什么测试可以比较社区组成？

希望这个新手问题是该网站的正确问题：

假设我想比较两个地点A，B的生态群落组成。我知道这三个地点都有狗，猫，牛和鸟，因此我在每个地点都采样了它们的丰度（我实际上没有“每个位置的每个动物的预期“数量”）。

如果我算一下，每个位置的每只动物有五只，那么A和B非常“相似”（实际上，它们是“相同”）。

但是，如果我在A站点发现100条狗，5只猫，2头牛和3只鸟。在B站点发现5条狗，3只猫，75头牛和2只鸟。那么我会说A和B站点“不同” ，即使它们具有完全相同的物种组成。

（我阅读了Sorensen's和Bray-Curtis指数，但看起来他们只考虑狗，猫等的不在/在场，而不考虑它们的丰度。）

是否有统计检验确定这一点？

我将同意已经提到的Bray-Curtis可以处理丰度以及存在/不存在的内容，也可以添加另一本好书：McCune和Grace撰写的《生态社区分析》。

在比较生态群落时，有很多因素需要考虑，我认为没有一项单一的测试可以完成这项工作。测试的适当性在很大程度上取决于您要询问的关于社区和数据集性质的问题类型。常见的方法包括协调技术，该技术在多维分类群空间内排列站点。但是，如果您确实只有2个站点，那么这不太可能。壁炉架测试将基于成分的距离矩阵（例如，跨所有站点的成对Bray-Curtis距离）与基于其他潜在影响因素的距离矩阵相关联。最简单的情况就是空间中各个位置之间的欧式距离。聚类分析根据站点的社区组成对站点进行分组。

总的来说，我会采用上面任何一本书中描述的许多统计工具的子集的方法，以提供有关所讨论社区之间差异的统计描述。社区组成没有差异的单一度量，因此使用统计数据将多维数据合成为更易于解释的形式。

编辑：我也只是想到了这篇论文，它清楚，彻底地列出了许多不同的选择。

安德森，MJ等。2011年。浏览Beta多样性的多重含义：实践生态学家的路线图。生态快报14：19-28

如果要测试此假设，可以使用“相似性分析”（基于Bray Curtis或其他可用方法），在PRIMER软件中有一个名为ANOSIM wich的过程。您可以执行单向，嵌套或双向分析。另一个（更好）的选择是对方差进行多重排列分析，常规的PERMANOVA（可从http://www.stat.auckland.ac.nz/~mja/Programs.htm获取）中提供了一个很好的程序。对站点之间的显着差异进行测试，您可以进行后续操作，以了解对所观察到的差异负责的物种（IndVal例程或SIMPER例程）。希望能帮助到你

由于您提到了Sorensen索引，因此似乎您需要一个差异评分而不是一个差异测试。（分数将给出一个数值，表明它们之间的差异。测试将告诉您差异在给定的概率下是否显着。）

您可以通过直方图表示每个位置的物种丰度。如果您只是在乎相对丰度（例如，猫的数量是狗的两倍），则可以对直方图进行归一化；如果您在乎绝对数字，则可以将其不归一化。

有很多方法可以测量直方图的不相似性。一些受欢迎的是：

• 卡方统计
• L2距离
• 直方图相交距离

Bray-Curtis和其他类似指标的确包含了物种丰度的差异。除了勒让德和勒让德，我还要推荐查尔斯·克雷布斯的著作《生态方法论》（1999）。