暂停bash脚本，直到完成先前的命令

我有一个bash脚本，如下所示：

##script
#!/bin/bash
rm data*
rm logfile*
for i in {1..30}
do
## append a & if you want to run it parallel;
nohup Rscript --vanilla main.R 10 100 $i &> logfile"$i" &
done

我想在第一个循环之后创建另一个for循环，再继续执行30个循环。例如

##script
#!/bin/bash
rm data*
rm logfile*
for i in {1..30}
do
## append a & if you want to run it parallel;
nohup Rscript --vanilla main.R 10 100 $i &> logfile"$i" &

for i in {31..60}
do
## append a & if you want to run it parallel;
nohup Rscript --vanilla main.R 10 100 $i &> logfile"$i" &
done

我希望在开始新作业之前先完成第一组作业。但是由于这个原因，nohup它们似乎都是同时运行的。

我有，nohup因为我远程登录到服务器并在那里启动作业，然后关闭我的bash。有替代解决方案吗？

您将需要使用wait命令为您执行此操作。您可以捕获所有子进程ID，然后专门等待它们，或者如果它们是脚本正在创建的唯一后台进程，则可以wait不带参数地调用。例如：

#!/bin/bash
# run two processes in the background and wait for them to finish

nohup sleep 3 &
nohup sleep 10 &

echo "This will wait until both are done"
date
wait
date
echo "Done"

几点：

• 如果您的目标nohup是防止远程Shell退出杀死您的工作进程，则应nohup在脚本本身而不是在其创建的单个工作进程上使用。

• 正如解释在这里，nohup只是阻止过程从接收SIGHUP并从与终端交互，但它不破壳及其子进程之间的关系。

• 由于上面的要点，无论有无nohup，wait两个for循环之间的简单交互将导致for仅在第一个循环启动的所有子进程for都退出后才执行第二个循环。

• 用一个简单的wait：

  等待所有当前活动的子进程，返回状态为零。

• 如果for仅在第一个没有错误的情况下才需要运行第二个，则需要使用来保存每个工作进程PID $!并将它们全部传递给wait：

  pids=
  for ...
      worker ... &
      pids+=" $!"
  done
  wait $pids || { echo "there were errors" >&2; exit 1; }

使用fg内置的。等待直到后台进程完成。

尝试help fg获取详细信息。

如果在两个for循环之间插入类似以下代码段的内容，则可能会有所帮助。

flag=0

while [ flag -eq 0 ]
do
  ps -ef | grep "Rscript --vanilla" | grep -v grep > /dev/null
  flag=${?}
  sleep 10
done

当然，如果您的应用程序Rscript有可能无法成功完成并徘徊，那么您的第二个for循环可能没有运行的机会。上面的代码段假定，带有标识符的所有过程Rscript --vanilla将正确完成并消失。在不知道您的应用程序做什么以及如何运行的情况下，我不得不依靠这个假设。

编辑

根据评论，这将更好地满足您的需求。（它包括您的原始代码以及完成检查逻辑）

for i in {1..30}
do
## append a & if you want to run it parallel;
nohup Rscript --vanilla main.R 10 100 $i &> logfile"$i" &
pids[$i]=${!}
done

flag=0

while [ flag -eq 0 ] 
do
  for PID in $(echo ${pids[@]})
  do
    flag=1
    ps -ef | grep ${PID} | grep -v grep >/dev/null; r=${?}
    if [ ${r} -eq 0 ]
    then 
      flag=0
    fi
  done
done

for i in {31..60}
do
## append a & if you want to run it parallel;
nohup Rscript --vanilla main.R 10 100 $i &> logfile"$i" &
done