混合连续变量和二进制变量的t-SNE
我目前正在研究使用t-SNE进行高维数据的可视化。我有一些包含二进制和连续变量混合的数据,并且数据似乎很容易将二进制数据聚类。当然,这是按比例缩放(介于0和1之间)数据的预期:二进制变量之间的Euclidian距离将始终最大/最小。如何使用t-SNE处理混合的二进制/连续数据集?我们应该删除二进制列吗?它有一个不同的metric,我们可以使用? 作为示例,请考虑以下python代码: x1 = np.random.rand(200) x2 = np.random.rand(200) x3 = np.r_[np.ones(100), np.zeros(100)] X = np.c_[x1, x2, x3] # plot of the original data plt.scatter(x1, x2, c=x3) # … format graph 所以我的原始数据是: 其中颜色是第三个特征(x3)的值-在3D中,数据点位于两个平面(x3 = 0平面和x3 = 1平面)中。 然后,我执行t-SNE: tsne = TSNE() # sci-kit learn implementation X_transformed = StandardScaler().fit_transform(X) tsne = TSNE(n_components=2, …