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申根签证适用于整个地区。原则上，如果您被禁止从一个申根国家入境，则应从整个地区禁止您入境，但是拒绝签证并非禁令。相反，瑞士不能授予仅对瑞士有效的签证（在某些非常特殊的情况之外），但应决定是否可以信任您进入整个地区。因此，正式地，向瑞士领事馆提出的申请与向德国领事馆提出的新申请没有什么不同。每个领事馆都会考虑以前的拒绝，并应根据相同的规则决定是否批准签证。
但不要忘记，签证是针对特定旅行和特定目的而签发的。如果您向瑞士提出申请（大概提交了行程，也许是邀请函等）并完全出现在其他地方，则边境警卫人员可能会产生怀疑。如果您是专门为避开德国领事馆的决定而申请瑞士签证的，那么您将犯有欺诈罪，并且可能会看到您的签证被废除（或者这次甚至得到适当的禁令）。
而且，即使瑞士签发了您的签证，德国边防军当然也有权检查所有情况。如果您几次因来自另一个国家的签证被拒签后出现，他们可能也会比平时更具好奇心。因此，在过境时，您需要格外小心，遵守行程，并掌握所有文件（机票，预订，邀请函，有关旅行目的，职业的任何信息）。
另一方面，此过程没有自动的过程。如果瑞士确实是您的主要目的地，而您只想在德国机场过境（因此首先进入德国），那应该不是问题。
有效的申根签证可合法使您尝试进入任何申根协定成员国（包括德国）。这并不意味着德国（或任何其他）边境探员必须准予您入境-他们可能会出于多种原因质疑甚至拒绝您，但是持有有效签证似乎不太可能，除非您在某些监视名单上。这不是法律建议，但如果受到质疑，我想拥有在瑞士继续旅行或住宿的证明可能会有所帮助。
但是，如果您持有瑞士国家签证（非申根签证），则该签证可能不适用于德国。查看签证上的第一条“有效期”行，看看它是显示“申根州”还是仅显示“瑞士”。