Questions tagged «growth-model»

令人惊讶的是，我无法使用Google找到以下问题的答案： 我有一些个体的生物学数据，这些数据显示了乙状结肠的及时生长行为。因此，我希望使用标准的物流增长对其进行建模 P(t) = k*p0*exp(r*t) / (k+p0*(exp(r*t)-1)) 其中p0是t = 0处的起始值，k是t-> infinity处的渐近极限，r是生长速度。据我所知，我可以使用nls对此模型轻松地建模（我缺乏理解：为什么我不能通过缩放时间和数据来使用标准logit回归建模类似的东西？感谢：Nick，显然人们这样做了，例如比例，但很少见http://www.stata-journal.com/article.html?article=st0147。关于此切线的下一个问题是模型是否可以处理> 1的离群值。 现在，我希望允许对三个参数k，p0和r进行固定（主要是分类）和随机（单个ID，还可能是研究ID）影响。nlme是这样做的最好方法吗？SSlogis模型对于我想做的事情似乎很明智，这是正确的吗？以下任一个是明智的模型吗？我似乎无法正确设置起始值，并且update（）仅适用于随机效果，而不适用于固定效果-有任何提示吗？ nlme(y ~ k*p0*exp(r*t) / (k+p0*(exp(r*t)-1)), ## not working at all (bad numerical properties?) data = data, fixed = k + p0 + r ~ var1 + var2, random = k + p0 + r ~ 1|UID, start …

14 r  nonlinear-regression  mixed-model  growth-model 

我必须为非负数，连续数和非负数的健康变量创建5至15岁（仅5,6,7等；没有2.6年这样的分数）的图表（类似于生长图表）。 50-150的范围（只有少数几个值不在此范围内）。我必须创建第90、95和99个百分位曲线，并为这些百分位创建表。样本大小约为8000。 我检查并发现以下可能的方法： 找到分位数，然后使用黄土法从这些分位数中获得平滑曲线。可以通过“ span”参数调整平滑度。 使用LMS（Lambda-Mu-Sigma）方法（例如，在R中使用gamlss或VGAM软件包）。 使用分位数回归。 使用每个年龄组的平均值和SD来估算该年龄段的百分位数，并创建百分位数曲线。 最好的方法是什么？“最好”是指理想的方法，它是创建此类增长曲线的标准方法，并且将为所有人所接受。或者是一种更容易实现的方法，它可能会有一些限制，但是是可以接受的，更快的方法。（例如，对百分比值使用黄土比使用gamlss软件包的LMS快得多）。 同样，该方法的基本R代码将是什么。 谢谢你的帮助。

10 ordinal-data  quantiles  regression-strategies  generalized-least-squares  growth-model