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除了fluteflute提到最终用户的主要区别的链接外，chkdsk仅检查Windows支持的文件系统，其中Fat32和NTFS是主要的文件系统。
fsck检查，Fat32，NTFS（通过ntfs-3g），ext2，ext3，ext4，reiser，xfs以及大量其他文件。做一个man fsck西港岛线给你的细节。但是事实是fsck实际上将使用另一个程序根据要检查的文件系统运行检查，因此，例如，如果文件系统是ext4，则它将使用fsck.ext4，如果文件系统是btrfs，则它将使用fsck.btrfs。
因此，基本上chkdsk是针对ntfs进行限制和优化的，而fsck不仅向多个文件系统开放，而且在相同的时间范围内，它所获得的优化和功能远胜于Windows同行。因此，它会根据实际文件系统，检测到的错误，文件系统上的标志以及系统上处于活动状态的其他属性，对文件系统进行快速检查和深度检查。
涉及NTFS文件系统时，看起来像chkdsk的工具是ntfs-3g的一些工具集合，在某些情况下，它们超过了chkdsk（甚至包括scandisk）的功能，例如：
ntfsfix - Forces Windows to check NTFS at boot time
ntfsresize - Resize an NTFS volume
ntfsundelete - Find files that have been deleted and recover them
ntfsdefrag - Defragment files, directories and the MFT
ntfsck - Perform consistency checks on a volume
这提供了一些进行软件恢复，维护和修复的新方法。例如，在出现Windows系统无法加载的问题的情况下，您可以加载Ubuntu，并使用分区/磁盘上的快速fsck / ntfs-3g修复某些问题。或取消删除某些内容，进行碎片整理等。为您提供一些解决其他问题的方法。