,除讨论广泛的DIC之外,它几乎没有被讨论过。
谁能指出一些有用的参考,理想情况下,我可以使用或修改R代码?
非常感谢。
好问题。我真的很喜欢安德鲁·盖尔曼的纸与科斯马·沙利齐约贝叶斯模型检验。
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David J. Harris