我正在尝试基于稀疏/不连续的数据集分解协方差矩阵。我注意到,svd
随着越来越差的数据,λ的总和(解释方差)用来计算。没有差距,svd
并eigen
获得相同的结果。
eigen
分解似乎不会发生这种情况。我一直倾向于使用,svd
因为lambda值始终为正,但是这种趋势令人担忧。是否需要某种校正,或者应该svd
完全避免此类问题。
###Make complete and gappy data set
set.seed(1)
x <- 1:100
y <- 1:100
grd <- expand.grid(x=x, y=y)
#complete data
z <- matrix(runif(dim(grd)[1]), length(x), length(y))
image(x,y,z, col=rainbow(100))
#gappy data
zg <- replace(z, sample(seq(z), length(z)*0.5), NaN)
image(x,y,zg, col=rainbow(100))
###Covariance matrix decomposition
#complete data
C <- cov(z, use="pair")
E <- eigen(C)
S <- svd(C)
sum(E$values)
sum(S$d)
sum(diag(C))
#gappy data (50%)
Cg <- cov(zg, use="pair")
Eg <- eigen(Cg)
Sg <- svd(Cg)
sum(Eg$values)
sum(Sg$d)
sum(diag(Cg))
###Illustration of amplification of Lambda
set.seed(1)
frac <- seq(0,0.5,0.1)
E.lambda <- list()
S.lambda <- list()
for(i in seq(frac)){
zi <- z
NA.pos <- sample(seq(z), length(z)*frac[i])
if(length(NA.pos) > 0){
zi <- replace(z, NA.pos, NaN)
}
Ci <- cov(zi, use="pair")
E.lambda[[i]] <- eigen(Ci)$values
S.lambda[[i]] <- svd(Ci)$d
}
x11(width=10, height=5)
par(mfcol=c(1,2))
YLIM <- range(c(sapply(E.lambda, range), sapply(S.lambda, range)))
#eigen
for(i in seq(E.lambda)){
if(i == 1) plot(E.lambda[[i]], t="n", ylim=YLIM, ylab="lambda", xlab="", main="Eigen Decomposition")
lines(E.lambda[[i]], col=i, lty=1)
}
abline(h=0, col=8, lty=2)
legend("topright", legend=frac, lty=1, col=1:length(frac), title="fraction gaps")
#svd
for(i in seq(S.lambda)){
if(i == 1) plot(S.lambda[[i]], t="n", ylim=YLIM, ylab="lambda", xlab="", main="Singular Value Decomposition")
lines(S.lambda[[i]], col=i, lty=1)
}
abline(h=0, col=8, lty=2)
legend("topright", legend=frac, lty=1, col=1:length(frac), title="fraction gaps")
很抱歉无法遵循您的代码(不知道R),但这是一个或两个概念。负特征值可以出现在cov的特征分解中。如果原始数据有很多缺失值,并且在计算cov时将它们成对删除,则矩阵。这样的矩阵的SVD会(误导性地)将那些负特征值报告为正。您的图片显示,本征分解和svd分解的行为类似(如果不完全相同),除了关于负值的区别之外。
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ttnphns
PS希望您理解我:特征值的总和必须等于cov的迹线(对角线总和)。矩阵。但是,SVD对某些特征值可能为负的事实“视而不见”。SVD很少用于分解非语法的cov。矩阵,通常与已知的gramian(正半定)矩阵或原始数据一起使用
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ttnphns 2012年
@ttnphns-感谢您的见解。我想我不会担心
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马克·马克(Marc)在
svd
如果不是针对特征值的不同形状所给出的结果。结果显然使尾随特征值比应有的重要性更大。