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有几个参数：
这基本上是对的。例如，如果您python-django按原样安装，则可以获得安全更新。这很好，因为您只需要掌握apt的技巧，但仍然需要在推送更新之前进行测试（尽管每次测试应该可以进行）。
您可能会争辩说，如果使用pip，则可能永远不会检查更新。
pip以便您可以使用适当的“稳定”版本。毫无疑问：仓库落后于现实世界。Django是2.0，但是LTS版本的Ubuntu（很多人坚持使用服务器）的存储库在使用Python 2的Ubuntu 16.4 lts上只能得到1.8，但仍然可以得到安全更新。
pip始终为您提供最新信息。您只需要自己更新即可。
当您将Ubuntu发行版升级到下一个版本时，它会升级许多软件包。很多事情都会改变。我知道在Django中，这意味着您必须当心代码不兼容，不赞成使用的情况，但是对于所有其他Python代码也是如此。
同样的道理，pip但pip您一次只能做一件事。您知道导致问题的原因，所以您知道在哪里可以找到此修复程序。
pip+ virtualenv让您保持独立virtualenv让您拥有可移植的小型Python环境。这使您可以在同一台计算机上同时运行多个不同的Python环境。
显而易见的好处似乎是为了维护，因为您可以以与管理代码相同的方式来管理环境。甚至也将环境存储在VCS中... 但是您应该记住，拥有十二个不同的virtualenvs意味着您需要检查和更新十二个环境。
编辑：在服务器上进行了一系列可怕的升级以使其从Lucid升级到Precise之后，我从混合Apt + pip（nr 1和2）切换到纯pip + virtualenv（nr.4）的情况。我没有在每个站点上使用一个virtualenv，而是在十几个站点之间共享一个。目前正在工作。
我还必须编写一个小脚本来检查pip安装的软件包的状态。如果有更新，我必须手动应用它们（这很好，因为我在本地virtualenv中本地测试了它们）。这一切都比最初要痛苦的多，但从长远来看要好得多。
存储库中的软件包
只要您的应用程序特定于Ubuntu，就应该安装它们。它们保证您可以在Ubuntu计算机上安装的稳定版本，受支持，并且有时比通过pip获得的版本更成熟。如果部署了一堆ubuntu服务器，或者正在编写Ubuntu应用程序，请使用这些服务器（如果有）。
它们有时还包含特定于Ubuntu的修改。
pip vs easy_install
正如Django黑客James Bennett所说的，关于这些，没有太多要说的：
请，出于对Guido的热爱，请停止使用setuptools和easy_install，而改用distutils和pip。
有关分歧进行了深入的讨论，请参见包装上的由詹姆斯·贝内特（Django的）和几个更正“包装上的”伊恩Bicking（Mozilla浏览器中）。
如果您想安全起见，请使用virtualenv尝试进行pip部署。这为您提供了一个隔离的python环境，因此您可以确保您的应用程序可以在任何计算机上运行。
不过请稍等，我相信有些人会不同意我的看法。