如何阅读R的nls的拟合优度?


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我试图解释nls()的输出。我已经阅读了这篇文章,但我仍然不明白如何选择最合适的。根据我的拟合,我有两个输出:

> summary(m)

  Formula: y ~ I(a * x^b)

  Parameters:
  Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)    
  a 479.92903   62.96371   7.622 0.000618 ***
  b   0.27553    0.04534   6.077 0.001744 ** 
  ---
  Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1   1 

  Residual standard error: 120.1 on 5 degrees of freedom

  Number of iterations to convergence: 10 
  Achieved convergence tolerance: 6.315e-06 

> summary(m1)

  Formula: y ~ I(a * log(x))

  Parameters:
  Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)    
  a   384.49      50.29   7.645 0.000261 ***
  ---
  Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1   1 

  Residual standard error: 297.4 on 6 degrees of freedom

  Number of iterations to convergence: 1 
  Achieved convergence tolerance: 1.280e-11

第一个参数有两个参数,残留误差较小。第二个参数只有一个,但残差最差。哪个最合适?


4
x

3
我删除了我的答案,该答案建议使用AIC,因为注释引起了有说服力的论点,即AIC通常不适用于nls适合的选择。我将始终尝试根据机械知识来决定非线性模型,尤其是如果数据集与您的数据集一样小时。
罗兰

1
嗯 @Roland现在删除的答案的原始评论者愿意重新发表评论吗?对于我来说,立即了解为什么AIC不适合...(虽然stat.ethz.ch/pipermail/r-help/2010-August/250742.html给出了一些提示),但作为最后的提示,如果您在尝试确定功率变换时,您可以尝试Box-Cox变换(boxcoxMASS包装中)
Ben Bolker 2012年

1
AIC可用于选择模型。

Answers:


2

您可以简单地使用F检验和方差分析对其进行比较。这是一些代码。

> x <- 1:10
> y <- 2*x + 3                            
> yeps <- y + rnorm(length(y), sd = 0.01)
> 
> 
> m1=nls(yeps ~ a + b*x, start = list(a = 0.12345, b = 0.54321))
> summary(m1)

Formula: yeps ~ a + b * x

Parameters:
   Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)    
a 2.9965562  0.0052838   567.1   <2e-16 ***
b 2.0016282  0.0008516  2350.6   <2e-16 ***
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1   1 

Residual standard error: 0.007735 on 8 degrees of freedom

Number of iterations to convergence: 2 
Achieved convergence tolerance: 3.386e-09 

> 
> 
> m2=nls(yeps ~ a + b*x+c*I(x^5), start = list(a = 0.12345, b = 0.54321,c=10))
> summary(m2)

Formula: yeps ~ a + b * x + c * I(x^5)

Parameters:
   Estimate Std. Error  t value Pr(>|t|)    
a 3.003e+00  5.820e-03  516.010   <2e-16 ***
b 1.999e+00  1.364e-03 1466.004   <2e-16 ***
c 2.332e-07  1.236e-07    1.886    0.101    
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1   1 

Residual standard error: 0.006733 on 7 degrees of freedom

Number of iterations to convergence: 2 
Achieved convergence tolerance: 1.300e-06 

> 
> anova(m1,m2)
Analysis of Variance Table

Model 1: yeps ~ a + b * x
Model 2: yeps ~ a + b * x + c * I(x^5)
  Res.Df Res.Sum Sq Df     Sum Sq F value Pr(>F)
1      8 0.00047860                             
2      7 0.00031735  1 0.00016124  3.5567 0.1013
>

5
有关如何解释结果的更多信息?
skan 2015年

请展开。对于我的数据集,我没有得到F值和Pr(> F)的输出。进行方差分析的目的是什么?我只熟悉用于比较类别而非模型的内容。
user3386170
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