Questions tagged «dendrogram»

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在哪里切割树状图?
层次聚类可以用树状图表示。在一定水平上切割树状图可得到一组簇。切割到另一个级别将提供另一组群集。您将如何选择在哪里切割树状图?有什么可以考虑的最佳点吗?如果我查看随时间变化的树状图,是否应该在同一时间剪切?

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比较通过不同距离和方法获得的分层聚类树状图
[最初的标题“用于层次聚类树的相似性的度量”后来被@ttnphns更改,以更好地反映该主题] 我正在对患者记录的数据帧执行许多层次的聚类分析(例如,类似于http://www.biomedcentral.com/1471-2105/5/126/figure/F1?highres=y) 我正在尝试不同的距离度量,不同的参数权重和不同的层级方法,以了解它们对树的最终聚类/结构/视图(树状图)的影响。我的问题是,是否存在用于计算不同层次树之间的差异的标准计算/度量,以及如何在R中实现这一点(例如,量化一些树几乎相同,而有些树则完全不同)。

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如何解释层次聚类分析的树状图
考虑下面的R示例: plot( hclust(dist(USArrests), "ave") ) y轴的“高度”到底是什么意思? 查看北卡罗来纳州和加利福尼亚州(位于左侧)。加利福尼亚在北卡罗来纳州比在亚利桑那州“更近”吗?我可以做出这种解释吗? 夏威夷(右)加入集群很晚。我可以看到它,因为它比其他州“更高”。通常,我如何正确解释树状图中标签“较高”或“较低”的事实?

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