我正在尝试rpy2在Ubuntu 16.04上使用pip install 安装python软件包：

pip install rpy2==2.2.7

但收到错误消息（请参见下面的完整输出）：

Command "python setup.py egg_info" failed with error code 1 in /tmp/pip-build-EuOI6K/unroll/

其他软件包（例如pip install unroll或使用）也会发生相同的情况pip2。我以为这篇文章是同样的问题，但是通过使用sudo可以解决。

解决方案尝试

我试图解决这个岗位，如：pip install --upgrade setuptools，(sudo) easy_install -U setuptools或sudo apt-get install python-setuptools，但无济于事。

python / pip信息

有人建议我可能安装了怪异的python / pip，以下是一些信息：

sudo which python pip pip2 | xargs -rd '\n' readlink -f 
/usr/bin/python2.7   
/usr/local/bin/pip  
/usr/local/bin/pip2  

sudo python --version   
Python 2.7.12  

sudo pip --version  
pip 9.0.1 from /home/matifou/.local/lib/python2.7/site-packages (python 2.7)  
/usr/bin/pip2 --version  
pip 8.1.1 from /usr/lib/python2.7/dist-packages (python 2.7)

ls -l $(which pip); dpkg -S /usr/bin/pip
-rwxr-xr-x 1 root root 204 Nov  8 16:24 /usr/local/bin/pip
python-pip: /usr/bin/pip

全错误输出

点安装rpy2 == 2.2.7  
使用缓存的rpy2-2.2.7.ta​​r.gz收集rpy2 == 2.2.7  
    来自命令python setup.py egg_info的完整输出：
    运行egg_info
    创建pip-egg-info / rpy2.egg-info
    编写pip-egg-info / rpy2.egg-info / PKG-INFO
    将顶级名称写入pip-egg-info / rpy2.egg-info / top_level.txt
    将dependency_links写入pip-egg-info / rpy2.egg-info / dependency_links.txt
    编写清单文件“ pip-egg-info / rpy2.egg-info / SOURCES.txt”
    追溯（最近一次通话）：
      文件“”，第1行，位于 
      文件“ /tmp/pip-build-EkrbmM/rpy2/setup.py”，行462，在 
        [os.path.join（'doc'，'source'，'rpy2_logo.png'）]））]，
      安装程序中的文件“ /usr/lib/python2.7/distutils/core.py”，第151行
        dist.run_commands（）
      在run_commands中的文件“ /usr/lib/python2.7/distutils/dist.py”，第953行
        self.run_command（cmd）
      在run_command中的文件“ /usr/lib/python2.7/distutils/dist.py”，第972行
        cmd_obj.run（）
      文件“ /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/setuptools/command/egg_info.py”，
280行，运行中
        self.find_sources（）
      文件“ /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/setuptools/command/egg_info.py”，
在find_sources中的第295行
        mm.run（）
      文件“ /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/setuptools/command/egg_info.py”，
526行
        self.add_defaults（）
      文件“ /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/setuptools/command/egg_info.py”，
第562行，位于add_defaults中
        sdist.add_defaults（）
      文件“ /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/setuptools/command/py36compat.py”，
第36行，在add_defaults中
        self._add_defaults_ext（）
      文件“ /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/setuptools/command/py36compat.py”，
第119行，在_add_defaults_ext中
        build_ext = self.get_finalized_command（'build_ext'）
      get_finalized_command中的文件“ /usr/lib/python2.7/distutils/cmd.py”，第312行
        cmd_obj.ensure_finalized（）
      在sure_finalized中的文件“ /usr/lib/python2.7/distutils/cmd.py”，第109行
        self.finalize_options（）
      在finalize_options中，文件“ /tmp/pip-build-EkrbmM/rpy2/setup.py”，第155行
        config + = get_rconfig（r_home，关于）
      get_rconfig中的第319行的文件“ /tmp/pip-build-EkrbmM/rpy2/setup.py”
        rc = RConfig.from_string（rconfig，allow_empty = allow_empty）
      文件“ /tmp/pip-build-EkrbmM/rpy2/setup.py”，第279行，位于from_string中
        +'\ nin字符串\ n'+字符串）
    ValueError：无效的子字符串
    -fopenmp
    在字符串中
    -Wl，-export-dynamic -fopenmp -Wl，-Bsymbolic函数-Wl，-z，relro -L / usr / lib / R / lib -lR -lpcre -llzma -lbz2 -lz -lrt -ldl -lm

命令“ python setup.py egg_info”在/ tmp / pip-build-EkrbmM / rpy2 /中失败，错误代码为1

pip安装展开
使用缓存的unroll-0.1.0.tar.gz收集展开
    来自命令python setup.py egg_info的完整输出：
    正在下载http://pypi.python.org/packages/source/d/distribute/distribute-0.6.14.tar.gz
    追溯（最近一次通话）：
      文件“”，第1行，位于 
      在第2行的文件“ /tmp/pip-build-QimGjp/unroll/setup.py” 
        ez_setup.use_setuptools（）
      use_setuptools中的文件“ /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/ez_setup.py”，第145行
        返回_do_download（版本，download_base，to_dir，download_delay）
      _do_download中的文件“ /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/ez_setup.py”，第124行
        to_dir，download_delay）
      在download_setuptools中的文件“ /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/ez_setup.py”，第193行
        src = urlopen（URL）
      urlopen中的文件“ /usr/lib/python2.7/urllib2.py”，第154行
        返回opener.open（URL，数据，超时）
      打开文件“ /usr/lib/python2.7/urllib2.py”，行435
        响应= meth（req，响应）
      http_response中的文件“ /usr/lib/python2.7/urllib2.py”，第548行
        'http'，请求，响应，代码，msg，hdr）
      文件“ /usr/lib/python2.7/urllib2.py”，第473行，错误
        返回self._call_chain（* args）
      _call_chain中的第407行的文件“ /usr/lib/python2.7/urllib2.py”
        结果= func（* args）
      http_error_default中的文件“ /usr/lib/python2.7/urllib2.py”，第556行
        引发HTTPError（req.get_full_url（），code，msg，hdrs，fp）
    urllib2.HTTPError：HTTP错误403：需要SSL

tmp / pip-中的命令“ python setup.py egg_info”失败，错误代码为1
build-QimGjp /展开/

升级setuptools使用pip

python-setuptoolsUbuntu 16.04 LTS软件包存储库中的版本已过期/未维护。 升级pip而不依赖于包管理器：

$ sudo pip install --upgrade setuptools

解决方案我提出了自己的问题：提出的答案不能解决问题，所以我最终使用conda，为所需的软件包创建了一个特定的环境，并且可行！这不是最好的解决方案，特别是因为它需要安装并行版本（您可以使用miniconda占用空间），但是它是一个实用的解决方案！

更新setuptools无法解决我的问题。但是，告诉pip自己进行升级。

以下命令解决了我的问题（来自此答案）

pip install --upgrade pip

您需要获取设置工具，可能需要在开发模块中输入以下内容

sudo apt-get install python-setuptools
sudo apt-get install python-dev

可能需要先升级pip以确保除了平稳运行外没有其他事情，这可以通过键入以下内容来完成

sudo apt install python-pip

祝好运