似然比和贝叶斯模型比较是否可以为零假设检验提供更好且足够的替代方案?


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为了回应越来越多的统计学家和研究人员批评将零假设检验(NHT)用于科学作为一种累积努力的做法,美国心理学会统计推断工作组避免了彻底禁止NHT的禁令,而是建议研究人员除了从NHT导出的p值外,还报告效果大小。

但是,效果大小在整个研究中不容易累积。元分析方法可以累积效应量的分布,但是效应量通常以原始效应量与给定实验数据中无法解释的“噪声”之比来计算,这意味着效应量的分布不仅受各个研究之间的原始效果差异很大,而且各个研究之间的噪音表现也存在差异。

相比之下,效应强度的替代度量,似然比既可以在逐项研究的基础上进行直观的解释,又可以轻松地在各个研究中汇总以进行荟萃分析。在每项研究中,似然度代表包含给定效果的模型相对于不包含效果的模型的证据权重,通常可以报告为例如“计算X效果的似然比”揭示了该效应的证据是其无效证据的8倍。” 此外,似然比还允许直观表示无效结果的强度,因为低于1的似然比表示赞成采用无效的情况,取该值的倒数表示无效对效果的证据权重。值得注意的是 似然比在数学上表示为两个模型的无法解释的方差之比,其差异仅在于效应所解释的方差,因此在概念上与效应大小没有太大的偏差。另一方面,荟萃分析似然比的计算代表了整个研究中某项效应的证据权重,这仅仅是取各个研究中似然比的乘积即可。

因此,我认为,对于寻求建立有利于效应/模型的总体证据程度的科学而言,似然比是可行的方法。

在更细微的情况下,模型仅在效果的特定大小上才是可区分的,在这种情况下,我们认为区间的某种表示形式(我们认为数据与效果参数值一致)可能是首选的。确实,APA工作组还建议报告置信区间,可以将其用于此目的,但是我怀疑这也是一种考虑不周的方法。

令人遗憾的是,置信区间经常被误解(被学生和研究人员都误解)。我还担心它们在NHT中的使用能力(通过评估CI中是否包含零)将只会进一步推论NHT的灭绝。

相反,当理论只能通过效应的大小来区分时,我建议贝叶斯方法会更合适,因为每种效应的先验分布由每个模型分别定义,然后比较所得的后验分布。

这种方法用似然比替换p值,影响大小和置信区间,并且在必要时用贝叶斯模型比较是否似乎足够?是否错过了此处所针对的替代方案所提供的某些必要的推论功能?


可能是一个更集中的问题?也许是针对特定推理问题的面向可能性的方法?
conjugateprior

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但是,当我们在这里时:在博览会上:您是否混合了通常用参数标识的效果大小的度量,以作为完整模型的比较证据的度量?LR仅看起来像后者的候选人。另外,如果您想单独或组合使用似然函数来告诉您数据试图告诉您有关模型的所有信息,那么您基本上就是贝叶斯。因为那是可能性原则。(来吧,水的可爱的:-)
conjugateprior

您的标题和结论段落似乎不同意是建议使用置信区间还是替换置信区间。
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@onestop:的确,我只是意识到我忘记更改标题了;在写问题时,我改变了对置信区间的看法。我已经编辑了标题。抱歉造成混乱。
Mike Lawrence

@Conjugate Prior:完全同意您的前两个句子。但是,如果您不喜欢先验的概念并且仅根据似然推理就可以接受似然原理而无需贝叶斯原理-请参阅Edwards books.google.com/books?id=2a_XZ-gvct4C和Royall books.google的书籍.com / books?id = oysWLTFaI_gC。尽管有人(我希望我记得谁和在哪里)曾经把这比作打破鸡蛋,但不吃煎蛋。
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Answers:


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贝叶斯方法的主要优势,至少对我来说是心理学研究者而言:

1)让您积累有利于空值的证据

2)规避顺序测试的理论和实践问题

3)不能仅仅因为N大而拒绝拒绝null(请参见上一点)

4)更适用于处理小效果(效果大的情况下,频率方法和贝叶斯方法往往总是一致的)

5)允许以一种可行的方式进行层次建模。例如,在某些模型类(如“多项式处理树”模型)中引入项目和参与者效应将需要在贝叶斯框架中完成,否则计算时间会非常长。

6)让您获得“真实的”置信区间

7)您需要三件事:数据的可能性,先验和概率。第一个是您从数据中获得的,第二个是您的数据,第三个是您根本不需要的比例。好吧,也许我有点夸张了;-)

总体而言,您可能会提出一个问题:这是否意味着经典的常客统计数据还不够?我认为说“不”太苛刻了。如果人们超越p值并关注诸如效应大小,项目效应的可能性以及一贯重复的发现(出版了太多的单实验论文!),则大多数问题都可以避免。

但是贝叶斯并不是一切都那么容易。以非嵌套模型为例进行模型选择。在这些情况下,先验是非常重要的,因为它们会极大地影响结果,有时您对想要使用的大多数模型都没有太多的知识,无法正确使用先验。另外,要花很长时间。

对于可能对贝叶斯感兴趣的任何人,我都会留下两个参考。

Lee和Wagenmakers的“认知科学的贝叶斯图形建模课程”

Ntzoufras的“使用WinBUGS进行贝叶斯建模”

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