从事本白皮书已有数周的时间，并且在网上找到的所有链接和参考资料的时间非常艰难，最终使它们井井有条，但这是一个非常手动的过程，是否有任何软件可以：

1）对链接和参考页进行组织，排序和加书签，并提供一键式访问权限

2）根据您已经链接的内容自动生成书目

3）为您提供研究论文版式的模板

4）索引的模板和示例

PS：需要用于Windows XP的软件，它可以是付费软件

你看过Lyx吗？

LyX是一种文档处理器，它鼓励您基于文档的结构（WYSIWYM）而不是仅仅基于外观（WYSIWYG）进行书写。

如果您将其与JabRef这样的优质bibtex前端结合使用，那么您将获得双赢。

让我们一一处理您的请求：

对链接和参考页面进行组织，排序和加书签，并提供一键式访问权限

JabRef可以让您输入，分类和组织书目条目，因此做得很棒。

根据您已链接的内容自动生成书目

这是Lyx的一个好方法。只需包含JabRef管理的书目文件并开始引用它即可。添加书目条目，它将自动生成。

为您提供研究论文布局模板

基于Latex的Lyx具有多种格式，适用于各种期刊和机构。

索引模板和示例

添加索引条目后，索引将自动进行管理。

Endnote对此非常有用。

如果使用Firefox，则Zotero是一个很好的扩展。我曾将它用于Chicago / Turabian的论文，尽管当时还没有参考书目。请点击这里，查看是否支持你的。

我相信Mendeley可以满足您的许多要求。

您是否尝试过Microsoft Onenote来跟踪所有链接和片段以及屏幕剪辑等？ 强烈建议，这太棒了！

Flamory提供无干扰的书签。只需按一下热键，它就可以保存选择，屏幕快照以及在文档中的位置。

我使用OneNote已有很长时间了，但是对我来说，最困难的部分是在制作了数百个书签之后找到所需的书签。有了Flamory，一切都会变得更好，因为我可以快速滚动查看缩略图，甚至可以按加书签的文档的内容进行搜索。