Ubuntu Xenial（16.04）的R 3.5.0安装包在ubuntu镜像站点上尚不存在。是否有其他方法可以将ubuntu xenial上的R更新到3.5.0？另外，是否有其他方法可以将R更新到3.5.0？

R 3.5当前仅可从PPA获得，因为某些CRAN软件包在使用R 3.5编译时存在问题。

继续需要您自担风险。

对我有用的过程是：

1. r-cran-*从您的系统中删除所有软件包（YMMV，我通常是从源代码安装软件包，而这些软件包很少）

   • 搜索 dpkg -l | grep r-cran-

2. 添加Michael Rutter的PPA：

   sudo add-apt-repository ppa:marutter/rrutter3.5
   sudo apt-get update
   

3. 升级R

   sudo apt install r-api-3.5
   

4. 从源（通过到个人或站点库install.packages()）或通过安装相应的r-cran-*Ubuntu软件包来安装所需的所有软件包。

   我使用以下脚本从R 3.4的个人站点库中重新安装所有软件包：

   installed <- rownames(installed.packages())
   pkgs <- dir("~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.4")
   new <- setdiff(pkgs, installed)
   new
   install.packages(new)

   如果您的计算机具有多个CPU，则可以加快处理速度，例如：

   install.packages(new, Ncpus = 6)
   

参考文献

• Dirk Eddelbuettel回复了有关R-SIG-Debian邮件列表的类似询问

• 相关的SO问题

自6月初@krlmlr的回复以来，CRAN站点已更新：https ://cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/ 。

CRAN指令具有多个步骤，但摘要是sources.list文件应引用特定于版本3.5.x和3.6.x的存储库。条目类似于

deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu xenial-cran35/

而不是之前的（无版本）条目

deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu xenial/

网站上的相关描述（最终将更改）：

在i386和amd64上适用于Ubuntu的R 3.6软件包可用于大多数稳定的Ubuntu桌面发行版，直到正式终止使用。但是，仅完全支持最新的长期支持（LTS）版本。截至2018年11月18日，受支持的版本是Xenial Xerus（16.04; LTS），Trusty Tahr（14.04; LTS），Bionic Beaver（18.04; LTS），Cosmic Cuttlefish（18.10）和Disco Dingo（19.04）。注意，要安装R 3.6软件包，需要使用不同的sources.list条目。有关详情，请参见下文。即使R已移至3.6版，出于兼容性考虑，sources.list条目仍使用cran3.5名称。

编辑2019-05-13：更新了上个月发布的R 3.6.0。

该xenial-cran35/回购协议的版本不工作，如果你有一个容易“默认版本”组，这在一些发行版的情况是在Ubuntu之上，如薄荷工作。对于我的Mint发行版，存在一个文件/etc/apt/apt.conf.d/01ubuntu，其中声明了Default-Release "xenial"; 。这意味着，由于r-base存在于版本为“ xenial”的版本3.2的ubuntu存储库中，因此它将永远不会使用其他回购，因为该回购的发行版名称是“ xenial-cran35”。您需要编辑该文件，以将默认发行版更改为“ xenail-cran35”，或者使用apt首选项文件（https://wiki.debian.org/AptPreferences#A.2Fetc.2Fapt.2Fpreferences）进行。

基本上，这是R的错误，因为它具有格式错误的存储库。他们应该有2个存储库，每个存储库都有一个“ xenial”发布文件夹，一个URL用于其3.2分支工作，一个URL用于3.5+分支工作。取而代之的是，它们有一个存储库，并且混用了“发行名称”，这恰好适用于基本Ubuntu，但是如果您以这种方式具有apt的非基本配置，则不会起作用。

当前需要这样做：

sudo apt purge r-base* r-recommended r-cran-*
sudo apt autoremove
sudo add-apt-repository 'deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran35/'
sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
sudo apt update
sudo apt install r-base-dev

'bionic'可以更改为您的ubuntu版本；检查R文档：https : //cran.r-project.org/bin/linux/ubuntu/

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