我发现一些BUGS和R具有不同参数化的分布:正态,对数正态和Weibull。
对于这些中的每一个,我都收集到R所使用的第二个参数需要在BUGS(在我的情况下为JAGS)中使用之前需要进行逆变换(1 /参数)。
有人知道当前存在的这些转换的完整列表吗?
我能找到的最接近的结果是将JAGS 2.2.0用户手册的表7中的分布与etc的结果?rnorm
以及一些概率文本进行比较。这种方法似乎需要分别从pdf推导转换。
如果执行此任务,我希望避免执行此任务(以及可能的错误),否则,请从此处开始列表。
更新资料
基于Ben的建议,我编写了以下函数,将参数的数据帧从R转换为BUGS参数化。
##' convert R parameterizations to BUGS paramaterizations
##'
##' R and BUGS have different parameterizations for some distributions.
##' This function transforms the distributions from R defaults to BUGS
##' defaults. BUGS is an implementation of the BUGS language, and these
##' transformations are expected to work for bugs.
##' @param priors data.frame with colnames c('distn', 'parama', 'paramb')
##' @return priors with jags parameterizations
##' @author David LeBauer
r2bugs.distributions <- function(priors) {
norm <- priors$distn %in% 'norm'
lnorm <- priors$distn %in% 'lnorm'
weib <- priors$distn %in% 'weibull'
bin <- priors$distn %in% 'binom'
## Convert sd to precision for norm & lnorm
priors$paramb[norm | lnorm] <- 1/priors$paramb[norm | lnorm]^2
## Convert R parameter b to JAGS parameter lambda by l = (1/b)^a
priors$paramb[weib] <- 1 / priors$paramb[weib]^priors$parama[weib]
## Reverse parameter order for binomial
priors[bin, c('parama', 'paramb')] <- priors[bin, c('parama', 'paramb')]
## Translate distribution names
priors$distn <- gsub('weibull', 'weib',
gsub('binom', 'bin',
gsub('chisq', 'chisqr',
gsub('nbinom', 'negbin',
as.vector(priors$distn)))))
return(priors)
}
##' @examples
##' priors <- data.frame(distn = c('weibull', 'lnorm', 'norm', 'gamma'),
##' parama = c(1, 1, 1, 1),
##' paramb = c(2, 2, 2, 2))
##' r2bugs.distributions(priors)