如何将列表中每个文件的内容复制到另一个文件中？

我在名为的文件中有一个文件名列表list_of_files.txt。

我想将该列表中每个文件的内容复制到另一个名为的文件中all_compounds.sdf。

我应该如何从命令行执行此操作？

不要使用简单的命令替换来获取文件名（文件名很容易用空格和其他特殊字符破坏）。使用类似xargs：

xargs -d '\n' -a list_of_files.txt cat > all_compounds.sdf

或while read循环：

while IFS= read -r file; do cat "$file"; done < list_of_files.txt > all_compounds.sdf

为了安全地使用命令替换，至少将其设置IFS为换行符并禁用globbing（通配符扩展）：

(set -f; IFS=$'\n'; cat $(cat list_of_files.txt) > all_compounds.sdf)

圆括号()将在子外壳程序中运行，以便您当前的外壳程序不受这些更改的影响。

快速而肮脏的方式...

cat $(cat list_of_files.txt) >> all_compounds.sdf

请注意：这仅在列表中的文件名表现良好时才有效-如果它们中包含空格，换行符或任何对Shell具有特殊含义的字符，则会出错-请使用此答案以获得可靠的结果）

笔记

• catCON 猫 enates文件。它还会打印其内容。
• 使用命令替换，command2 $(command1)您可以将command1（cat list...）的输出传递给command2（cat），以连接文件。

• 然后使用重定向>>将输出发送到文件，而不是打印到stdout。如果要查看输出，请tee改用：

  cat $(cat list_of_files.txt) | tee -a all_compounds.sdf

（如果您的文件已经存在，我将使用>>代替该开关，>并将其tee与该-a开关一起使用-如果该文件已经存在，它将附加到文件中而不是覆盖它）

尽管GNU awk是文本处理实用程序，但它允许通过system()调用运行外部Shell命令。我们可以这样利用我们的优势：

$ awk '{cmd=sprintf("cat \"%s\"",$0); system(cmd)}' file_list.txt                                                        

这里的想法很简单：我们逐行读取文件，然后从每一行中创建格式化的字符串cat "File name.txt"，然后将其传递给system()。

它在起作用：

$ ls
file1.txt  file2.txt  file3 with space.txt  file_list.txt


$ awk '{cmd=sprintf("cat \"%s\"",$0); system(cmd)}' file_list.txt                                                        
Hi, I'm file2
Hi, I'm file1
Hi, I'm file3

因此，我们已经完成了大部分任务-将所有文件打印在列表上。剩下的很简单：将最终的输出重定向到带有>操作符的文件到摘要文件中。

awk '{cmd=sprintf("cat \"%s\"",$0); system(cmd)}' file_list.txt > output.txt