两个驱动器上的系统分区

我有一台带有两个驱动器的机器，一个紧凑型闪存卡（CF）和一个固态硬盘（SSD）。最近我遇到了SSD和CF的故障。

当我将这些发送回制造商进行分析时，他们报告说SSD和CD是健康的 - 但是看起来分区表已经损坏了。

使用Kickstart我创建了我的Linux文件系统，分区通过CF（用于保存操作系统），再加上SSD（用于保存我的数据）：

/ on the CF
/boot on the CF
/usr  on the CF
/home on the SSD

Unix是否会出现使用CF启动和运行操作系统以及使用SSD存储文件的问题？

有没有人遇到过这类问题？