R似乎能够从R2WinBUGS :: bugs和R2jags:jags函数生成的bugs
和jags
对象中输出漂亮的摘要图。
但是,我正在使用该rjags
软件包。当我尝试rjags::coda.samples
使用R2WinBUGS::plot.mcmc.list
结果绘制函数结果时,是每个参数的诊断图(参数密度,链时间序列,自相关)。
下面是我想制作的绘图类型,来自安德鲁· 盖尔曼( Andrew Gelman)的教程“ R中运行WinBuugs和OpenBugs”。这些是使用制作的plot.pugs
。
问题是plot.bugs
将一个bugs
对象作为参数,而plot.mcmc.list
将的输出作为参数coda.samples
。
这是一个示例(来自coda.samples
):
library(rjags)
data(LINE)
LINE$recompile()
LINE.out <- coda.samples(LINE, c("alpha","beta","sigma"), n.iter=1000)
plot(LINE.out)
我需要的是
- 一种生成相似的,信息丰富的一页摘要图的方法,类似于
plot.bugs
- 将转换
LINE.out
为bug对象的函数,或者
mcmc.list
(据我所知)开头的问题。